Search
prof. dr hab. inż. Jan Mazerski
Publications
Filters
total: 51
Catalog Publications
Year 2020
-
A strong preference for the TA/TA dinucleotide step discovered for an acridine-based, potent antitumor dsDNA intercalator, C-1305: NMR-driven structural and sequence-specificity studies
PublicationTriazoloacridinone C-1305, a potent antitumor agent recommended for Phase I clinical trials, exhibits high activity towards a wide range of experimental colon carcinomas, in many cases associated with complete tumor regression. C-1305 is a well-established dsDNA intercalator, yet no information on its mode of binding into DNA is available to date. Herein, we present the NMR-driven and MD-refined reconstruction of the 3D structures...
Year 2018
-
Biological responses to environmental contamination. How can metal pollution impact signal honesty in avian species?
PublicationEnvironmental pollution, for example with metals, can significantly affect the ecosystem balance leading to severe changes. Biologically active pigments are relevant for the appearance and condition of birds. Melanin and carotenoid particles are the most frequently deposited pigments in avian integument. They are responsible for the majority of colors of bird plumage. The phenotypic expression can be affected by metal contamination....
-
Svalbard reindeer as an indicator of ecosystem changes in the Arctic terrestrial ecosystem
PublicationOver the years, noticeable effort has been directed towards contaminant determination in multiple biotic samples collected from the inhabitants of the Arctic. Little consideration has been given to polar herbivores, however, especially those from the European parts of the Arctic. To provide a broader perspective, we aimed to decipher trace element concentration in hairs of the key species in the Arctic, namely the Svalbard reindeer...
Year 2017
-
C-1311 (Symadex), a potential anti-cancer drug, intercalates into DNA between A and G moieties. NMR-derived and MD-refined stereostructure of the d(GAGGCCTC) 2 :C-1311 complex
PublicationImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is an antitumor agent which has been recommended for Phase II clinical trials a few years ago. Previously, it was shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms stable intercalation complexes with DNA duplexes. Herein, a NMR-derived stereostructure of d(GAGGCCTC)2:C-1311 complex was reported. The ligand was found locating itself between A and G moieties, forming...
Year 2016
-
Chemometria praktyczna: zinterpretuj wyniki swoich pomiarów
PublicationWbrew swojej nazwie chemometria nie zajmuje się sposobami i teorią wykonywania pomiarów wielkości chemicznych ani nie ogranicza się tylko do chemii, nawet szeroko pojętej. Chemometria jest dziedziną nauki i techniki zajmującą się wydobywaniem użytecznej informacji z wielowymiarowych danych pomiarowych, wykorzystującą metody statystyki i matematyki.Chemometria różni się od statystyki nie tylko charakterem zestawu analizowanych danych,...
-
Intercalation complex of imidazoacridinone C-1311, a potential anticancer drug, with DNA helix d(CGATCG)2: stereostructural studies by 2D NMR spectroscopy.
PublicationImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is a powerful antitumor agent, which successfully made its way through the Phase I clinical trials and has been recommended for Phase II few a years ago. It has been shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms a relatively stable intercalation complex with DNA, yet it has shown no base-sequence specificity while binding to DNA. In this paper, the d(CGATCG)2:C-1311...
Year 2015
-
Comparative molecular modelling of biologically active sterols
PublicationMembrane sterols are targets for a clinically important antifungal agent – amphotericin B. The relatively specific antifungal action of the drug is based on a stronger interaction of amphotericin B with fungal ergosterol than with mammalian cholesterol. Conformational space occupied by six sterols has been defined using the molecular dynamics method to establish if the conformational features correspond to the preferential interaction...
Year 2011
-
Aggregation of imidazoacridinones - spectroscopic and microcalorimetric approach
PublicationImidazoacridinones (IA) belong to a group of polycyclic heteroaromatic antitumor compounds. IA create the aggregated form in water solution. Self-association of substances is a very important phenomenon in many fields of applied chemistry. It is also fundamental model reaction of many kinds of molecular interactions such as the micelle formation of amphiphilic substances and the binding of small organic molecules to macromolecules....
