Filters
total: 25487
filtered: 20466
-
Catalog
- Publications 20466 available results
- Journals 51 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 720 available results
- Inventions 102 available results
- Projects 286 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1826 available results
- Events 601 available results
- Open Research Data 1358 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: rna sequencing
-
Isoform-specific inhibition of DNA topoisomerase II as the mechanism of action of novel anticancer agent C-1305
Publication -
Erratum to: Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publication -
Functional Interfaces, Biological Pathways, and Regulations of Interferon-Related DNA Damage Resistance Signature (IRDS) Genes
Publication -
Genetic response to metabolic fluctuations: correlation between central carbon metabolism and DNA replication in Escherichia coli
Publication -
The Protective Effect of Dabigatran and Rivaroxaban on DNA Oxidative Changes in a Model of Vascular Endothelial Damage with Oxidized Cholesterol
Publication -
The protective effect of dabigatran and rivaroxaban on DNA oxidative changes in a model of vascular endothelial damage with oxidized cholesterol
Publication -
Molecular basis for the bifunctional Uba4–Urm1 sulfur‐relay system in tRNA thiolation and ubiquitin‐like conjugation
Publication -
Comparison of antioxidant enzyme activities and DNA damage in chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes exposed to vanadium
Publication -
Liver Cirrhosis in Chronic Hepatitis B Patients Is Associated with Genetic Variations in DNA Repair Pathway Genes
Publication -
Targeted DNA oxidation by LSD1–SMAD2/3 primes TGF-β1/ EMT genes for activation or repression
Publication -
DNA strand breaks induced by nuclear hijacking of neuronal NOS as an anti-cancer effect of 2-methoxyestradiol
Publication -
DNA adduct formation by C-1748, a potent antitumor 4-methyl-1-nitroacridine of lowered toxicity.
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. W porównaniu do macierzystych 1-nitroakrydyn związki te wykazują obniżoną toksyczność i podwyższoną aktywność przeciwnowotworową. Wiodąca pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyna o symbolu C-1748 jest obecnie w przygotowaniu do I fazy badań klinicznych w leczeniu raka okrężnicy. Wprowadzenie elektrodonorowej grupy metylowej w...
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublicationDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Influence of G2 arrest on the cytotoxicity of DNA topoisomerase inhibitorstoward human carcinoma cells with different p53 status
PublicationRola bloku G2 w efekcie cytotoksycznym inhibitorów DNA topoizomeraz w stosunku do ludzkich komórek rakowych różniących się funkcjonalnością białka p53.
-
Cross-talk between DNA damage and cell survival checkpoints during G2 and mitosis: pharmacological implications
PublicationW pracy wyjaśnialiśmy rolę surwiwiny w ochronie komórek w czasie przejścia między G2 i mitozą, traktowanych związkiem uszkadzającym DNA. Jako model komórkowy wybraliśmy komórki ludzkiej białaczki MOLT-4, które wykazują zwiększoną ekspresję białka surwiwiny i niefunkcjonalnym p53. Ekspozycja tych komórek na melfalan, klasyczny związek uszkadzający DNA, prowadzi do uruchomienia punktu kontrolnego w G2 i zablokowania progresji cyklu...
-
The interactions of monomeric acridines and unsymmetrical bisacridines (UAs) with DNA duplexes: an insight provided by NMR and MD studies
PublicationMembers of a novel class of anticancer compounds, exhibiting high antitumor activity, i.e. the unsymmetrical bisacridines (UAs), consist of two heteroaromatic ring systems. One of the ring systems is an imidazoacridinone moiety, with the skeleton identical to the structural base of Symadex. The second one is a 1-nitroacridine moiety, hence it may be regarded as Nitracrine’s structural basis. These monoacridine units are connected...
-
Identification and characterization of single-stranded DNA-binding protein from the facultative psychrophilic bacteria Pseudoalteromonas haloplanktis
PublicationSingle-stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in DNA metabolism such as DNAreplication, repair, and recombination, and is essential for cell survival. This study reports on the ssb-likegene cloning, gene expression and characterization of a single-stranded DNA-binding protein of Pseudoal-teromonas haloplanktis (PhaSSB) and is the first report of such a protein from psychrophilic microorganism.PhaSSB possesses...
-
Virtual engineering process (VEP): a knowledge representation approach for building bio-inspired distributed manufacturing DNA
PublicationThe objective of this research is to provide a user-friendly and effective way of representing engineering processes for distributed manufacturing systems so that they can develop, accumulate and share knowledge. The basic defini-tion and principle of the approach is introduced first and then the prototype version of the system is developed and demonstrated with case studies, which verify the feasibility of the proposed approach....
