displaying 1000 best results Help
Search results for: WATER CLUSTERS, MOLECULAR INTERACTIONS, HYDROGEN BONDS, AB INITIO CALCULATIONS, ELASTIC SCATTERING, DIRAC-HARTREE-FOCK SELF-CONSISTENT FIELD, GAUSSIAN FUNCTION BASIS SE
-
Surface-enhanced Raman scattering of water in aqueous dispersions of silver nanoparticles
Publication -
Hydrogen degradation of high-strength weldable steels in sea-water
PublicationW artykule przedstawiono ocenę podatności stali o wysokiej wytrzymałości oraz ich złączy spawanych na kruchość wodorową. Wykonano próby powolnego rozciągania na stalach gatunku 17HMBVA i 14HNMBCu oraz ich złączach spawanych, w środowisku wody morskiej, przy polaryzacji katodowej. Wykonano badania elektrochemiczne przenikania wodoru przez membrany pobrane z rożnych obszarów złączy spawanych.
-
Hydrogen degradation of high-strength weldable steels in sea-water.
PublicationW pracy przedstawiono ocenę degradacji wodorowej dwóch gatunków stali spawalnych o wysokiej wytrzymałości 17HMBVA i 14HNMBCu. Badania wykonano na materiałach rodzimych i złączach spawanych stali w oparciu o próbę rozciągania z małą prędkością. Próby wykonano w powietrzu oraz środowisku wody morskiej przy polaryzacji katodowej. Dodatkowo wykonano elektrochemiczne badania przenikania wodoru i wyznaczono zależności stężenia wodoru...
-
Kamila Kokot-Kanikuła mgr
PeopleKamila Kokot-Kanikuła is a digital media senior librarian at Gdańsk University of Technology (GUT) Library. She works in Digital Archive and Multimedia Creation Department and her main areas of interests include early printed books, digital libraries, Open Access and Open Science. In the Pomeranian Digital Library (PDL) Project she is responsible for creating annual digital plans, transferring files on digital platform, and promoting...
-
TIME-OF-FLIGHT DIFFERENTIAL ELECTRON SCATTERING FROM MOLECULAR TARGETS: BENCHMARK CROSS SECTIONS
PublicationWe report time-of-flight differential cross section (DCS) measurements for the electron impact excitation transition in H2. In this work, agreement between available theory and experiment is excellent overall, and marks a transition in electron molecule scattering where differential scattering of excitation is found to be in such precise agreement. We also prove that the newly built apparatus can be used for accurate measurement...
-
FEM Calculations in Analysis of Steel Subsea Water Injection Flowlines Designing Process
PublicationPaper describes the result of theoretical research aimed at assessing the loads and operating conditions of a Coiled Tubing pipeline injecting water, suspended to the mining platform of Lotos Petrobaltic. For this purpose, appropriate calculation models have been developed using the Finite Element Method (FEM), taking into account the nature of the analyzed object and its loads. The analyzes were carried out for two pipes (previously...
-
Superconducting state in the atomic metallic hydrogen just above the pressure of the molecular dissociation
Publication -
Molecular basis of the low activity of antitumor anthracenediones, mitoxantrone and ametantrone, in oxygen radical generation catalyzed by NADH dehydrogenase. Enzymatic and molecular modelling studies
PublicationSyntetyczne antracenodionowe leki przeciwnowotworowe, w przeciwieństwie do antybiotyków antracyklinowych, charakteryzują się słabym wytwarzaniem wolnych rodników w układach z dehydrogenazą NADH. Wyniki prezentowane w artykule wskazują, że ani potencjał redukcyjny, ani konformacja łańcuchów bocznych, ani energie orbitali granicznych (LUMO i HOMO) nie determinują zdolności antracenedionów do stymulacji wytwarzania reaktywnych form...
