Filters
total: 3764
-
Catalog
- Publications 1952 available results
- Journals 450 available results
- Conferences 12 available results
- People 89 available results
- Inventions 7 available results
- Projects 33 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 2 available results
- e-Learning Courses 393 available results
- Events 65 available results
- Open Research Data 760 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: UROPATHOGENIC E. COLI
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublicationBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
Importance of biofilm formation by uropathogenic E. coli Dr+ strains in urinary tract infections
PublicationImportance of biofilm formation by uropathogenic E. coli Dr+ strains in urinary tract infections
-
Biochemical characteristic of biofilm of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains.
PublicationUrinary tract infections caused by Escherichia coli are very common health problem in the developed countries. The virulence of the uropathogenic E. coli Dr+ IH11128 is determined by Dr fimbriae, which are homopolymeric structures composed of DraE subunits with the DraD protein capping the fiber. In this study, we have analyzed the structural and biochemical properties of biofilms developed by E. coli strains expressing Dr fimbriae...
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublicationInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Alternative treatment approaches of urinary tract infections caused by uropathogenic Escherichia coli strains
PublicationUrinary tract infections (UTIs) are the most widespread and annoying infections affecting millions of people every year annually. The biggest problem of urinary diseases are recurrences, the increasing resistance of uropathogens to commonly used antibiotics, as well as the high health care costs of afflicted persons. Uropathogenic Escherichia coli strains (UPECs) are the most dominant etiologic agent of community-acquired infections...
-
Identification of Antigen 43 in uropathogenic Escherichia coli IH11128 responsible for persistence in the urinary tract
Publication...
-
Role of the disulfide bond in stabilizing and folding of the fimbrial protein DraE from uropathogenic Escherichia coli
PublicationDr fimbriae are homopolymeric adhesive organelles of uropathogenic Escherichia coli composed of DraE subunits, responsible for the attachment to host cells. These structures are characterized by enormously high stability resulting from the structural properties of an Ig-like fold of DraE. One feature of DraE and other fimbrial subunits that makes them peculiar among Ig-like domain-containing proteins is a conserved disulfide bond...
-
Increased Levels of (p)ppGpp Correlate with Virulence and Biofilm Formation, but Not with Growth, in Strains of Uropathogenic Escherichia coli
Publication -
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
The role of uropathogenic Escherichia coli adhesive molecules in inflammatory response- comparative study on immunocompetent hosts and kidney recipients
Publication -
Identification of antigen Ag43 in uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains and defining its role in the pathogenesis of urinary tract infections
PublicationUrinary tract infections (UTIs) caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are among the most common bacterial infectious diseases in the developed world. The urovirulence of UPEC is mainly associated with the surface-exposed fimbrial adhesins and adhesins of the autotransporter (AT) family. The best studied of theses proteins is antigen 43 (Ag43) mediating cell aggregation, adhesion and biofilm development as the causes of...
-
Leukemia and risk of recurrent Escherichia coli bacteremia: genotyping implicates E. coli translocation from the colon to the bloodstream.
PublicationIn patients with leukemia, the portal(s) and reasons for the persistence of an Escherichia coli recurrent bacteremia remain unclear. Adult Hematology Clinic (AHC) databases at the State Clinical Hospital in Gdańsk were reviewed to evaluate the frequency of E. coli bacteremia between 2002 and 2005. Blood and bowel E. coli strains were obtained and the genetic relatedness of the strains was analyzed. The rate of E. coli bacteremia...
-
Patomechanizm zakażeń dróg moczowych wywoływanych przez uropatogenne szczepy E. coli
PublicationZakażenia układu moczowego (ZUM) to jedne z najczęstszych i najbardziej powszechnych infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku nawet 150 milionów ludzi na świecie. Problem z tego typu infekcjami wynika z przewlekłości choroby, nawrotów i wzrastającej lekooporności powodujących je patogenów. Uropatogenne szczepy E. coli (UPEC) są głównym czynnikiem przyczynowym ZUM. Bakterie tej grupy zawierają wiele czynników adhezyjnych...
-
Phage therapy as a novel strategy in the treatment of urinary tract infections caused by E. coli
PublicationUrinary tract infections (UTIs) are regarded as one of the most common bacterial infections affecting millions of people, in all age groups, annually in the world. The major causative agent of complicated and uncomplicated UTIs are uropathogenic E. coli strains (UPECs). Huge problems with infections of this type are their chronicity and periodic recurrences. Other disadvantages that are associated with UTIs are accompanying complications...
-
A surface-exposed DraD protein of uropathogenic Escherichia coli bearing Dr fimbriae may be expressed and secreted independently from DraC usher and DraE adhesin
PublicationOperon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ odpowiedzialny jest za proces bakteryjnej adhezji i inwazji. Operon dra kodujący fimbrie Dr zawiera sześć otwartych ramek odczytu - draA, draB, draC, draD, draP oraz draE. Fimbrie Dr zlokalizowane na powierzchni komórki bakteryjnej, zbudowane są z podjednostek białka DraE. Niewiele wiadomo na temat powierzchniowej ekspresji białka DraD oraz jego roli w procesie biogenezy fimbrii...