-
Akrydyny jako związki aktywne przeciwnowotworowo = Acridines as antitumor drugs
PublicationAkrydyny należą do grupy policyklicznych związków heteroaromatycznych. Wykazują szeroki zakres aktywności biologicznej obejmujący aktywność przeciwpierwotniakową, przeciwbakteryjną,przeciwwirusową i przeciwnowotworową. Pochodne akrydyny o działaniu przeciwnowotworowym wykazują zróżnicowany mechanizm działania na poziomie molekularnym. Z uzyskanych dotychczas danych wynika, że jednym z podstawowych etapów działania jest tworzenie...
-
Identyfikacja różnych źródeł zmienności widm w spektroskopii bliskiej podczerwieni (NIR)
PublicationSpektroskopia bliskiej podczerwieni (NIR) odgrywa coraz większą rolę w analizie ilościowej i jakościowej. Na intensywność oraz kształt widm ma jednak wpływ wiele czynników nieswoistych takich jak temperatura, wilgotność, grubość i własności optyczne próbki. Celem pracy jest wykazanie wpływu czynników poza strukturalnych na jakość widm.
-
Przeciwnowotworowe działanie akrydyn
PublicationOdkąd wykazano przeciwbakteryjne i przeciwwirusowe właściwości pochodnych akrydyny podjęto wiele prób modyfikacji chemicznej cząsteczki w celu znalezienia pochodnej charakteryzującej się wysoką aktywnością przeciwnowotworową. Wybór akrydyn jako potencjalnych leków przeciwnowotworowych podyktowany był przede wszystkim udowodnioną zdolnością tych związków do oddziaływania z DNA. W terapii przeciwnowotworowej, ze względu na brak istotnych...
-
Rola i dobór wstępnej obróbki surowych widm w analizie jakościowej i ilościowej z wykorzystaniem techniki spektroskopii bliskiej podczerwieni (NIR)
PublicationSpektroskopia bliskiej podczerwieni (NIR) wykorzystuje absorpcję promieniowania elektromagnetycznego w zakresie 12000-4000 cm-1, (780¬2500 nm). Absorpcja NIR pochodzi od nadtonów i drgań kombinacyjnych wiązań C-H, N-H, O-H. Widmo uzyskane techniką NIR jest unikatowym "odciskiem palca" badanej substancji, gdyż zależy zarówno od właściwości fizyko-chemicznych próbki jak i od stanu fazowego oraz postaci krystalicznej jej składników.Widma...
-
Spektroskopia Bliskiej Podczerwieni NIR
PublicationSpektroskopia bliskiej podczerwieni (NIR) odgrywa coraz większą rolę w analizie ilościowej i jakościowej. Zaletami wykorzystywanej techniki NIR są: 1) nieniszczący, nieinwazyjny charakter analizy, 2) brak konieczności przygotowania próbki przed analizą, 3) prostota i szybkość wykonania rutynowej analizy, 4) wysoka czułość, 5) niski koszt, 6) uzyskanie kompleksowego obrazu badanego materiału, 7) zwiększenie bezpieczeństwa pracy...
-
Termodynamika niekowalencyjnego oddziaływania małocząsteczkowych ligandów z dna
PublicationKwasy nukleinowe są jednym z głównych celów biologicznych dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA. Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które...
Year 2010
-
NOWE PODEJSCIE CHEMOMETRYCZNE DO ANALIZY ZESTAWÓW WIDM UV/VIS MIESZANIN DWUSKŁADNIKOWYCH
PublicationW wielu ważnych zagadnieniach z zakresu chemii, biochemii i biofizyki napotykamy problem analizy zestawów widm uzyskanych dla mieszanin dwuskładnikowych. Jeżeli widma obu składników mieszaniny są znane problem sprowadza się do klasycznej kalibracji. W większości zagadnień praktycznych widmo co najmniej jednego ze składników jest nieznane. Prezentowana praca przedstawia propozycję rozwiązania problemu z wykorzystaniem analizy chemometrycznej...
-
Porównanie spektroskopii IR oraz NIR w analizie tożsamościowej surowców kosmetycznych i farmaceutycznych
PublicationTechniki wykorzystujące spektroskopię podczerwieni (IR) i bliskiej podczerwieni (NIR) znalazły szerokie zastosowanie w wielu gałęziach przemysłu takich jak: przemysł spożywczy, farmaceutyczny, petrochemiczny, kosmetyczny, rolniczy. Spektroskopia podczerwieni wykorzystywana jest zarówno w analizie jakościowej jak i ilościowej surowców, produktów końcowych czy też podczas monitorowania procesów produkcyjnych. Dzięki połączeniu spektroskopii...
