KPD specjalizuje się w długoterminowym przechowywaniu próbek materiału mikrobiologicznego, jego identyfikacji i walidacji.
Kolekcja Plazmidów i Drobnoustrojów (KPD) działa na Wydziale Biologii Uniwersytetu Gdańskiego.
Do naszych zadań należy:
- długoterminowe przechowywanie szczepów bakterii, bakteriofagów oraz plazmidów do celów naukowo-badawczych
- selekcja szczepów o potencjalnym znaczeniu biotechnologicznym
- upowszechnianie dostępu do zasobów genetycznych o znanym pochodzeniu zgodnie z Protokołem z Nagoi
- wymiana i współpraca z innymi kolekcjami mikroorganizmów w Polsce i na świecie
- gromadzenie i udostępnianie materiału biologiczny na potrzeby szeroko pojętej edukacji i popularyzacji wiedzy
- upowszechnianie wiedzy o drobnoustrojach.
Promując najlepsze praktyki oraz ideę deponowania przez naukowców materiału badawczego, Kolekcja zabezpiecza cenne próbki do dalszych badań naukowych i rozwojowych.
Jako przedsięwzięcie o charakterze niekomercyjnym, którego celem jest upowszechnienie dostępu do wysokiej jakości materiału biologicznego, Kolekcja służy całemu środowisku naukowemu.

Kolekcja dysponuje światowej klasy infrastrukturą naukowo-badawczą, umożliwiającą kompleksową charakterystykę oraz długoterminowe przechowywanie mikroorganizmów.
Zdeponowanie szczepów mikroorganizmów lub plazmidów w ogólnodostępnej części kolekcji KPD nie wiąże się z żadnymi opłatami.
DEPONOWANIE mikroorganizmów i plazmidów
W zakresie zainteresowań KPD znajdują się:
- Naturalnie występujące szczepy bakterii i archeonów
- Bakteriofagi
- Plazmidy lub wektory plazmidowe
Kolekcja dokłada wszelkich starań, aby powierzony jej materiał biologiczny był przechowywany w warunkach, które zapewnią jego żywotność/ zdolność do replikacji, stabilność genetyczną oraz fizjologiczną.
Kolekcja akceptuje wyłącznie materiał biologiczny zaklasyfikowany do
- grupy 1 zagrożenia biologicznego | Grupa P1 zagrożenia biologicznego, Klasa bezpieczeństwa biologicznego BSL-1 oraz
- grupy 2 zagrożenia biologicznego | P2 / BSL-2
(wykaz takich czynników znajduje się w Rozporządzeniu Ministra Zdrowia Roz. Min. Zdrowia z dn. 22 kwietnia 2005 r., Dz. Ust. Nr 81 poz. 716, załącznik nr 1)
Warunkiem zdeponowania materiału biologicznego w KPD jest wypełnienie formularza akcesyjnego (KPD ACCESSION FORM).
Przed przekazaniem KPD materiału, prosimy o kontakt z kuratorem KPD (kpd@ug.edu.pl) w celu potwierdzenia czy kolekcja dysponuje technicznymi możliwościami przechowywania danego materiału biologicznego.
Zdeponowanie w KPD szczepów mikroorganizmów lub plazmidów jest nieodpłatne.
Materiał biologiczny powierzony Kolekcji jako „depozyt publiczny ”, ang. public deposit jest dostępny dla naukowców zarówno z ośrodków badawczych zarówno niekomercyjnych jak i komercyjnych. Informacja o zdeponowaniu materiału biologicznego jak i jego opis naukowy udostępnione są w katalogu elektronicznym na stronie internetowej KPD. Przekazanie zdeponowanego materiału stronie trzeciej przez KPD odbywa się na zasadach określonych w Umowie o Przekazaniu Materiału (SMTA) oraz na warunkach określonych w innych umowach związanych z danym materiałem.
udostępnianie szczepów i PLAZmidów
Materiał biologiczny powierzony Kolekcji jest dostępny dla naukowców z ośrodków badawczych zarówno komercyjnych, jak i niekomercyjnych.
Zbiory obejmują wyłącznie materiał biologiczny zaklasyfikowany do grupy 1 zagrożenia biologicznego (Grupa P1 zagrożenia biologicznego, Klasa bezpieczeństwa biologicznego BSL-1) oraz do grupy 2 zagrożenia (P2, BSL-2).