-
Comparative analysis of mRNA transcripts of HT-29 cell line expressed in identical quantities for pathogenic E. coli strains UM146 and UM147 with control Escherichia coli Nissle 1917
PublicationAim of study was comparative analysis of mRNA transcripts of HT-29 cell line, expressed in identical quantities for the combination of pathogenic and non-pathogenic Escherichia coli strains. HT-29 confluent monolayers infection with two pathogenic E. coli strains UM146 and UM147 resulted in two sets of mRNA transcripts that were identical with RNA transcripts obtained for non-pathogenic one strain E. coli Nissle 1917. In this study...
-
Synthesis and transport studies of model dipeptides with modified n-terminal amino groups into e. coli k12 mutant strains
Publicationotrzymano na drodze syntezy chemicznej kilka modelowych dipeptydów zawierających n-terminalna guanidynę oraz betainę. zbadano transport tych peptydów do komorek e. coli k12, posiadających zróżnicowane systemy transportowe. wyniki badań potwierdziły brak transportu do komórek bakteryjnych z wykorzystaniem permeaz peptydowych. dodatnio naładowana i silnie polarna grupa aminowa uniemożliwia efektywny transport tych związków do komórek...
-
Letter to the Editor: Complete resonance assignments of the 'donor-strand' AfaD: The afimbrial invasin from Diffusely Adherent E. coli.
PublicationUstalono strukturę NMR rekombiantowego białka AfaD-dsc. Uzyskane wyniki są podstawą do badań rentgenograficznych struktury białek AfaD/DraD.
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublicationZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
Turmeric nanofiber-encapsulated natural product formulation act as a phytogenic feed additive—A study in broilers on growth performance, biochemical indices of blood, and E. coli in cecum
PublicationA phytogenic feed additive (PFA) formulation was prepared with bioactive molecules—curcuminoids, gingerol, and carvacrol by encapsulating in nanofiber isolated from turmeric spent (turmeric nanofiber, TNF). This formulation was completely characterized by scanning electron microscope, ultra performance liquid chromatography, and gas chromatography and evaluated for its efficacy. PFA-encapsulated TNF (PFA@TNF) considerably increased...
-
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublicationEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Test of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2a preservative.
Open Research DataThe dataset contains the results of a single series of determinations of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2 a preservative in the solution of model fluids.During the test, the infected product is inoculated (on chromogenic Coliform Agar) at specified intervals (0 min. [cs2a 0] and after 1 day-24 h of incubation [cs2a...
-
Test of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2b preservative.
Open Research DataThe dataset contains the results of a single series of determinations of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2 b preservative in the solution of model fluids.During the test, the infected product is inoculated (on chromogenic Coliform Agar) at specified intervals (0 min. [cs2b 0] and after 1 day-24 h of incubation [cs2b...
-
urosepsa The metabolomic and genetic characteristics of E.coli strains as a trigger of urosepsis
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to UMO-2018/29/B/NZ7/02489 agreement from 2019-02-06
-
OPUS21 Mechanism of biofilm formation by uropatogenic E. coli producing fimbrial adhesin Dr - studies of proteome and metabolome changes under static and dynamic culture conditions
ProjectsProject realized in Sekcja Finansowa Wydz. Chemiczny according to UMO-2021/41/B/NZ6/03088 agreement from 2021-11-26
-
Shear stress connected with the fluid flow as an important parameter influencing the adhesion, invasion and tissue tropism of the uropathogenic E. coli polyadhesins to the host cells.
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to UMO-2014/13/B/NZ6/00257 agreement from 2015-02-09
-
Discriminating macromolecular interactions based on an impedimetric fingerprint supported by multivariate data analysis for rapid and label-free Escherichia coli recognition in human urine
PublicationThis manuscript presents a novel approach to address the challenges of electrode fouling and highly complex electrode nanoarchitecture, which are primary concerns for biosensors operating in real environments. The proposed approach utilizes multiparametric impedance discriminant analysis (MIDA) to obtain a fingerprint of the macromolecular interactions on flat glassy carbon surfaces, achieved through self-organized, drop-cast,...
-
Józef Kur prof. dr hab.
People -
Beata Krawczyk dr hab.
PeopleBeata Krawczyk, PhD, Professor Academic degrees, education, qualifications: B. Krawczyk earned his master degree in Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1986, and her PhD in Molecular Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1996. Postdoctoral degree (habilitation) in biological sciences in the discipline biology, Faculty of Natural Sciences, University of Szczecin, Szczecin, in 2009. In 2012...
-
Pilicides effectively hinder chaperone-usher interactions in all Gram-negative bacteria
PublicationThe chaperone-usher pathway of adhesive structures biogenesis is highly conserved in all Gram-negative bacteria. Pili are polymers of thousands protein subunits that possess conserved immunoglobuline-like structure denoted by lack of the seventh G strand. The effect of this structural defect is a hydrophobic acceptor cleft. The folding of protein subunits is strictly dependent on the action of specific periplasmic chaperone protein...
-
Aneta Łuczkiewicz dr hab. inż.
People -
Beata Zalewska-Piątek dr hab.
People -
Marcin Olszewski dr hab. inż.
People -
Rafał Piątek dr hab. inż.
People -
Roman Kotlowski dr hab. inż.