-
Fast Multi-Objective Optimization of Narrow-Band Antennas Using RSA Models and Design Space Reduction
PublicationComputationally efficient technique for multi-objective design optimization of narrow-band antennas is presented. In our approach, the corrected low-fidelity antenna model (obtained through coarse-discretization EM simulations) is enhanced using frequency scaling and response correction, sampled, and utilized to obtain a fast response surface approximation (RSA) antenna surrogate. The RSA model is constructed in the reduced design space....
-
Wczesne modele opisujące uszkodzenia nici DNA pod wpływem działania czynników chemicznych oraz promieniowania
PublicationOd wielu lat kwantyfikacja uszkodzeń DNA, wywołanych przez różne rodzaje promieniowania korpuskularno-falowego, jak i związków chemicznych, jest przedmiotem szerokich badań teoretycznych i eksperymentalnych. Badania te, mając na celu szczegółowe i dogłębne poznanie mechanizmów powstawania uszkodzeń wspomagają jednocześnie rozwój nowoczesnych terapii nowotworowych. Wstępne pomiary wykazały, że wiele z tych czynników może prowadzić...
-
Support interlinking of design and process planning by set of experience knowledge structure and decisional DNA: Conceprual Approach
PublicationKoncepcja wspomagania planowania procesow p-rzy pomocy SOEKS oraz Decyzjnego DNA.
-
Implementing fuzzy logic to generate user profile in decisional DNA television: the concept and initial case study
PublicationIn the paper the concept and case study of a novel approach that generates a television user's profile utilizing principles of fuzzy logic is presented.
-
Effects of Salvia officinalis and Thymus vulgaris on oxidant-induced DNA damage and antioxidant status in HepG2 cells
PublicationSalvia officinalis (SO) and Thymus vulgaris (TV) are medicinal plants well known for their curative powers. However, the molecular mechanisms responsible for these abilities of sage and thyme have not been fully understood yet. In this study we investigated the composition and the quantitative estimation of plant extracts, the protective effects of plant extracts against hydrogen peroxide- and 2,3-dimethoxy-1,4 naphthoquinone-induced...
-
Analysis of the influence of polystyrene microplastics and their derivatives on the DNA of human colon epithelial cells HT29 with the comet assay
PublicationWe have been using plastic for almost a century and nowadays a lot of them circulates as pollutants in the environment and still defragmenting to micro and nanoscale. The exposition through the food chain and its precise impact on human health is still not clear. In our study, we tested real food packaging after contact with food products and real thermoinsulation and environmental samples of polystyrene in different model liquids,...
-
Photoinduced electron transfer in 5-bromouracil labeled DNA. A contrathermodynamic mechanism revisited by electron transfer theories
PublicationThe understanding of the 5-bromouracil (BrU) based photosensitization mechanism of DNA damage is of large interest due to the potential applications in photodynamic therapy. Photoinduced electron transfer (ET) in BrU labeled duplexes comprising the 50 -GBrU or 50 -ABrU sequence showed that a much lower reactivity was found for the 50 -GBrU pattern. Since the ionization potential of G is lower than that of A, this sequence selectivity...
-
Catalytic Mechanism of Non-Target DNA Cleavage in CRISPR-Cas9 Revealed by Ab Initio Molecular Dynamics
PublicationCRISPR-Cas9 is a cutting-edge genome editing technology, which uses the endonuclease Cas9 to introduce mutations at desired sites of the genome. This revolutionary tool is promising to treat a myriad of human genetic diseases. Nevertheless, the molecular basis of DNA cleavage, which is a fundamental step for genome editing, has not been established. Here, quantum–classical molecular dynamics (MD) and free energy methods are used...
-
The effects of different aeration modes on ammonia removal from sludge digester liquors in the nitritation–anammox proces
PublicationThe aim of this study was to determine the impact of continuous and intermittent aeration on the rate of ammonia removal in the combined nitritation–anammox process. This process was run in two parallel sequencing batch reactors (SBRs), with a working volume V = 10 L, treating sludge digester liquors from the Gdansk (Poland) wastewater treatment plant (WWTP). The ammonia oxidizing bacteria were cultivated from activated sludge...
-
Probiotic potential of Bacillus Isolates from Polish Bee Pollen and Bee Bread
PublicationThe main goal of this study was the evaluation of the probiotic potential of 10 Bacillus spp. strains isolated from 5 bee bread and 3 bee pollen samples. The antagonistic interaction with Staphylococcus aureus and Escherichia coli was a primary criterion for the preliminary selection of the isolates. Three out of ten strains—PY2.3 (isolated from pollen), BP20.15 and BB10.1 (both isolated from bee bread)—were found to be possible...