KPD udostępnia wyłącznie materiał biologiczny o znanym i wiarygodnym pochodzeniu, który został pozyskany zgodnie z prawem, w tym z ustaleniami Protokołu z Nagoi dotyczącymi „dostępu do zasobów genetycznych oraz uczciwego i sprawiedliwego podziału korzyści wynikających z ich wykorzystania” oraz zgodnie z Rozporządzeniem Rady UE i Parlamentu Europejskiego nr 511/2014, które nakłada na użytkowników zasobów genetycznych, w tym naukowców, obowiązek „należytej staranności, jeśli chodzi o dążenie do uzyskania wszystkich niezbędnych informacji dotyczących pierwotnego źródła, z którego zasoby genetyczne zostały pozyskane, jak również kolejnych użytkowników”.
KPD dokłada wszelkich starań, aby dostarczany materiał biologiczny był jak najwyższej jakości, spełniał kryteria czystości i żywotności oraz autentyczności. W przypadku złożenia pisemnej reklamacji w ciągu 30 dni od dnia wysyłki, KPD zobowiązuje się do bezpłatnej wymiany materiału.
Aby otrzymać próbki, należy wypełnić „Formularz zamówienia” i przekazać nam podpisany dokument lub przesłać jego skan z podpisem na adres e-mailowy kpd@ug.edu.pl
Zdeponowane w KPD szczepy mikroorganizmów bądź plazmidy udostępniane są na podstawie umowy o przekazaniu materiału (MTA) oraz na warunkach określonych w innych umowach związanych z danym materiałem badawczym.
Misją KPD jest zapewnienie dostępu do materiału badwczego wysokiej jakości.
Aby pokryć koszty przygotowania próbek oraz ich wysłki, KPD pobiera opłatę manipulacyjną.
W publikacjach, w których wykorzystano szczepy drobnoustrojów lub plazmidy pozyskane z KPD, autorzy są zobowiązani wskazać KPD jako źródło materiału (przy nazwie szczepu/plazmidu należy podać numer nadany przez KPD).
W przypadku użycia materiału, którego konstrukcja została opisana w publikacji naukowej, należy zacytować pracę źródłową.
Infrastruktura badawcza
Opis poszczególnych w sekcji poniżej pn. Aparatura w laboratorium
współpraca naukowa
Pracownicy KPD są zangażowani w realizację szeregu projektów badawczych.
Projekty międzynarodowe
- x
- y
- z
Projekty NCN
Aktywność na forum międzynarodowym
KPD zarejestrowana jest w Światowym Centrum Informacji o Mikroorganizmach (Word Data Center for Microorganisms, WDCM)
pod numerem WDCM1084.
Oznacza to, że zdeponowanie mikroorganizmów w Kolekcji KPD jest honorowane przez wszystkie czasopisma naukowe.
Od 2016 r. KPD jest członkiem Europejskiej Organizacji Kolekcji Kultur (European Culture Collections' Organisation, ECCO).
Keywords
- mikroorganizmy
- MALDI TOF
- OmniLog
- udostępnianie materiału badawczego
- mikromacierze fenotypowe
- identyfikacja bakterii
- MALDI TOF
- OmniLog
- nanoDSF
- MST
- termoforeza mikroskalowa
- nanoróżnicowa fluorymetria skaningowa
- MALDI Biotyper
- zasoby mikrobiologiczne
- cyfrowy system do emulsyjnego PCR
- ddPCR
- Deponowanie mikroorganizmów na potrzeby postępowania patentowego
- Deponowanie mikroorganizmów zgodnie z Traktatem Budapesztańskim
Research topics / Laboratory research field
Research Kind
-
Identyfikacja i charakterystyka mikroorganizmów deponowanych w Kolekcji KPD
Identyfikacja bakterii z wykorzystaniem spektrometrii mas. -
Fenotypowanie mikroorganizmów lub ich populacji
Identyfikacja oraz fenotypowanie drobnoustrojów | Analiza profilu metabolicznego społeczności mikroorganizmów (CLPP – Community Level Physiological Profiles) | Fenotypowanie komórek ssaczych | Badania funkcji mitochondriów.
NCN discipline
- NZ1 Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna / NZ1_1 Biologia molekularna
Research field & subject
- B. Badania biologicznie i biochemiczne / K. Badania mikrobiologiczne
- D. Badania kliniczne, medyczne i weterynaryjne / M. Badania inne
Equipment in laboratory
Details
- Contact:
-
Dr n med. Anna-Karina Kaczorowska
phone: +48 58 523 6070e-mail: kpd@ug.edu.pl
- Maintainer:
- Dr n med. Anna-Karina Kaczorowska
- Associated units:
- Verified by:
- No verification
seen 4995 times