People -
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublicationPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
Enzymatic degradation and transport of endothiopeptides into Escherichia coli K12 mutant strains
PublicationZbadano transport trzech otrzymanych na drodze syntezy ditiopeptydów do komórek Escherichia coli K12. Ponadto zbadano szybkość hydrolizy tych związków. Wszystkie peptydy są transportowane przez permeazy, natomiast są bardziej oporne na hydrolizę enzymatyczną w stosunku do naturalnych peptydów.
-
Analizy ilości i jakości odpływu wód deszczowych i roztopowych z kontrolowanej zlewni zurbanizowanej
PublicationIstotnym problemem Gdańska staje się bezpieczeństwo ekologiczne związane ze spływami miejskimi odprowadzanymi bezpośrednio do wód powierzchniowych, często akwenów użyteczności publicznej. W latach 2011÷2013, Katedra Hydrotechniki Wydziału Inżynierii Lądowej i Środowiska Politechniki Gdańskiej, we współpracy z Wojewódzkim Funduszem Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Gdańsku oraz Gdańskimi Melioracjami, podjęła się wdrożenia...
-
Molecular structures of two E-azobenzocrown ethers
PublicationRentgenowska analiza strukturalna monokryształów posłużyła do scharakteryzowania struktury izomerów E dwóch azobenzokoron: 13- i 16-członowej. Oba związki krystalizują w układzie jednoskośnym. W komórce elementarnej, w każdym przypadku znajdują się dwie niezależne cząsteczki, różniące się konformacją, szczególnie łańcucha eterowego. Porównując konformacje ''wolnych'' makrocykli z konformacjami ich kompleksów z jonami metali wskazano,...
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublicationPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
Escherichia coli - zapomniany patogen posocznic
PublicationPrzedstawiono próbę retrospektywnej analizy częstości występowania bakteriemii Gram-ujemnych, wywołanych przez E. coli u chorych hospitalizowanych w ośmiu grupach oddziałów klinicznych SPSK1 ACK AM w Gdańsku w latach 2002-2004. Dokonano oceny częstości występowania bakteriemii o etologii E. coli, liczby zgonów związanych bezpośrednio z posocznicą, analizy potencjalnych wrót zakażenia oraz analizy lekowrażliwości szczepów E. coli...
-
Spam classification methods besed on users e-mail communication graphs
PublicationW artykule poddano analizie grafy zbudowane w oparciu o logi serwerów pocztowych. Węzły grafów reprezentują nadawców i odbiorców wiadomości e-mail natomiast krawędzie przedstawiają procesy wymiany wiadomości e-mail. Analiza grafów pozwala na znalezienie korelacji pomiędzy topologią grafów a relacjami pomiędzy użytkownikami serwisu pocztowego. W oparciu o te relacje zaproponowano algorytm klasyfikujący wymieniane wiadomości e-mail...
-
New Approaches for Escherichia coli Genotyping
PublicationEasy-to-perform, fast, and inexpensive methods of differentiation of Escherichia coli strains beyond the species level are highly required. Herein two new, original tools for genotyping of E. coli isolates are proposed. The first of the developed method, a PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) test uses a highly variable fliC gene, encoding the H antigen as a molecular target. The designing...
-
Analysis of human negotiations for e-business improvements
PublicationW artykule zaproponowano ogólny model negocjacji oraz oparty na nim uproszczony model jakości negocjacji. Zaproponowany model jakości negocjacji umożliwia zdefiniowanie wielu scenariuszy negocjacji i ich ocenę w kategoriach kompletności, efektywności, wydajności i satysfakcji. Przeanalizowano 150 eksperymentów (f2f i czat) w celu określenia wpływu osobowości negocjatorów i strategii negocjacyjnych na ich rezultat.
-
Factors affecting credibility of e-shops in Poland
PublicationArtykuł stanowi kontynuację tematu podjętego w poprzednich pracach autora nt. czynników wpływających na wiarygodność detalicznych sklepów internetowych. Przedstawiono w nim wstępne wyniki badań dokonanych przez autora.
-
Power balance in hydraulic satellite motors supplied with oil and HFA-E emulsion
PublicationMineral oil and HFA-E emulsion are liquids which differ in viscosity, density and lubricant properties. Therefore, supplying hydraulic satellite motors with these liquids, differences between quantity of hydraulic, volumetric and mechanical losses are observed. These losses influence efficiency of conversion of hydraulic energy into mechanical energy and thereby power balance of motors.
-
Trendy w e-usługach
PublicationW artykule przedstawiono trendy w sektorze e-biznesu pokazujące perspektywy zmian w usługach. Zwrócono uwagę jak zmienia się podejście do samego procesu usługi, jak zmienia się sposób świadczenia samej usługi. Autor przedstawia trendy nie tylko związane z zastosowaniem nowoczesnych technologii, ale również związane z otwieraniem nowych segmentów rynku jakimi są np. społeczności. W wyniku analizy przytoczonych przykładów wykorzystania...
-
Influence of Escherichia coli on Expression of Selected Human Drug Addiction Genes
PublicationThe impact of enteric microflora on the expression of genes associated with cocaine and amphetamine addiction was described. Human genome-wide experiments on RNA transcripts expressed in response to three selected Escherichia coli strains allowed for significant alteration (p > 0.05) of the linear regression model between HT-29 RNA transcripts associated with the KEGG pathway:hsa05030:Cocaine addiction after 3 h stimulation with...