-
Understanding ion–ion and ion–solvent interactions in aqueous solutions of morpholinium ionic liquids with N-acetyl-L-alaninate anion through partial molar properties and molecular dynamics simulations
PublicationAmino acid ionic liquids (AAILs) provide a low toxicity, biodegradable alternative to conventional ionic liquids, while also maintaining solubility in water. Densities and sound velocities of aqueous solutions of four amino acid ionic liquids (AAILs), based on the N-alkyl-N-methylmorpholinium ([Mor1,R], R = 2, 3, 6, 8) cation and N-acetyl-L-alaninate ([N-Ac-L-Ala]) anion were measured at T = (293.15–313.15) K and at atmospheric...
-
Supramolecular Assemblies of Hydrogen Bonded Carboxylic Acid Dimers Mediated by Phenyl-Pentafluorophenyl Stacking Interactions.
PublicationKwas pentafluorobenzoesowy tworzy heterodimery z kwasami benzoesowym i 2,4,6-trimetylobenzoesowym w wyniku oddziaływań typu pi-pi reszt fenylowych i pentafluorofenylowych. Otrzymane kokryształy wymienionych kwasów z 1,4-bisarylobutadiynami zawierały homodimery tworzone przez cząsteczki kwasów, pomiędzy którymi znajdowały się cząsteczki diarylodiacetylenów.
-
Multi-state multi-reference Møller-Plesset second-order perturbation theory for molecular calculations
PublicationThis work presents multi‐state multi‐reference Møller–Plesset second‐order perturbation theory as a variant of multi‐reference perturbation theory to treat electron correlation in molecules. An effective Hamiltonian is constructed from the first‐order wave operator to treat several strongly interacting electronic states simultaneously. The wave operator is obtained by solving the generalized Bloch equation within the first‐order...
-
Stark-induced magnetic anapole moment in the ground state of the relativistic hydrogenlike atom: Application of the Sturmian expansion of the generalized Dirac-Coulomb Green function
PublicationZnaleziono magnetyczny moment anapolowy indukowany w stanie podstawowym relatywistycznego atomu jednoelektronowego przez zewnętrzne stałe, słabe, jednorodne pole elektryczne. Podano wyrażenie analityczne dla polaryzowalności anapolowej takiego atomu. Obliczenia wykonano, stosując rozwinięcie sturmowskie uogólnionej funkcji Greena-Diraca-Coulomba.
-
Possible Formation of H3O+ Cations Due to Aluminum Fluoride Interactions with Water
Publication -
Intermolecular Interactions in Selected Polymer-Water Systems as Seen by Raman Spectroscopy
Publication -
Electronically Excited States in Solution via a Smooth Dielectric Model Combined with Equation-of-Motion Coupled Cluster Theory
PublicationWe present a method for computing excitation energies for molecules in solvent, based on the combination of a minimal parameter implicit solvent model and the equation-of-motion coupled-cluster singles and doubles method (EOM-CCSD). In this method, the solvent medium is represented by a smoothly varying dielectric function, constructed directly from the quantum mechanical electronic density using only two tunable parameters. The...
-
Configurations of H 3 + (H2)n clusters and their energies
PublicationThe H-3(+) ion plays an important role in low temperature astrophysical and laboratory plasmas. It is considered as the initiator of many ion-molecule chemistries. Also its clusters with H-2 are quite interesting. We study configurations of the H-3(+)(H-2)(n) clusters for n = 1 up to n = 12 as a simple test system. Total energies for these structures, with zero point vibration corrections have been calculated. Stabilization energies...
-
Differential cross sections for low-energy elastic electron scattering from tetrahydrofuran in the angular range 20°-180°
PublicationWartości absolutne różniczkowych przekrojów czynnych na rozproszenie sprężyste elektronów o energii 6-20eV na cząsteczce tetrahydrofuranu w zakresie kątów 20°-180°. W pomiarach wykorzystano technikę lokalnego pola magnetycznego. Wyznaczono także całkowity przekrój czynny na rozproszenie sprężyste oraz przekrój czynny na przekazanie pędu poprzez scałkowanie zmierzonych różniczkowych przekrojów czynnych dla wybranych energii.