-
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublicationNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....
-
Termodynamiczne aspekty oddziaływania niskocząsteczkowych ligandów z DNA
PublicationKwasy nukleinowe są celem biologicznym dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Dlatego podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA.Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które może być podzielone...
-
The influence of reactions conditions on aggregation of dyes used in biochemistry
PublicationSelf-association of dyes and related substances is a very important phenomenon in many fields of applied chemistry. It is also fundamental model reaction of many kinds of molecular interactions such as the micelle formation of amphiphilic substances and the binding of small organic molecules to macromolecules. In spite of many studies concerning the dimerization equilibria of dyes and related substances, the mechanism seems not...
-
Theory and application of Near-infrared spectroscopy
PublicationIn recent years one can observe a significant increase in the requirements on quality control in all industrial sectors. The growing number of involved analyses makes the traditional, time consuming, requiring use of large quantities of reagents, thus expansive methods inconvenient especially for industrial applications. Fortunately, there is a very fast, cheap and not invasive analytical method that is increasingly used in qualitative...
-
Thermodynamics aspects of interactions between acridine derivatives and DNA
PublicationDNA is a molecular target for many anticancer and antiviral drugs. Therefore, a clear understanding of the interaction of small molecules with DNA is important in the rational design of ligands that can bind to DNA with high affinity and selectivity. There are several methods to investigate interactions between drug and DNA. Some of them measure changing into DNA structures, such as lengthening and untwisting of helix of DNA. Other...
-
WPŁYW TRANSFORMACJI DANYCH NA JAKOŚĆ OPRACOWANYCH METOD TOŻSAMOŚCIOWYCH W SPEKTROSKOPII BLISKIEJ PODCZERWIENI
PublicationSpektroskopia bliskiej podczerwieni (NIR) wykorzystuje absorpcję promieniowania elektromagnetycznego w zakresie 12000-4000 cm-1, (780¬-2500 nm). Absorpcja NIR pochodzi od nadtonów i drgań kombinacyjnych wiązań C-H, N-H, O-H. Widmo uzyskane techniką NIR jest unikatowym "odciskiem palca" badanej substancji gdyż zależy zarówno od właściwości fizyko-chemicznych próbki jak i od stanu fazowego oraz postaci krystalicznej jej składników.Zaletami...
Year 2009
-
Chemometria praktyczna : zinterpretuj wyniki swoich pomiarów / J. Mazerski.
PublicationWbrew swojej nazwie chemometria nie zajmuje się sposobami i teorią wykonywania pomiarów wielkości chemicznych ani nie ogranicza się tylko do chemii, nawet szeroko pojętej. Chemometria jest dziedziną nauki i techniki zajmującą się wydobywaniem użytecznej informacji z wielowymiarowych danych pomiarowych, wykorzystującą metody statystyki i matematyki.Chemometria różni się od statystyki nie tylko charakterem zestawu analizowanych danych,...
-
Chemometria z lotu ptaka
PublicationRozwój technik pomiarowych i komputeryzacja przyrządów pomiarowych doprowadziły do ogromnego wzrostu ilości gromadzonych danych pomiarowych. We wszystkich sferach działalności badawczej zbierane są dane, które - nie poddane odpowiedniej analizie - jawią się jako niewiele mówiący chaos zalegający w elektronicznych nosnikach pamięci.Jednocześnie z tym procesem trwa rozwój metod analizy danych i wydobywania z nich użytecznej informacji....
-
Molecular modeling of amphotericin B - ergosterol primary complex in water II
PublicationPrezentowane badania dotyczą oddziaływania antybiotyku polienowego anfoterycyny B (AmB) i ergosterolu (ERG) (typowego sterolu błonowego komórek grzybowych) na poziomie molekularnym. W odróżnieniu od badanego poprzednio kompleksu binarnego analizowany obecnie kompleks AnB/ERG/AmB charakteryzuje się zdecydowanie wiekszą stabilnością i wzglednie sztywną, sandwiczową geometrią. Za trwałość i geometrie kompleksu odpowiedzialne są oddziaływania...