-
Resistance of Escherichia coli and Enterococcus spp. to selected antimicrobial agents present in municipal
PublicationIn this study, the susceptibility to erythromycin (E) and to trimethoprim/sulfamethoxazole (SXT) among isolates of Enterococcus spp. and Escherichia coli was tested, respectively. Both fecal indicators were detected and isolated from raw(RW) and treated wastewater (TW) as well as from samples of activated sludge (AS) collected in a local wastewater treatment plant (WWTP). Biodiversity of bacterial community in AS was also monitored...
-
e-mentor
Journals -
A shear stress micromodel of urinary tract infection by the Escherichia coli producing Dr adhesin
PublicationIn this study, we established a dynamic micromodel of urinary tract infection to analyze the impact of UT-segment-specific urinary outflow on the persistence of E. coli colonization. We found that the adherence of Dr+ E. coli to bladder T24 transitional cells and type IV collagen is maximal at lowest shear stress and is reduced by any increase in flow velocity. The analyzed adherence was effective in the whole spectrum of physiological...
-
Proces wytwarzania e-kursu. Studium przypadku.
PublicationArtykuł definiuje proces wytwarzania e-kursu i e-lekcji oraz kolejne jego etapy, zaczynając od okre - ślania celu i odbiorcy, a kończąc na udostępnieniu treści. Na podstawie opisanego procesu przedstawiane jest stu - dium przypadku dla e-kursu prowadzonego na studiach zaocznych na Wydziale ETI Politechniki Gdańskiej na przedmiocie Strategie informatyzacji. Artykuł pokazuje też ewaluację studium przypadku, zarówno na poziomie oceny...
-
Urinary Tract Infections of Escherichia coli Strains of Chaperone-Usher System
PublicationZakażenia dróg moczowych stanowią bardzo poważny problem zdrowotny i ekonomiczny dotyczący milionów ludzi, każdego roku na całym świecie. Najbardziej rozpowszechnionym czynnikiem etiologicznym tego typu infekcji bakteryjnych, obejmujących górne i dolne drogi moczowe, są szczepy E. coli, reprezentujące około 80% przypadków. Uropatogenne szczepy E. coli produkują kilka czynników urowirulentncyh, które można podzielić na dwa główne...
-
E-MEDIACJE JAKO PRZEDSIĘBIORCZA STRATEGIA ROZWIĄZYWANIA KONFLIKTÓW = E-mediation – the entrepreneurial strategy of conflict resolution
PublicationArtykuł dotyczy tematu e-mediacji, które są nowoczesną metodą rozwiązywania konfliktów gospodarczych, zakładającą zastosowanie innowacyjnych rozwiązań informatycznych w procesie zarzadzania konfliktem. Zaprezentowano wyniki badań, które przeprowadzono na grupie polskich przedsiębiorców, by zweryfikować postawy wobec e-mediacji i gotowość korzystania z tego rozwiązania w sytuacjach konfliktowych.
-
Phylogenetic relationship and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from the Reda River and the Oliwski Stream, Northern Poland = Lekooporność i przynależność filogenetyczna szczepów Escherichia Coli izolowanych z rzeki Redy i Potoku Oliwskiego
PublicationThe high abundance of fecal bacteria in surface water is usually related to poor agricultural practice, pollution caused by domesticated and wild animals as well as with septic tank failures. Identification of fecal contamination sources seems to be crucial in order to effectively estimate the inherent risk. In this study, the phylogenetic relationship of 30 isolates of E. coli, originated from surface water, was estimated by employing...
-
Efficient production of Staphylococcus simulans lysostaphin in a benchtop bioreactor by recombinant Escherichia coli.
PublicationLysostaphin is an enzyme with bactericidal activity against Staphylococcus aureus and other staphylococcal species. In spite of many advantages and promising results of preliminary research, the enzyme is still not widely used in medicine, veterinary or as a food preservative. One of the most important factors limiting application of the enzyme in clinical or technological practice is the high costs of its production. In the present...
-
A systematic review on cellular responses of Escherichia coli to nonthermal electromagnetic irradiation
PublicationInvestigation of Escherichia coli under electromagnetic fields is of significance in human studies owing to its short doubling time and human‐like DNA mechanisms. The present review aims to systematically evaluate the literature to conclude causality between 0 and 300 GHz electromagnetic fields and biological effects in E. coli. To that end, the OHAT methodology and risk of bias tool were employed. Exponentially growing cells exposed...
-
Expression of goose parvovirus whole VP3 protein and its epitopes in Escherichia coli cells
PublicationThe aim of this study was the expression of goose parvovirus capsid protein (VP3) and its epitopes in Escherichia coli cells. Expression of the whole VP3 protein provided an insufficient amount of protein. In contrast, the expression of two VP3 epitopes (VP3ep4, VP3ep6) in E. coli, resulted in very high expression levels. This may suggest that smaller parts of the GPV antigenic determinants are more efficiently expressed than the...
-
Oczekiwania stron konfliktu i mediatorów wobec e-mediacji. Czy e-mediacja ma przyszłość?
