Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution

Maciej Śmiechowski

doi:10.1016/j.cplett.2010.10.063

Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution

Abstract

Sprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia w sposób jawny co najmniej 4 cząsteczek wody hydratacyjnej. Konwersja neutralnej P-Ser w roztworze wodnym w formę jonu obojnaczego jest procesem niezwykle szybkim. Energie swobodne aktywacji obliczone w podobny sposób jak pKa są bardzo niskie a wartość energii swobodnej reakcji sugeruje całkowite zajście przemiany P-Ser w formę obojnaczą.

Citations

2 4

CrossRef
0

Web of Science
3 1

Scopus

Author (1)

Maciej Śmiechowski dr hab. inż.

Cite as

Full text

full text is not available in portal

full content of the article see on external site open in new tab

Keywords

Details

Category:: Articles
Type:: artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
Published in:: CHEMICAL PHYSICS LETTERS no. 501, pages 123 - 129,
ISSN: 0009-2614
Language:: English
Publication year:: 2010
Bibliographic description:: Śmiechowski M.: Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution// CHEMICAL PHYSICS LETTERS. -Vol. 501, (2010), s.123-129
DOI:: Digital Object Identifier (open in new tab) 10.1016/j.cplett.2010.10.063
Verified by:: Gdańsk University of Technology