-
Molecular basis for the bifunctional Uba4–Urm1 sulfur‐relay system in tRNA thiolation and ubiquitin‐like conjugation
Publication -
Imidazolium silanethiolates relevant to the active site of cysteineproteases. A cooperative effect in a chain of NH(+)...S(-) hydrogenbonds
PublicationThree imidazolium silanethiolates relevant to the active site of cysteine proteases have been synthesized and investigated by X-ray diffraction, IR spectroscopy and computational methods. As indicated by crystallographic and FT-IR data in the solid state, the transfer of proton from thiol to imidazole takes place and a thiolato-imidazolium ion pair is formed. The FT-IR spectra of crystalline imidazolium silanethiolates exhibit...
-
Vibrational inelastic electron-H2 scattering revisited: numerically converged coupled channels space frame calculations with model interaction
PublicationZderzeniowe wzbudzenie niższych oscylacyjnych poziomów molekuły H2 (^1Σ^+,g) przez elektrony o niskiej energii. Obliczenia wykonano przy użyciu empirycznego modelowego potencjału oraz przez rozwiązanie równania rozpraszania dwukanałowego w układzie współrzędnych, związanych z molekułą.
-
Analysis of the biological stability of tap water on the basis of risk analysis and parameters limiting the secondary growth of microorganisms in water distribution systems
Publication -
Non-Destructive Testing of the Longest Span Soil-Steel Bridge in Europe—Field Measurements and FEM Calculations
PublicationThe article describes interdisciplinary and comprehensive non-destructive diagnostic tests of final bridge inspection and acceptance proposed for a soil-steel bridge made of corrugated sheets, being the European span length record holder (25.74 m). As an effect of an original concept a detailed and precise information about the structure short-term response was collected. Periodic diagnostics of bridge deformations was done one...
-
Hydrogen assisted cracking of high-strength weldable steel in sea-water.
PublicationOceniono niszczenie wodorowe stali o wysokiej wytrzymałości i jej złączy spawanych przy różnych rodzajach obciążenia w wodzie morskiej. Przeprowadzono próby rozciągania z małą prędkością odkształcenia i zmęczenia niskocyklowego w wodzie morskiej przy polaryzacji katodowej. Badano stal gatunku 17HMBVA o minimalnej granicy plasyczności 690 MPa oraz jej złącza spawane automatycznie łukiem krytym i ręcznie łukowo elektrodą otuloną.
-
Hydrogen assisted cracking of high-strength weldable steels in sea-water.
PublicationOceniono niszczenie wodorowe stalio wysokiej wytrzymałości i ich złączy spawanych przy różnych rodzajach obciążenia w wodzie morskiej. Prowadzono próby rozcią gania z małą prędkością odkształcenia i zmęczenia niskocyklowego w wodzie morskiej przy polaryzacji katodowej. Badano dwa gatunki stali o minimalnej granicy plastyczności 690 MPa, oraz jej złącza spawane automatycznie łukiem krytym i ręcznie łukowo elektrodą otuloną. Dla...
-
Perturbation analysis of electric field around objects in sea water
PublicationThe paper presents an analytical approach to the perturbation analysis of electric field distribution caused by a sphere and an ellipsoid placed in a uniform electric field.
-
Analysis of radiation and scattering problems with the use of hybrid techniques based on the discrete Green's function formulation of the FDTD method
PublicationIn this contribution, simulation scenarios are presented which take advantage of the hybrid techniques based on the discrete Green's function formulation of the finite-difference time-domain (DGF-FDTD) method. DGF-FDTD solutions are compatible with the finite-difference grid and can be applied for perfect hybridization of the FDTD method. The following techniques are considered: (i) DGF-FDTD for antenna simulations, (ii) DGF-based...
-
Investigation of Protein Folding by Coarse-Grained Molecular Dynamics with the UNRES Force Field
Publication -
Conformational studies of [Nphe5]SFTI-1 by means of 2D NMR spectroscopy in conjunction with molecular dynamics calculations
Publication -
A unified coarse-grained model of biological macromolecules based on mean-field multipole–multipole interactions
Publication -
Rengel Cane Sia Doctoral Candidate
PeopleI’m Rengel, born and raised in the Philippines. As an undergraduate I did kinetic modeling on Copper-catalyzed atom transfer radical addition (ATRA). Then I was inspired to do both theoretical and experimental studies, which led me to propose my master’s thesis on Synthesis, Computational, Electrochemical, and Photoconductivity Studies on Naphthalene and its derivatives. This led to a master’s degree in Chemistry in the Mindanao...
