Abstract

We recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally and tested by microscopy & culture and PCR.The present study demonstrates that in a routine setting the PCR test is as sensitive as traditional diagnostics performed in a mycology reference lab if microscopy positive but culture negative samples are considered positive and far more sensitive if only culture positive samples are considered true positives. The introduction of an internal control demonstrated that 5% of the samples contained PCR inhibitors but this was overcome by re-running the samples with a 50% reduction of sample DNA solution.Niedawno opublikowaliśmy pięciogodzinny test multipleks PCR do wykrywania dermatofitoz paznokci. Test ten został zoptymalizowany poprzez dodanie kontroli inhibicji, a jego stosowanie zostało ocenione przez porównanie z wynikami testów konwencjonalnych opartych na mikroskopowaniu i obserwacji hodowli.Przebadano109 próbek klinicznych otrzymywanych do rutynowej diagnostyki przez referencyjne laboratorium mikologiczne Statens Serum Institut. Każda z próbek została podzielona i testowana konwencjonalnie i techniką PCR.Przedstawiona analiza wykazała, że w laboratorium rutynowym test PCr jest tak samo czuły, jak diagnostyka konwencjonalna przeprowadzana w laboratorium referencyjnym, jeśli za dodatnie uzna się wszystkie próbki mikroskopowo pozytywne, bez względu na wyniki hodowli, a dużo bardziej czułą, jeśli za dodatnie próbki uzna się próbki dodatnie w ocenie hodowli.Wprowadzenie wewnętrznej kontroli inhibicji wykazało, że 5% próbek zawierało inhibitory reakcji PCR. Jednakże 50% redukcja objętości próbki DNA jest rozwiązaniem problemu inhibicji

Authors (4)