-
An optimized dissolved oxygen concentration control in SBR with the use of adaptive and predictive control schemes
PublicationThis paper addresses the problem of optimizing control of the aeration process in a water resource recovery facility (WRRF) using sequencing batch reactor (SBR), one that affects the efficiency of wastewater treatment by stimulating metabolic reactions of microorganisms through dissolved oxygen (DO) level control, and accounts for the predominant part of operating costs. Two independent approaches to DO control algorithm design...
-
Personalized prediction of the secondary oocytes number after ovarian stimulation: A machine learning model based on clinical and genetic data
PublicationControlled ovarian stimulation is tailored to the patient based on clinical parameters but estimating the number of retrieved metaphase II (MII) oocytes is a challenge. Here, we have developed a model that takes advantage of the patient’s genetic and clinical characteristics simultaneously for predicting the stimulation outcome. Sequence variants in reproduction-related genes identified by next-generation sequencing were matched...
-
Bacterial Community Structures in Freshwater Polar Environments of Svalbard
PublicationTwo thirds of Svalbard archipelago islands in the High Arctic are permanently covered with glacial ice and snow. Polar bacterial communities in the southern part of Svalbard were characterized using an amplicon sequencing approach. A total of 52,928 pyrosequencing reads were analyzed in order to reveal bacterial community structures in stream and lake surface water samples from the Fuglebekken and Revvatnet...
-
Achieving Efficient and Stable Deammonification at Low Temperatures—Experimental and Modeling Studies
PublicationThe short-term effects of temperature on deammonification sludge were evaluated in a laboratory-scale sequencing batch reactor (SBR). Mathematical modeling was used for further evaluations of different intermittent aeration strategies for achieving high and stable deammonification performance at decreasing temperatures. As for the biomass cultivated at high temperatures (e.g., 30 C), a higher temperature dependency (the adjusted...
-
Wpływ podwyższonych temperatur na napawane warstwy na bazie kobaltu = The elevated temperatures influence on the cobalt base cladding layer
Publicationw pracy przeanalizowano wpływ temperatur utleniania (850, 950 i 110 stopni C) na mikrostrukturę i twardośc napawanych plazmowo warstw zykonanych z proszku na bazie kobaltu zdodatkiem 28,8% chromu, 4,9% wolframu, 2,2% niklu, 2,09% żelaza, 1,2% krzemu i 1,2% węgla. W wyniku utleniania na powierzchni napoiny powstaje warstwa tlenku chromu stanowiaca dobrą ochronę w niższych temperaturach, jednak w temperaturach wyższych ulega ona...
-
Wpływ wezbrań sztormowych morza na skład chemiczny płytkich wód podziemnych w rejonach nadmorskich na przykładzie Ustki
PublicationW artykule przedstawiono przykład intruzji wód morskich do ujściowych odcinków rzek Pomorza. Zaprezentowano zmiany składu chemicznego wód podziemnych zachodzące wskutek intruzji wód morskich. Oceniono zmienność czasową i przestrzenną składu chemicznego wód podziemnych.
-
Konkurencyjność polskiego eksportu artykułów przemysłowych na rynku unijnym w latach 1995-2003 - analiza na poziomie mezo
Publication -
Wpływ zmian w strukturze sieci ulicznej miasta na efektywność funkcjonowania transportu na przykładzie planowanej obwodnicy Olsztyna
PublicationW referacie przedstawiono wyniki analiz, które przeprowadzono w celu określenia związków pomiędzy zmianami struktury sieci ulicznej a jej sprawnością i efektywnością zastosowanych rozwiązań. W symulacjach przeprowadzonych w ramach niniejszej pracy, uwzględniono jeden ze sposobów przekształcania sieci, jakim jest jej rozbudowa w celu wyprowadzenia ruchu tranzytowego poza obszary śródmiejskie miast na przykładzie planowanej Obwodnicy...
-
Przewidywanie zmian krajobrazowych w gospodarowaniu przestrzenią : z wykorzystaniem ocen oddziaływania na środowisko na przykładzie transportu drogowego
PublicationPraca dotyczy prognozowania skutków pojawiających się w krajobrazie w wyniku złożonych procesów gospodarowania przestrzenią. Temat uznano za ważny i aktualny, gdyż wiedza na temat charakteru, wielkości i znaczenia zmian krajobrazowych jest podstawą dla właściwej ochrony i kształtowania krajobrazu, poddawanego nieustannej i silnej presji inwestycyjnej. Niska skuteczność systemu planowania przestrzennego, odpowiedzialnego za zrównoważony...
