Inferring perfect phylogenies with restrictions on character state transitions - Publication - Bridge of Knowledge

Search

Inferring perfect phylogenies with restrictions on character state transitions

Abstract

Znana z klasycznej literatury metoda rekonstrukcji drzewa filogenetycznego zbioru gatunków na podstawie ich cech analizowanych w modelu doskonałej filogenezy często okazuje się niewystarczająca ze względu na założenia tego modelu, zmuszające do pominięcia znanych biologom informacji. W pracy definiujemy rozszerzenie umożliwiając wprowadzenie dla każdej cechy grafu skierowanego dopuszczalnych przejść ewolucyjnych pomiędzy jej stanami. Okazuje się, że nowy model filogenezy jest bogatszy, ale i trudniejszy pod względem algorytmicznym od klasycznego, np. zagadnienie istnienia poprawnego drzewa staje się w nim NP-trudne już przy dwóch cechach.

Citations

  • 0

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 0

    Scopus

Cite as

Full text

full text is not available in portal

Keywords

Details

Category:
Conference activity
Type:
publikacja w wydawnictwie zbiorowym recenzowanym (także w materiałach konferencyjnych)
Title of issue:
Proceeedings of the 1st International Conference on Information Technology Gdańsk, 19-21 May 2008 strony 399 - 402
Language:
English
Publication year:
2008
Bibliographic description:
Truszkowski J., Giaro K.: Inferring perfect phylogenies with restrictions on character state transitions// Proceeedings of the 1st International Conference on Information Technology Gdańsk, 19-21 May 2008/ ed. eds: A. Stepnowski [et al.]. Gdańsk: Gdańsk University of Technology, 2008, s.399-402
DOI:
Digital Object Identifier (open in new tab) 10.1109/inftech.2008.4621668
Verified by:
Gdańsk University of Technology

seen 65 times

Recommended for you

Meta Tags