Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits - Publication - Bridge of Knowledge

Search

Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits

Abstract

Inwazyna DraD kodowana przez operon dra posiada strukturę charakterystyczną dla białek podjednostkowych fimbrii typu chaperone-usher. Fold-Ig białka DraD posiada dwie charakterystyczne cechy wyróżniające je z pośród rodziny fimbrialnych białek podjednostkowych: 1) zaburzenie struktury beta-beczki w rejonie szczeliny akceptorowej objawiające się układem wiązań wodorowych głównego łańcucha polipeptydowego oraz 2) nietypowo usytuowany mostek disiarczkowy, który łączy beta nici B I F - lokalizacja obserwowana tylko w podrodzinie DraD-podobnych inwazyn. W celu określenia wpływu unikalnych cech strukturalnych białka DraD na jego stabilność oraz mechanizm denaturacji termicznej przeprowadzone zostały badania DSC oraz FT-IR, które dały następujące wyniki: 1) Białko DraD charakteryzuje się niską stabilnością (standardowa energia Gibbsa 18.4 +/- 1.4 kJ/mol, entalpia denaturacji 131 +/- 25 kJ/mol), która kontrastuje z prawie nieskończoną stabilnością wcześniej opisanego białka fimbrialnego DraE-sc. 2) Białko DraD denaturuje termalnie zgodnie z modelem równowagowym, dwu-stanowym w przeciwieństwie do nieodwracalnej, kontrolowanej kinetycznie denaturacji białka DraE-sc. 3) Specyficzny dla białka DraD mostek disiarczkowy pełni istotną rolę na etapie fałdowania białka, jego efekt stabilizacyjny w dojrzałym białku jest niewielki. Dane opublikowane dotychczas podkreślają unikalne własności biologiczne inwazyny DraD jako fimbrialnego białka podjednostkowego: niezależny od białka chaperone proces fałdowania, niezależny od białka usher transport na powierzchnię komórki oraz możliwość występowania w dwóch formach - jako niezwiązana podjednostka oraz luźno związana podjednostka szczytowa fimbrii. Przedstawiona kalorymetryczna oraz FT-IR analiza stabilności białka DraD w połączeniu z danymi strukturalnymi wskazują, iż białko to charakteryzuje się również unikalnymi własnościami fizykochemicznymi oraz strukturalnymi w kontekście jego przynależności do rodziny białek podjednostkowych układów fimbrialnych.

Citations

  • 2

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 2

    Scopus

Keywords

Details

Category:
Articles
Type:
artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
Published in:
BMC STRUCTURAL BIOLOGY no. 11,
ISSN: 1471-2237
Language:
English
Publication year:
2011
Bibliographic description:
Piątek R., Bruździak P., Zalewska-Piatek B., Wojciechowski M., Namieśnik J., Kur J.: Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits// BMC STRUCTURAL BIOLOGY. -Vol. 11, (2011), s.25-
DOI:
Digital Object Identifier (open in new tab) 10.1186/1472-6807-11-25
Verified by:
Gdańsk University of Technology

seen 100 times

Recommended for you

Meta Tags