PublicationArtykuł prezentuje możliwości prowadzenia mediacji – skutecznej i korzystnej, ale rzadko wykorzystywanej w Polsce metody pozasądowego rozstrzygania sporów - z wykorzystaniem profesjonalnej platformy internetowej. Na podstawie badań przeprowadzonych na grupie mediatorów oraz stron konfliktów określono oczekiwania dotyczące prowadzenia e-mediacji i wyzwania, jakie stawia przed mediatorami mediacja on-line.
-
Intra-operative biopsy in chronic sinusitis detects pathogenic Escherichia coli that carry fimG/H, fyuA and agn43 genes coding biofilm formation
PublicationThe aim of this study was to investigate whether or not surgical biopsy of sinus tissue in chronic sinusitis, not responsive to treatment, would detect E. coli. We intended to evaluate E. coli virulence genes, therefore dispute the causal role of such an unusual microorganism in chronic sinusitis, as well as consider effective pathogen-targeted therapy. Patients with E. coli isolated by intra-operative puncture biopsy were included...
-
POTENCJALNE MOŻLIWOŚCI APLIKACJ TECHNIKI E-NOS W DIAGNOSTYCE MEDYCZNEJ=APPLICATION POTENTIALITIES OF E-NOSE TECHNIQUE IN MEDICAL DIAGNOSTICS
PublicationW pracy przedstawiono i omówiono zasadę działania instrumentu analitycznego - elektronicznego nosa (e-nos) zdolnego rozróżnić i sklasyfikować intensywność zapachu. Urządzenia te służą do automatycznej analizy i rozróżniania próbek zapachowych o złożonym składzie, do rozpoznawania ich charakterystycznych właściwości i najczęściej przeznaczone są do szybkiej analizy jakościowej. Dzięki unikatowym właściwościom technika ta znalazła...
-
Tetracycline and ampicillin resistance of Escherichia coli strains of surface water origin: the potential for horizontal transfer of resistance genes = Oporność na tetracyklinę i ampicylinę szczepów Escherichia Coli wyizolowanych z wody powierzchniowej : możliwość horyzontalnego przenoszenia genów oporności
PublicationThe aim of this preliminary study was to assess the occurrence and molecular diversity of tetracycline and ampicillin resistance genes carried by Escherichia coli present in surface water. Bacterial strains were isolated from two watercourses (the Reda River and the Oliwski Stream) that influence the quality of coastal waters in the Gdańsk Bay (Northern Poland) by direct discharge. The bacterial drug susceptibility, tested against...
-
Use of Escherichia coli Nissle 1917 producing recombinant colicins for treatment of IBD patients
PublicationPatients with Crohn’s Disease and ulcerative colitis infected with Adherent-Invasive Escherichia coli strains constitute the largest group among Inflammatory Bowel Disease subjects, when taking into account all known etiological agents of the disease. A possible link between these pathogenic bacteria and inflammation process has gained the confidence in recently published papers. Observed enteric neuroglial cells apoptosis and...
-
Phosphorylation‐mediated regulation of heat shock response in Escherichia coli
PublicationEscherichia coli has two heat shock regulons under the transcriptional control of Esigma(32) and Esigma(E) RNA polymerases. These polymerases control the expression of genes, the products of which are needed for correct folding of proteins in the cytoplasm and the extracytoplasm respectively. In this study, we report that mutations in a tyrosine phosphatase-encoding gene led to decreased activity of these heat shock regulons. The...
-
Characterisation of Escherichia coli isolates from the blood of haematological adult patients with bacteraemia: translocation from gut to blood requires the cooperation of multiple virulence factors
PublicationThe aim of the study was to investigate whether there are unique pathotypes of Escherichia coli capable of transmission from the gastrointestinal tract to the vascular bed. The study included E. coli strains isolated from clinical materials collected from 115 patients suffering from haematologic malignancies diagnosed with bacteraemia. The genotyping techniques established that 89 E. coli isolates from the blood had the same genotype...
-
Struktury wsparcia a efektywność w środowisku e-learningowym
PublicationNarzędzia wykorzystywane do realizowania zajęć w środowisku e-learningowym oferują afordancje umożliwiające wprowadzenie zróżnicowanych struktur wsparcia zapewnianych zarówno przez stronę kursu, materiały edukacyjne, nauczyciela, jak i pochodzących od studentów, zwiększając tym samym efektywność nauczania. Przemyślany układ i kształt zasobów, ich wizualizacja, zintegrowanie tekstu z zadaniami refleksyjnymi oraz pozwalającymi uczącemu...
-
Jakość i bezpieczeństwo oprogramowania systemu E/E/PE .
PublicationPrzedstawiono wymagania dla bezpieczeństwa oprogramowania systemu E/E/PE w cyklu życia według EN 61508 - 3 oraz problemy związane z projektowaniem, budową, weryfikacją i walidacją modułów oprogramowania. Ukazano również problematykę związaną z integrowaniem oprogramowania ze sprzętem i wymaganiami dotyczącymi certyfikacji systemu.