-
PCBs in fish from southern Baltic Sea: Levels, bioaccumulation features and temporal trends during the 1997-2006 period
PublicationW próbkach 5 gatunków ryb bałtyckich pobranych w latach 1997-2006 oznaczono zawartość 7 wskaźnikowych polichlorowanych bifenyli. Zaobserwowano wyraźny trend spadku zawartości cięższych kongenerów w latach 1997-2001 dla różnych gatunków ryb za wyjątkiem dorsza. W próbkach szprota i śledzia stwierdzona statystycznie istotny spadek zawartości PCB 101, 118, 153, 138 i 180. Stwierdzono występowanie gatunkowospecyficznej bioakumulacji...
-
Zastosowanie techniki NIR w analizie jakościowej surowców kosmetycznych i farmaceutycznych
PublicationW ramach współpracy pomiedzy Katedrą Technologii Leków i Biochemii Wydziału Chemicznego PG, a zakładem produkcji kosmetyków i farmaceutyków Ziaja Ltd. podjęto prace badawcze nad opracowaniem nowych metod analitycznych stosując spektroskopię w bliskiej podczerwieni (NIR). Metoda ta wykorzystuje absorpcję promieniowania elektromagnetycznego w zakresie 12 000 - 4 000 cm-1 (780-2500 nm). Absorpcja w zakresie NIR pochodzi głównie nod...
Year 2008
-
Organochlorine pesticides in fish from the southern Baltic Sea: levels, bioaccumulation features and temporal trends during the 1995-2006 period
PublicationW próbkach pięciu gatunków ryb bałtyckich pobranych w latach 1995-2006 oznaczono zawartość heksachlorocykloheksanu (HCH), heksachlorobenzenu (HCB) oraz DDT i jego pochodnych. Dzięki zastosowaniu szeregu metod chemometrycznych a w szczególności analizy głównych składowych (PCA) zaobserwowano szereg istotnych zależności. Nie stwierdzono wpływu miejsca połowu na poziom analizowanych pestycydów w ciałach ryb. Zaobserwowano statystycznie...
Year 2006
-
Agregacja amfoterycyny B i wybranych pochodnych - chemometryczna analiza widm UV-Vis
PublicationPrezentowane badania miały na celu poznanie procesu agregacji nowej generacji pochodnych polienowego antybiotyku przeciwgrzybowego - amfoterycyny B. Przebieg procesu agregacji w roztworach wodnych o różnym składzie monitorowano przy pomocy absorpcyjnej spektroskopii UV-Vis. Otrzymane zestawy widm analizowano z zastosowaniem zaawansowanych technik chemometrycznych (PCA, NSD), co pozwoliło na określenie liczby, typu i ilości form...
-
Chemometria w analityce chemicznej. Cz. III. Analiza rozpoznawcza
PublicationW artykule przedstawiono zastosowania metod chemometrycznych do określania relacji pomiędzy badanymi próbkami oraz pomiędzy zmiennymi opisującymi te próbki, czyli tzw. analiza rozpoznawcza. Analiza rozpoznawcza stanowi łącznik pomiędzy analityką chemiczną, której głównym celem jest określenie składu lub właściwości próbek, a wieloma dziedzinami nauk przyrodniczych i techniki. Poprawnie zastosowana analiza rozpoznawcza stanowić...
-
Chemometric analysis of UV-Vis spektra of associated forms of Amphotericin B and its derivatives
PublicationPrzedmiotem badań był proces agregacji nowych pochodnych antybiotyku polienowego Amfoterycyny B. Do śledzenia procesu agregacji wykorzystano spektroskopię absorpcyjną w zakresie widzialnym i bliskiego nadfioletu. Zastosowanie zaawansowanych technik chemometrycznych pozwoliło na dogłębną analizę agregacji tych pochodnych, co pozwoliło na wyciągniecie następujacych wniosków: i) w przypadku wszystkich pochodnych przy stężeniach poniżej...
-
Chemometric methods for determination of mechanisms of action of anticancer compounds
PublicationW 1990 amerykański Narodowy Instytut Raka (NCI) wprowadził szeroki test przesiewowy in vitro mający na celu poszukiwanie nowych związków przeciwnowotworowych. Test został wdrożony po przebadaniu 171 standardowych związków przeciwnowotworowych. Przedmiotem niniejszej pracy jest próba stworzenia reguł klasyfikacji związków standardowych ze względu na ich mechanizm działania przeciwnowotworowego na podstawie wyników z testu NCI. Potwierdzono...
-
Introduction to chemometrics
PublicationW pracy przedstawiono definicję chemometrii oraz zakres jej zastosowań. Przedstawiono ponadto podstawowe metody chemometryczne oraz ich zalety i ograniczenia. Szczególny nacisk położono na przygotowanie i kontrolę danych oraz właściwy dobór metod analizy danych.