-
Wykorzystanie techniki emisji akustycznej w ocenie procesów korozyjnych poszycia zbiorników na produkty ropopochodne na statkach morskich
PublicationW pracy przedstawiono zostaną podstawowe informacje związane z zastosowaniem metody Emisji Akustycznej (EA) do oceny procesów korozyjnych zachodzących w zbiornikach ładunkowych statków przeznaczonych do transportu ropy naftowej. Opisana zostanie metoda EA jako narzędzie do lokalizacji źródeł korozji, podstawowe procesy korozyjne zachodzące w zbiornikach ładunkowych tankowców, wybrane wyniki pomiarów EA na jednostkach pływających...
-
Ekspertyza techniczna dotycząca określenia wpływu drgań dynamicznych na konstrukcję chłodni na terenie zakładu Mondi w Świeciu
PublicationPrzedmiotem ekspertyzy było wykonanie badań określających wpływ drgań dynamicznych spowodowanych pracą wentylatorów na konstrukcję budynku chłodni.
-
WPŁYW JAKOŚCI DANYCH HYDROLOGICZNYCH NA OSZACOWANIE ODPŁYWU ZE ZLEWNI MIEJSKIEJ NA PRZYKŁADZIE POTOKU STRZYŻA W GDAŃSKU
PublicationKontrola oraz prognozowanie reakcji cieków powierzchniowych na nawalne epizody deszczowe, lub gwałtowne roztopy nabiera kluczowego znaczenia w aspekcie bezpieczeństwa przeciwpowodziowego zlewni zurbanizowanych. Bardzo dobrym przykładem zarówno problematycznego, jak i niosącego realne zagrożenie dla infrastruktury miejskiej cieku, jest Potok Strzyża w Gdańsku. W latach 2011–2013 realizowano budowę sieci posterunków kontrolnych w...
-
Opracowanie i wprowadzenie nowoczesnego systemu utrzymania ruchu urządzeń opartego na strategii planowo – zapobiegawczej na obiekcie offshore
PublicationW pracy przedstawiono metodykę utrzymania ruchu maszyn i urządzeń na obiekcie offshore. Opracowany autorski system utrzymania ruchu, który został wdrożony na morskiej platformie wydobywczej „Petrobaltic” gdzie do przesyłu i przetwarzania danych wykorzystano dostępną infrastrukturę informatyczną. Założenia realizowano z wykorzystaniem metod naukowych takich jak analiza case study, metody eksperckie i inne. Pracę zrealizowano w ośmiu...
-
Analiza kontaktu wód podziemnych i powierzchniowych na podstawie badań ich jakości na młodoglacjalnym obszarze Pojezierza Kaszubskiego.
PublicationArtykuł prezentuje badania przeprowadzone na obszarze młodoglacjalnym Polski północnej, jakim są Wzgórza Szymbarskie, należące do Pojezierza Kaszubskiego. Rejon Wzgórz Szymbarskich jest obszarem zasilania uformowanego tu wielopiętrowego systemu wodonośnego. Do pełnego rozpoznania krążenia wód podziemnych istotna była identyfikacja lokalnych systemów wód podziemnych i ich powiązania z wodami powierzchniowymi. W tym celu wykonano...
-
ZMIANY TEMPERATURY POWIETRZA NA MORZACH ARKTYKI ROSYJSKIEJ I ICH KONSEKWENCJE DLA ŻEGLUGI NA PÓŁNOCNEJ DRODZE MORSKIEJ
PublicationPraca omawia zmiany średniej miesięcznej temperatury powietrza na morzach Arktyki Rosyjskiej w latach 1988-2013. Wartości średnie wieloletnie z tego okresu porównano z danymi podawanymi w locjach rosyjskich dla okresu 1936-1987. Stwierdzono, że w badanym okresie na wszystkich badanych stacjach doszło do wzrostu temperatury powietrza. Największy wzrost miał miejsce w sezonie chłodnym (o 1,5-2 deg). W sezonie ciepłym wzrosty były...
-
Błędy w działaniach zarządczych ukierunkowanych na kryzys w podmiotach leczniczych i ich wpływ na jakość usług
PublicationW niniejszym opracowaniu zaprezentowano podstawowe aspekty doskonalenia jakości w podmiotach leczniczych. Na podstawie przychodni zidentyfikowano mozlwie błędy związane z działaniami zarządczymi ukierunkowanymi na kryzys a także powiązania i ich wpływ na jakość świadczenia usługi zdrowotnej.