-
Towards temperature-dependent coarse-grained potentials of side-chain interactions for protein folding simulations. I: Molecular dynamics study of a pair of methane molecules in water at various temperatures
Publication -
Low-energy positron scattering from gas-phase pyrimidine: A quantum treatment of the dynamics and a comparison with experiments
PublicationWe are reporting detailed quantum scattering calculations that describe the diffusion of a beam of low-energy positrons interacting with the pyrimidine target as a gas-phase partner. The calculations have employed an essentially ab initio model for the short-range correlation interaction and for the electrostatic interaction of an impinging positron and the electron+nuclear structure of the target molecule at its equilibrium geometry.
-
PF5 and PCl5 interacting with water – Comparative study at the molecular level
Publication -
Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water
PublicationBadano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.
-
Conformation Properties, Chiroptical Spectra, and Molecular Self-Assembly of 2,3-Piperazinodiones and Their Dithiono Analogues
PublicationRodzina chiralnych cyklicznych oksamidów została otrzymana przez kondensację optycznie czynnych 1,2-diamin ze szczawianem dietylu. Tionowanie produktów odczynnikiem Lawessona doprowadziło do chiralnych 2,3-dipiperazynodionów. Geometrie cząsteczkowe badano z użyciem obliczeń kwantowo-mechanicznych DFT i porównano z wynikami analizy krystalograficznej. Sześcioczłonowy pierścień heterocykliczny przyjmuje konformację półkrzesłową,...
-
The exposure to UV filters: Prevalence, effects, possible molecular mechanisms of action and interactions within mixtures
PublicationSubstances that can absorb sunlight and harmful UV radiation such as organic UV filters are widely used in cosmetics and other personal care products. Since humans use a wide variety of chemicals for multiple purposes it is common for UV filters to co-occur with other substances either in human originating specimens or in the environment. There is increasing interest in understanding such co-occurrence in form of potential synergy, antagonist,...
-
Elimination and migration of hydrogen in the vacuum-ultraviolet photodissociation of pyridine molecules
PublicationElimination of the excited hydrogen atoms H(n), n = 4–7, and hydrogen migration in formation of the excited NH(A 3Π) free radicals in the photodissociation of pyridine, C5H5N, molecules have been studied over the 17.5–70 eV photon energy range. In the measurements the photon-induced fluorescence spectroscopy technique has been applied. Both fragments are produced through excitation of pyridine molecules into higher-lying superexcited...
-
Water Behavior Near the Lipid Bilayer
PublicationIn this chapter, we focus on the dynamics of water molecules situated in the vicinity of a phospholipid bilayer. Using a molecular dynamics simulation method, we studied interactions between water and the bilayer and tracked trajectories of the water molecules. Based on the hypothesis that molecules trapped inside the bilayer make different motions than the ones which are either attached to the surface or move freely in the water...
-
An Analysis of Scattering from Ferrite Post of Arbitrary Convex Cross Section with the Use of Field Matching Method
PublicationA problem of electromagnetic wave scattering from ferrite post is presented. The post is assumed to be located in closed areas as waveguide junction, or in open area illuminated by a plane wave. The object is of arbitrary convex cross section and the method of analysis is semi-analytical, based on the direct field matching technique.
-
A general method for the derivation of the functional forms of the effective energy terms in coarse-grained energy functions of polymers. III. Determination of scale-consistent backbone-local and correlation potentials in the UNRES force field and force-field calibration and validation
Publication -
Municipal wastewater reclamation: Reclaimed water for hydrogen production by electrolysis – A case study
PublicationThis paper presents an analysis of a treatment system selection for municipal wastewater stream based on the DuPont Water Solutions WAVE software. The results obtained based on an analysis of 7 different processing cases studies (ultrafiltration and reverse osmosis) confirmed that the application of 2-pass membrane systems enables the reclamation of water from municipal wastewater that fulfills the requirements concerning the...