-
Spectrofotometric titration of dsDNA by nitroacridines - chemometrics approach
PublicationW pracy zastosowano podejście chemometryczne do analizy zestawów widm absorpcyjnych w obszarze widzialnym, uzyskanych podczas miareczkowania spektrofotometrycznego nitroakrydyn o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej przy pomocy DNA.Zastosowanie analizy głównych składowych (PCA) wykazało, że podczas miareczkowania 1-nitroakrydyn powstają dwa typy kompleksów, podczas gdy w przypadku 3-nitroakrydyn tylko jeden. Iteracyjna procedura...
Year 2005
-
Chemometria w analityce chemicznej. I. Specyfika metod chemometrycznych
PublicationChemometria jest dziedziną nauki i techniki zajmującą się wydobywaniem użytecznej informacji z wielowymiarowych danych pomiarowych, wykorzystującą metody statystyki i matematyki. W trakcie rozwoju metod chemometrycznych powstała specyficzna metodologia badawcza obejmująca: i)staranne planowanie doświadczeń, ii)wnikliwą kontrolę uzyskanych danych oraz iii)ocenę wiarygodności uzyskanych wyników. Artykuł zawiera ponadto omówienie...
-
Chemometria w analityce chemicznej. II. Kalibracja wielowymiarowa
PublicationArtykuł prezentuje zalety kalibracji wielowymiarowej i zawiera omówienie uzywanych w niej technik chemometrycznych. Celem kalibracji jest znalezienie ilościowej zależności pomiędzy wynikiem (wynikami)pomiaru pewnej cechy (cech) próbki a zawartością w niej określonego analitu. Przy tradycyjnej kalibracji jednowymiarowej wykorzystujemy tylko jedną spośród wielu zarejestrowanych wartości sygnału, podczas gdy w kalibracji wielowymiarowej...
-
Exploratory analysis - extraction of dispersed information
PublicationWiększość analityków środowiska uważa, że ich praca kończy sie z chwilą uzyskania wiarygodnych danych o zawartości w próbce poszukiwanego analitu. Jest to jednak przestarzały punkt widzenia. W typowej próbce środowiskowej oznacza się zwykle kilkanaście lub więcej analitów. ''Ręczna'' analiza wyników uzyskanych dla zestawu takich próbek jest praktycznie niemożliwa. Ponadto w takich wielowymiarowych danych najbardziej użyteczne informacje...
-
Glucosamine-6-phosphate synthase,a novel target for antifungalagents.Molecular modelling studies in drug design
PublicationPraca dotyczy modelowania zarówno samych inhibitorów syntazy glukozamino-6-fosforanu jak i ich oddziaływania z obydwiema domenami tego enzymu. Enzym syntaza glukozamino-6-fosforanu został zaproponowany jako nowy cel molekularny w chemoterapii infekcji grzybowych. Zaprojektowano i zsyntezowano szereg inhibitorów tego enzymu - potencjalnych nowych leków przeciwgrzybowych. Dzięki modelowaniu molekularnemu udało się wyjaśnić mechanizm...
-
Molecular basis of the low activity of antitumor anthracenediones, mitoxantrone and ametantrone, in oxygen radical generation catalyzed by NADH dehydrogenase. Enzymatic and molecular modelling studies
PublicationSyntetyczne antracenodionowe leki przeciwnowotworowe, w przeciwieństwie do antybiotyków antracyklinowych, charakteryzują się słabym wytwarzaniem wolnych rodników w układach z dehydrogenazą NADH. Wyniki prezentowane w artykule wskazują, że ani potencjał redukcyjny, ani konformacja łańcuchów bocznych, ani energie orbitali granicznych (LUMO i HOMO) nie determinują zdolności antracenedionów do stymulacji wytwarzania reaktywnych form...
-
Wykorzystanie technik chemometrycznych
Publication-------STRESZCZENIE 2-3 ZDANIA------------
Year 2004
-
Amphotericin B derivatives: novel strategy for the development of non-toxic, broad spectrum, fungicidal and overcoming multidrug resistance antifungal agents.
