Search
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
Abstract
Opracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali w Polsce. Nasze wyniki wykazały, że metoda ITS-PCR jest przydatna do badania filogenetycznych relacji szczepów K. oxytoca , natomiast PCR MP ze względu na wysoki potencjał różnicujący jest użytecznym narzędziem w badaniach epidemiologicznych K. oxytoca. W niniejszej pracy przydatność metody PCR MP testowano na dwóch zestawach szczepów wyizolowanych z jednej jednostki w krótkim okresie czasu. Wyniki wykazały, że metoda PCR MP ma wysoką moc dyskryminującą i może być przydatna do badań epidemiologicznych blisko spokrewnionych szczepów K. oxytoca izolowanych z pojedynczej jednostki w krótkim okresie czasu w celu identyfikacji źródła i dróg rozprzestrzeniania się zakażenia. Zaletą metody PCR MP jest możliwość zastosowania gradientu temperatury denaturacji podczas PCR w celu potwierdzenia wyników genotypowania. Ze względu na te właściwości i wysoką moc dyskryminującą metody PCR MP, co pokazano w pracy dla określenia genetycznego podobieństwa szczepów K. oxytoca, zaproponowano metodę PCR MP jako jedną z najlepszych technik do analizy krótko terminowych epidemii.
Authors (3)
-
Stanisław Kałużewski
Cite as
Full text
- Publication version
- Accepted or Published Version
- License
-
open in new tab
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuł w czasopiśmie indeksowanym TR Master Journal List
- Published in:
-
Polish Journal of Microbiology
no. 58,
pages 247 - 253,
ISSN: 1733-1331 - Language:
- English
- Publication year:
- 2009
- Bibliographic description:
- Stojowska K., Kałużewski S., Krawczyk B.: Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit // Polish Journal of Microbiology. -Vol. 58., nr. nr 3 (2009), s.247-253
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 139 times
Recommended for you
Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period.
- K. Stojowska,
- B. Krawczyk,
- S. Kałużewski
- + 1 authors
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
- B. Krawczyk,
- A. Samet,
- J. Leibner
- + 1 authors
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
- B. Krawczyk,
- J. Leibner,
- A. Samet
- + 1 authors
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
- B. Krawczyk,
- J. Leibner-Ciszak,
- A. Mielech
- + 2 authors