-
3D calculations of aerodynamic forces causing self-excited vibrations of turbine rotor systems. Part II: Pressure forces
PublicationPrzedstawiono wyniki badań numerycznych sił generowanych w uszczelnieniu nadbandażowym stopnia turbinowego przeprowadzone metodą Fluent. Uwzględniono niecentryczne położenie osi wirnika względem osi korpusu. Rozpatrzono bandaże o różnej geometrii. Niektóre wyniki zweryfikowano doświadczalnie.
-
Surface-enhanced Raman scattering (SERS) and tip-enhanced Raman scattering (TERS) in label-free characterization of erythrocyte membranes and extracellular vesicles at the nano-scale and molecular level
Publication -
Elastic cross-section calculations for electron collisions with XY4 (X=Si,Ge; Y=H, F, Cl, Br, I) molecules
PublicationObliczano elastyczne przekroje czynne dla tetraedrycznych związków krzemu i germanu. Otrzymane wyniki porównano z innymi dostępnymi wynikami obliczeń oraz z danymi doświadczalnymi; dla energii powyżej 100 eV uzyskano zadowalającą zgodność.
-
Low-energy positron scattering from DNA nucleobases: the effects from permanent dipoles
PublicationAb initio quantum calculations for low-energy positron scattering from gas-phase isolated molecular nucleobases which are part of the DNA structure are presented and discussed over the range of 1 eV to 25 eV. The calculations report the integral cross sections (ICSs) and the momentum-transfer cross sections (MTCSs) for Adenine, Guanine, Thymine and Cytosine. The calculations show very clearly the important role of the dominant...
-
Planar chiral dianthranilide and dithiodianthranilide molecules: optical resolution, chiroptical spectra, and molecular self-assembly.
PublicationChiralny planarnie diantranilid został rozdzielony na enancjomery przy użyciu chlorku (-)-(1S,4R)-kamfanoilu. Konfigurację absolutną (S)-enancjomeru ustalono na podstawie analizy rentgenograficznej monokryształu jego N,N'-dikamfoilopochodnej. Natomiast rozdział ditiodiantranilidu na enancjomery przeprowadzono poprzez tworzenie związków inkluzyjnych z (R,R)-1,2-diaminocykloheksanem. Otrzymanemu w ten sposób enancjomerowi przypisano...
-
The molecular function of kallikrein‐related peptidase 14 demonstrates a key modulatory role in advanced prostate cancer
Publication -
Molecular modeling of amphotericin B - ergosterol primary complex in water II
PublicationPrezentowane badania dotyczą oddziaływania antybiotyku polienowego anfoterycyny B (AmB) i ergosterolu (ERG) (typowego sterolu błonowego komórek grzybowych) na poziomie molekularnym. W odróżnieniu od badanego poprzednio kompleksu binarnego analizowany obecnie kompleks AnB/ERG/AmB charakteryzuje się zdecydowanie wiekszą stabilnością i wzglednie sztywną, sandwiczową geometrią. Za trwałość i geometrie kompleksu odpowiedzialne są oddziaływania...
-
Molecular Dynamics Study of the Internal Water Molecules in Vasopressin and Oxytocin Receptors
Publication -
New examples of N^(+)-H···^(-)S hydrogen bonds: Synthesis and X-ray study of selected secondary ammonium tri-tert-butoxysilanethiolates
PublicationTri-tert-butoksysilanotiol reagując z aminami drugorzędowymi: Et2NH, morfoliną, dicykloheksyloaminą i 2,2,4,4-tetrametylopiperydyną daje odpowiednie sole amoniowe. Jak wykazują rentgenowskie badania strukturalne wszystkie te związki tworzą w ciele stałym jednostki dimeryczne {RS(-), R'NH2(+)}2, powiązane wiązaniami wodorowymi typu: N(+)-H···(-)S.