PublicationZaprezentowano porównawczą charakterystykę działania amfoterycyny B (AmB) oraz jej pochodnych o różnym stopniu selektywnej toksyczności na szczepy grzybów reperezentujących różne mechanizmy oporności. Były to mutanty C. albicans posiadające defekt w szlaku biosyntezy ergosterolu oraz wielolekooporne szczepy S. cerevisiae wyposażone w pompy eksportujące typu ABC i MFS. Badania obejmowały: 1)porównanie aktywności przeciwgrzybowej...
-
Application of chemometric methods in environmental research.
PublicationW badaniach analitycznych zastosowanie nowoczesnych technik pomiarowych, połączone ze skróceniem czasu analiz, prowadzi do uzyskiwania obszernych zbiorów danych w stosunkowo krótkim czasie. Zastosowanie specjalnych technik obróbki zbiorów wyników pomiarowych sprawia, że możliwe jest ''wydobycie'' dodatkowych informacji z posiadanych danych. Idealnym narzędziem do tego typu zabiegów może być chemometria. W opracowaniu omówiono teorię...
-
Application of PCA and time series analysis in studies of precipitation in Tricity (Poland).
PublicationPrzedstawiono wyniki monitoringu zanieczyszczenia atmosfery Trójmiasta. Próbki wody opadowej pobierano w cyklach miesięcznych przez 4 lata (1998-2001)w 10 punktach. Wyniki poddano statystycznej i chemometrycznej analizie (szeregi czasowe, analiza wariancji, analiza głównych składowych). Wykazano wpływ lokalizacji punktów monitoringowych i bliskości Morza Bałtyckiego na zawartość jonów nieorganicznych w analizowanych próbkach.
-
Chemometryczna analiza widm absorpcyjnych.
PublicationPrzedstawiono zastosowanie różnorodnych metod chemometrycznych do analizy widm absorpcyjnych próbek wieloskładnikowych. Zdefiniowano pojęcie widma jako wielowymiarowego wektora. Omówiono sposoby przygotowania widm do analizy chemometrycznej oraz metody pozwalające na uzyskanie informacji o: i)relacjach podobieństwa pomiędzy widmami; ii)wewnętrznym wymiarze przestrzeni widm; iii)liczbie i widmach form spektralnych występujących...
-
Studies of the effects of antifungal cationic derivatives of amphotericin B on human erythrocytes.
PublicationBadano nową grupę kationowych pochodnych amfoterycyny B pod kątem zależności pomiędzy ich zdolnością do asocjacji i selektywną toksycznością. We wszystkich przypadkach stosowano amfoterycynę B jako związek odniesienia. Jako miarę efektu toksycznego in vitro badanych związków stosowano wypływ wewnątrzkomórkowego potasu oraz hemolizę. Miarą aktywności przeciwgrzybowej był MIC i utrata potasu wewnatrzkomórkowego. Do oceny stopnia...
Year 2003
-
Effect of transregional transport of pollutants on atmospheric air quality in the Tricity area of Poland
PublicationDwuwymiarowa analiza wariancji wyników oznaczania jonów nieorganicznych, pH oraz przewodnictwa konduktometrycznego w próbkach wód opadowych zebranych w rejonie Trójmiasta pokazała, że transregionalny transport substancji zanieczyszczających środowisko ma wpływ na jakość powietrza w tym rejonie. W całym Trójmieście wahania stężeń analitów w wodach opadowych nie są spowodowane w znacznym stopniu przez lokalizacje miejsc pobierania...
-
Wykorzystanie technik chemometrycznych w badaniach analitycznych środowiska
PublicationOmówiono teorię planowania pomiarów, rozkładów empirycznych, procedur przy-gotowania danych a także najczęściej wykorzystywane techniki analizy danych.Wspomniano równiez o nowoczesnych technikach analizy danych, zaliczanych dogrupy technik opartych na wykorzystaniu sztucznej inteligencji. Opis teore-tyczny w każdym przypadku wzbogacono o przykłady zastosowań w konkretnychproblemach analitycznych.
Year 2002
-
Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water
PublicationBadano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.
-
Molecular modelling of membrane sterols with the use of the GROMOS 96 forcefield
PublicationPodstawowym zadaniem tego projektu było udowodnienie zasadności stosowania pola siłowego GROMOS 96 do symulacji steroli błonowych metodą dynamiki molekularnej. Uzyskane wyniki jasno wskazują, że to pole siłowe bardzo dobrze nadaje się do symulacji silnie lipofilowych układów.
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublicationWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
seen 2815 times