-
Molecular Strategy for Survival at a Critical High Temperature in Eschierichia coli
PublicationThe molecular mechanism supporting survival at a critical high temperature (CHT) in Escherichia coli was investigated. Genome-wide screening with a single-gene knockout library provided a list of genes indispensable for growth at 47°C, called thermotolerant genes. Genes for which expression was affected by exposure to CHT were identified by DNA chip analysis. Unexpectedly, the former contents did not overlap with the latter except...
-
Interdisciplinary e-collaboration tools / Narzędzia interdyscyplinarnej e-współpracy
PublicationW projektach interdyscyplinarnych niezwykle ważnym czynnikiem jest aktywne konsultowanie i bezpośrednie zastosowanie relatywnie nowo powstałej dziedziny zwanej współpracą interdyscyplinarną. Nawiązywanie interdyscyplinarnej współpracy przynosi wiele korzyści, jednakże niejednokrotnie wiąże się z licznymi problemami i niedogodnościami, a także koniecznością ciągłego doszkalania się i rozszerzania kompetencji zawodowych. Na podstawie...
-
Webquest- dobra praktyka w e-Learningu
PublicationW dobie informatyzacji i pokonywania barier wdrażania e-technologii na uczelniach wyższych uważa się, że jedną z najczęściej stosowanych aktywizujących technik nauczania wśród nauczycieli akademickich jest metoda projektu (ang. project-based learning). W niniejszym opracowaniu proponuje się zastosowanie w procesie edukacji na wyższej uczelni, metody webquest. Jest ona dużo rzadziej stosowana w praktyce. Opracowano ją w oparciu...
-
Antibiotic resistance, virulence, and phylogenetic analysis of Escherichia coli strains isolated from free-living birds in human habitats
PublicationWild birds can be colonized by bacteria, which are often resistant to antibiotics and have various virulence profiles. The aim of this study was to analyze antibiotic resistance mechanisms and virulence profiles in relation to the phylogenetic group of E. coli strains that were isolated from the GI tract of wildfowl. Out of 241 faecal samples, presence of E. coli resistant to a cephalosporin (ESBL/AmpC) was estimated for 33 isolates...
-
Tworzenie sieci współpracy uczelni z otoczeniem przy wykorzystaniu zamówień przedkomercyjnych na przykładzie projektu e-Pionier
PublicationAutorzy podjęli temat nowatorskiego podejścia uczelni do zamówień publicznych z wykorzystaniem modelu poczwórnej helisy opartej na zamówieniach przedkomercyjnych (pre-commercial procurement). Celem publikacji jest wskazanie możliwości praktycznego zastosowania takiego podejścia na przykładzie pilotażowego projektu e-Pionier, realizowanego w latach 2017-2020 przez Politechnikę Gdańską we współpracy z innymi uczelniami, instytucjami...
-
E-cohousing
PublicationCohousing, one of the attempts to create housing community, has been successfully practised for many years in many countries. Cohousing creates social bonds. It's a self-creating movement in which everything relies on the community engaged. Oriented ecological cohousing (e-cohousing) teaches responsibility for oneself, the others and the environment.
-
Aktywność amylolityczna ciałek inkluzyjnych izolowanych z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl.
PublicationBadania ekspresji rekombinantowej alfa-amylazy izolowanej z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl wykazały, że około 49 % wytwarzanego enzymu występuje w postaci ciałek inkluzyjnych. Źródłem genu termostabilnej alfa-amylazy był szczep Pyrococcus woesei (DSM 3773). W celu uzyskania aktywnych białek z ciałek inkluzyjnych odwirowane komórki bakterii inkubowano w roztworze CaCl2 i po trawieniu lizozymem...
-
In vitro affinity of Deinococcus radiodurans MutS towards mismatched DNA exceeds that of its orthologues from Escherichia coli and Thermus thermophilus
PublicationThe mismatch binding protein MutS is responsible for the recognition of mispaired and unpaired bases, which is the initial step in DNA repair. Among the MutS proteins most extensively studied in vitro are those derived from Thermus thermophilus, Thermus aquaticus and Escherichia coli. Here, we present the first report on the in vitro examination of DNA mismatch binding activity of MutS protein from Deinococcus radiodurans and confront...
-
Wykorzystanie e-narzędzi w nauczaniu, egzaminacji i certyfikacji Autodesk
PublicationAutoryzowane Centrum Szkolenia Autodesk Politechniki Gdańskiej zostało założone w 1995 roku. Stanowiło odpowiedź na rosnące zainteresowanie zdobywaniem umiejętności obsługi oprogramowania typu CAD wśród studentów i młodych inżynierów. Rosnące zainteresowanie zaowocowało stopniowym wdrażaniem kolejnych narzędzi e-learningowych. Wraz ze zdobyciem statusu Autoryzowanego Akademickiego Partnera Autodesk w 2016 roku pojawiły się nowe...
-
Recurrent bowel-blood translocations of Escherichia coli with the unique virulence characteristics over three-year period in the patient with acute myeloid leukaemia – case report
PublicationIn patients with haematological malignancies, the bowel remains the main source of Escherichia coli bloodstream infections. We present the clinical example of recurrent bowel-blood translocations of E. coli with the unique virulence characteristics in a 55-year-old male with the diagnosis of acute myeloid leukaemia. The virulent factors profile of examined strains confirmed that the co-existence of genes papC, sfa, usp and cnf1,...