-
Wpływ modelu przepływu powietrza w budynku na dokładność prognozowania zapotrzebowania budynku na ciepło: Porównanie dokładności prognozowania
PublicationTo kontynuacja artykułu, w którym omówiono dwie różne metody obliczania efektywności energetycznej budynków. Druga część artykułu przedstawia analizę wyników numerycznych zużycia ciepła w budynku referencyjnym z danymi rzeczywistymi, zebranymi w okresie grzewczym w latach 2010/2011. W artykule ukazano wpływ sposobu obliczania ilości wymienianego powietrza wentylacyjnego w budynkach mieszkalnych na zużycie ciepła do ogrzewania...
-
JEDNORAZOWE DOTACJE NA PODJĘCIE DZIAŁALNOŚCI GOSPODARCZEJ NA PRZYKŁADZIE DOTACJI UDZIELANYCH PRZEZ POWIATOWY URZĄD PRACY W GDYNI
PublicationW artykule dokonano opisu możliwości uzyskania dofinansowania w ramach środków pochodzących z Funduszu Pracy przyznawanych przez urzędy pracy. Tego typu jednorazowe i bezzwrotne wsparcie należy do stosunkowo łatwo dostępnych form finansowania nowo powstałych przedsiębiorstw zakładanych przez osoby bezrobotne. Niemniej jednak uzyskanie dotacji, wynoszącej nawet sześciokrotność przeciętnego wynagrodzenia w gospodarce narodowej, wymaga...
-
Wpływ modelu przepływu powietrza w budynku na dokładność prognozowania zapotrzebowania budynku na ciepło: Porównanie dokładności prognozowania
PublicationArtykuł, w którym omówiono dwie różne metody obliczania efektywności energetycznej budynków. Druga część artykułu przedstawia analizę wyników numerycznych zużycia ciepła w budynku referencyjnym z danymi rzeczywistymi, zebranymi w okresie grzewczym w latach 2010/2011. W artykule ukazano wpływ sposobu obliczania ilości wymienianego powietrza wentylacyjnego w budynkach mieszkalnych na zużycie ciepła do ogrzewania i wentylacji.
-
ZINTEGROWANE ZARZĄDZANIE STREFĄ PRZYBRZEŻNĄ ORAZ URBANISTYKA – PROJEKT NOWYCH SPECJALNOŚCI NA KIERUNKU GOSPODARKA PRZESTRZENNA NA POLITECHNICE GDAŃSKIEJ
PublicationNa studiach II stopnia na kierunku gospodarka przestrzenna na Wydziale Architektury Politechniki Gdańskiej w 2017 r. otwierane są dwie specjalności: urbanistyka i zintegrowane zarządzanie strefą przybrzeżną. Trzon programu studiów dla obu specjalności jest wspólny i oparty na dotychczasowych standardach kształcenia na tym kierunku. Specjalność zintegrowane zarządzanie strefą przybrzeżną jest odpowiedzią na konieczność wprowadzenia...
-
Wykorzystanie ulg podatkowych przez przedsiębiorców na przykładzie ulgi na działalność innowacyjną... w województwach łódzkim i dolnośląskim
PublicationArtykuł opisuje zagadnienia związane z polską polityką podatkową w zakresie ulg i zwolnień podatkowych przyznawanych przedsiębiorcom w zakresie szerokorozumianej działalności badawczo-rozwojowej, w tym na inicjatywy innowacyjne. Celem niniejszej publikacji jest ocena prowadzonej polityki preferencji podatkowych w stosunku do ww. projektów podejmowanych przez przedsiębiorców ze szczególnym uwzględnieniem stopnia wykorzystania ulg...
-
Wpływ mimośrodów na nośność węzłów dźwigarów kratownicowych wykonanych z kształtowników giętych na zimno o przekrojach otwartych
PublicationW ostatnich latach można zaobserwować bardzo dynamiczny rozwój konstrukcji stalowych wykonanych z kształtowników giętych na zimno o przekrojach poprzecznych otwartych. Pomimo szerokiego zastosowania tych elementów w różnego typu konstrukcjach stalowych, w tym dźwigarów kratownicowych, oraz pomimo faktu, że w ostatnich latach w tej dziedzinie wciąż pojawiają się nowe badania i normy, nadal nie wszystkie aspekty pracy tego typu konstrukcji...