-
Crystal structures of (E)-3-(4-hydroxybenzylidene)chroman-4-one and (E)-3-(3-hydroxybenzylidene)-2-phenylchroman-4-one
PublicationThe synthesis and crystal structures of (E)-3-(4-hydroxybenzylidene)chroman-4-one, C16H12O3,I, and (E)-3-(3-hydroxybenzylidene)-2-phenylchroman-4-one,C22H16O3,II, are reported. These compounds are of interest with respect to biological activity. Both structures display intermolecular C—H---O and O—H---O hydrogen bonding, forming layers in the crystal lattice. The crystal structure of compound I is consolidated...
-
Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
PublicationZakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E....
-
Lubricant property and rolling contact fatigue test of oil-in-water emulsion type HFA-E and oil Total Azolla 46 as working liquids in hydraulic systems
PublicationW artykule scharakteryzowano i opisano wyniki badań własności smarnych wody destylowanej, emulsji wodno-olejowej typu HFA-E (1% oleju w wodzie) sporządzonej na bazie koncentratu Isosynth VX110BF, oleju Total Azolla 46 i samego koncentratu Isosynth VX110BF (tylko dla porównania z olejem, emulsją i wodą). W artykule pokazano wyniki badań pittingu z użyciem wody, emulsji i oleju jako środków smarnych. Ponadto w artykule przedstawiono...
-
Regulated assembly of lipopolysaccharide and sensing of its alterations in Escherichia coli
PublicationThis thesis describes mechanism of the regulation of the transcription of the rpoE gene encoding an essential RNA polymerase subunit in Escherichia coli. The RpoE regulates extracytoplasmic stress response regulon and is required to initiate transcription of genes, whose products are involvedin the folding of periplasmic proteins and synthesis and transport of outer membrane components. The transcriptional regulation of the rpoE...
-
Fatal sepsis in a pregnant woman with pyelonephritis caused by Escherichia coli bearing Dr and P adhesins: diagnosis based on postmortem strain genotyping
PublicationW pracy został opisany pierwszy śmiertelny przypadek młodej kobiety w ciąży z powodu przewlekłego zapalenia odmiedniczkowego nerek spowodowany przez szczepy E. coli z fimbriami typu Dr + i P. Badania pośmiertne wykazały, że śmierć nastąpiła z powodu posocznicy do której doszło na skutek zakażenia szczepami E. coli Dr + . Odmiedniczkowe zapalenie nerek w ciąży jest związane z wieloma powikłaniami, w tym ograniczeniem wzrostu płodu,...
-
Molecular and structural basis of inner core lipopolysaccharide alterations in Escherichia coli: incorporation of glucuronic acid and phosphoethanolamine in the heptose region.
PublicationIt is well established that lipopolysaccharide (LPS) often carries nonstoichiometric substitutions in lipid A and in the inner core. In this work, the molecular basis of inner core alterations and their physiological significance are addressed. A new inner core modification of LPS is described, which arises due to the addition of glucuronic acid on the third heptose with a concomitant loss of phosphate on the second heptose. This...
-
A subset of two adherence systems, acute pro-inflammatory pap genes and invasion coding dra, fim, or sfa, increases the risk of Escherichia coli translocation to the bloodstream
PublicationAn analysis of the phylogenetic distribution and virulence genes of Escherichia coli isolates which predispose this bacteria to translocate from the urinary tract to the bloodstream is presented. One-dimensional analysis indicated that the occurrence of P fimbriae and α-hemolysin coding genes is more frequent among the E. coli which cause bacteremia. However, a two-dimensional analysis revealed that a combination of genes coding...
-
E-cohomological Conley index
PublicationIn this thesis we continue with developing the E-cohomological Conley index which was introduced by A.Abbondandolo. In particular, we generalize the index to non-gradient flows, we show that it an possesses additional multiplicative structure and we prove the continuation principle. Then, using continuation principle, we show how the computation of the E-cohomological Conley index can be reduced to the computation of the classical...
-
High yield expression and single step purification of Toxoplasma gondii SAG1, GRA1, GRA7 antigens in Escherichia coli.
PublicationPraca przedstawia metodę uzyskiwania antygenów rekombinowanych Toxoplasmagondii o wysokiej czystości, które można zastosować w immunodiagnostyce. Antygeny T. gondii eksprymowane w komórkach E. coli zawierały polihistydynowedomeny fuzyjne na końcu N i C białka. Pozwalało to na jednoetapowe oczyszczanie białek metodą chromatografii metalopowinowactwa na złożu Ni2+ -IDA-Sepharose. Immunoreaktywność antygenów rekombinowanych...
-
Trust and Distrust in e-Democracy
PublicationIn the digital government research literature, the concept of trust is typically used as a precondition for the adoption of digital technology in the public sector or an outcome of a roadmap leading up to such adoption. The concept plays a central role in many decisions linked to the planning, adoption and management of the public sector technology. In contrast, the concept of distrust is almost neglected in such literature but,...
-
The operation mode of E/E/PE system and its influence on determining and verifying the safety integrity level = Rodzaj pracy systemu E/E/PE i jego wpływ na określanie i weryfikację poziomu nienaruszalności bezpieczeństwa
PublicationNorma PN-EN 61508 wprowadza kryteria probabilistyczne dla wyróżnionych rodzajów pracy systemów E/E/PE, które związane są z poziomami nienaruszalności bezpieczeństwa SIL. Dla systemów sterowania i zabezpieczeń, pracujących w trybie rzadkiego przywołania do działania, kryterium tym jest przeciętne prawdopodobieństwo niewypełnienia funkcji bezpieczeństwa na żądanie PFDavg. W przypadku systemów realizujących funkcje bezpieczeństwa...
-
Trust and Distrust in e-Democracy
PublicationIn the digital government research literature, the concept of trust is typically used as a precondition for the adoption of digital technology in the public sector or an outcome of a roadmap leading up to such adoption. The concept plays a central role in many decisions linked to the planning, adoption and management of the public sector technology. In contrast, the concept of...
-
E-textbook technologies for academics in medical education
PublicationPublic universities in Poland receive fairly limited financial support for creating e-textbooks and lack the appropriate ICT competences among teaching staff, especially in the case of non-technical universities. The authors propose a pedagogical and technological paradigm for e-textbooks in medical education using open source software with minimal IT skills required. Technologies used to develop e-textbooks are connected with:...
-
Uwarunkowania rozwoju e-administracji w Polsce
PublicationCelem opracowania są w szczególności: - Ocena poziomu rozwoju e-administracji w Polsce oraz innych, w szczególności europejskich, krajach w okresie transformacji. - Identyfikacja i ocena wpływu czynników determinujących poziom rozwoju e-administracji. - Wskazanie korzyści wynikających ze stosowania rozwiązań e-administracji oraz barier w ich wdrażaniu. - Identyfikacja problemów i niespójności w planowaniu i realizacji e-usług publicznych. -...
-
Architektoniczne aspekty e-Uczelni
PublicationProces informatyzacji uczelni polega na tworzeniu wirtualnych węzłów funkcjonalnych usprawniających organizację kampusu i dostęp do informacji. Węzły te budowane są w oparciu o specjalne urządzenia elektroniczne oraz odpowiednie oprogramowanie prowadząc tym samym do rozwoju e-uczelni. Z architektonicznego punktu widzenia nie jest to jednak podejście kompleksowe. Istotne jest całościowe potraktowanie struktury kampusu jako ośrodka...
-
Antibiotic resistance and prevalence of class 1 and 2 integrons in Escherichia coli isolated from two wastewater treatment plants, and their receiving waters (Gulf of Gdansk, Baltic Sea, Poland)
PublicationIn this study, antimicrobial-resistance patterns were analyzed in Escherichia coli isolates from raw (RW) and treated wastewater (TW) of two wastewater treatment plants (WWTPs), their marine outfalls (MOut), and mouth of the Vistula River (VR). Susceptibility of E. coli was tested against different classes of antibiotics. Isolates resistant to at least one antimicrobial agent were PCR tested for the presence of integrons. Ampicillin-resistant...
-
Multimedia data mining for e-Commerce.
PublicationPrzedstawiono studium porównawcze metod eksploracji danych dla e-Commerce.Skupiono się na studium przypadku aplikacji medycznych - wyszukiwania przypadków podobnych.
-
Isolation and some properties of the thermostable beta-galactosidase of Pyrococcus woesei expressed in Escherichia coli
PublicationOpracowano metodę izolowania oraz zbadano właściwości enzymu otrzymanego ze szczepu Escherichia coli zawierającego gen kodujący termostabilną beta-ga-laktozydazę z Pyrococcus woesei.
-
E-egzamin - analiza statystyczna wyników
PublicationDnia 4 marca 2008 roku, po raz pierwszy w Polsce, odbył się próbny egzamin gimnazjalny z części matematyczno-przyrodniczej, przeprowadzany drogą elektroniczną, ''E-egzamin 2008''. Organizatorami egzaminu byli: Wyższa Szkoła Humanistyczno-Ekonomiczna i WSiP. Patronat nad projektem objęli: Minister EN i dyrektor Centralnej Komisji Egzaminacyjnej. Nietypowy próbny egzamin gimnazjalny pisało w jednym czasie kilka tysięcy gimnazjalistów...
-
Using Moodle as a Solution to Interdisciplinary E-collaboration Issues
PublicationRapid technological development in recent years has contributed to numerous changes in many areas of life, including education and communication. Establishing interdisciplinary collaboration brings many benefits, however, it is often associated with numerous problems and inconveniences, as well as the need of constant improvement, lifelong learning, professional development (CPD) and finding an effective way of information transferring....
-
Podejście nauczycieli akademickich do rozwoju narzędzi e-learningowych na wyższych uczelniach technicznych
PublicationPlatforma edukacyjna na uczelni wyższej stała się już standardem. Jest wyznacznikiem nowoczesno- ści danej uczelni. Wpływa na jej konkurencyjność. Mimo to, istnieje przekonanie że środowisko nauczycieli akademickich nie jest gotowe do akceptacji nowych środków nauczania. Postanowiono zbadać ten problem. Artykuł zawiera odpowiedź na pytanie jaki stosunek do metod e-nauczania panuje wśród nauczycieli akademickich, nie posiadających...