Filters
total: 28024
filtered: 21266
-
Catalog
- Publications 21266 available results
- Journals 81 available results
- Conferences 5 available results
- Publishing Houses 6 available results
- People 735 available results
- Inventions 103 available results
- Projects 305 available results
- Laboratories 19 available results
- Research Teams 44 available results
- Research Equipment 11 available results
- e-Learning Courses 1877 available results
- Events 601 available results
- Open Research Data 2971 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: AMPLIFIKACJA, NASBA, PCR, RNA
-
A New Double Digestion Ligation Mediated Suppression PCR Method for Simultaneous Bacteria DNA-Typing and Confirmation of Species: An Acinetobacter sp. Model
PublicationWe have designed a new ddLMS PCR (double digestion Ligation Mediated Suppression PCR) method based on restriction site polymorphism upstream from the specific target sequence for the simultaneous identification and differentiation of bacterial strains. The ddLMS PCR combines a simple PCR used for species or genus identification and the LM PCR strategy for strain differentiation. The bacterial identification is confirmed in the...
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublicationOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublicationW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Identification of Leaf Rust Resistance Genes in Selected Wheat Cultivars and Development of Multiplex PCR
Publication -
Nested PCR for the detection of Aspergillus species in maxillary sinus samples of patients with chronic sinusitis
Publication -
PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera
PublicationFungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based...
-
A hypothesis for GPCR activation
Publication -
Zakażenia bakteryjne w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego - ocena przydatności diagnostyki molekularnej opartej o technikę PCR. Bacterial infection in chronic otitis media - assessment of usefulness of molecular diagnostic based in PCR method.
PublicationIdentyfikacja zakażeń w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego jest trudna, o czym świadczą wysokie odsetki ujemnych wyników badań bakteriologicznych. Przyczyną tego jest trudność w uzyskiwaniu wiarygodnego materiału do badań oraz stosunkowo niska czułość klasycznych metod diagnostycznych. Amplifikacja bakteryjnego DNA techniką PCR jest badaniem, które może przyczynić się do zwiększenia efektywności i czułości badań bakteriologicznych....
-
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
PublicationW celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów....
-
Application of PCR-HRM method for microsatellite polymorphism genotyping in the LDHA gene of pigeons (Columba livia)
Publication -
The use of a one-step PCR method for the identification of Microsporum canis and Trichophyton mentagrophytes infection of pets
PublicationIntroduction: Dermatophytes are a closely related group of keratinophilic fungi. They encompass important etiological agents of superficial fungal infections. These fungi are able to invade keratinized tissues of humans and animals, causing dermatophytosis (ringworm) of hair, nails or skin. The aim: Traditional diagnostics of ringworm is based on morphological identification of cultured fungi and is time-consuming. Materials and methods:...
-
Evaluation of possibilities of genotyping of Candida glabrata clinical isolates with RAPD-PCR method and microsatellite analysis
PublicationThe aim of the study was to compare the discriminatory power of RAPD-PCR method using RSD10 primer and microsatellite (GACA)4 analysis for genotyping clinical isolates of C. glabrata. Isolates were received from patients of two Polish hospitals: Children's Memorial Health Institute in Warsaw (n=17) and Medical University of Gdansk (n=37). Species identification was confirmed by two phenotypic methods: growth on chromagar plates...
-
New PCR test for detection of Candida glabrata based on the molecular target chosen by the RAPD technique
PublicationRapid, reliable diagnosis is a necessary condition for the successful treatment of infections. Such diagnostic assays are continually being developed. #e paper presents a method for selecting the molecular target for PCR-based diagnostics based on the comparison of RAPD patterns. A sequence encoding Candida glabrata CBS138 hypothetical protein was selected. The limit of detection for PCR and real-time PCR reactions with DNA extracted...
-
PCR amplification with primers based on IS2404 and GC-rich repeated sequence reveals polymorphism in Mycobacterium ulcerans
PublicationOpracowano prostą w wykonaniu metodę genotypowania szczepów bakterii z gatunku Mycobacterium ulcerans. Polimorfizm genetyczny 32 badanych izolatów Mycobacterium ulcerans odzwierciedla ich geograficzne pochodzenie z rejonów Afryki Centralnej, Ameryki Południowej i Łacińskiej, Azji Południowo-Wschodniej, Malezji oraz Australii.
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublicationApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
Stability Investigation of the PCM Nanocomposites
PublicationEnsuring the stability is a key issue to be solved for the technical application of nanocomposites. In this work, fatty acid P1801 served as base phase change material (PCM)P1801, and its main ingredients are palmitic acid (58%) and stearic acid (38%). Titania (TiO2) and alumina (Al2O3) with mass concentrations of 1% and 5% were selected as nanoparticles, while polyvinylpyrrolidone (PVP) or oleic acid (OA) with mass concentrations...
-
Stability investigation of the PCM nanocomposites
PublicationIn present study was showed the results of research the stability of nanoPCMs in terms of types and concentrations of surfactant used. For stearic acid has been added PVP or oleic acid in concentrations of 0%, 5% and 10%. Nanoparticles TiO2 and Al-2O3 in concentration of 1% were chosen to be researched in this test. The mixing of nanocomposites has been done in an ultrasonic scrubber in which the samples were placed for 45 mins....
-
Analiza właściwości emiterów LCR
PublicationOd wielu lat pojawiają się publikacje dotyczące konstrukcji emiterów służących do wypromieniowania energii pola elektromagnetycznego z układów, w których są wytwarzane impulsy prądowe o krótkim czasie trwania (rzędu ns lub µs) i znaczącej wartości szczytowej (rzędu MA). Tego rodzaju emitery nazywane są w języku angielskim Large Current Radiators (LCR). Budowa emitera LCR powinna zapewniać możliwie niewielką indukcyjność (rzędu...
-
Species - specific detection of the toxic mushrooms Amanita virosa and Amanita verna by PCR amplification of the gpd gene fragment
PublicationZaprojektowano dwie pary starterów do reakcji PCR, które umożliwiają gatunkowo specyficzną amplifikację unikalnych fragmentów genów gpd dla dwóch grzybów kapeluszowych: muchomora wiosennego (Amanita verna) i muchomora jadowitego (Amanita virosa).
-
Elektrochemiczny czujnik na bazie cieczy jonowej do oznaczania par benzaldehydu
PublicationW pracy przedstawiono prototypowy, laboratoryjny, elektrochemiczny czujnik do oznaczania par benzaldehydu w argonie. Cieczą jonową testowaną jako elektrolit i środowisko reakcji redox była: bis(trifluorometylosulfonylo)imidek 1-butylo,3-metyloimidazolinowy ([BMIM][Tf2N]). W pomiarach użyto komercyjnych elektrod firm: DropSens Co. i BVT Technologies. Walidacji poddano dwa parametry metrologiczne czujnika: granicę wykrywalności i...
-
Współpraca w handlu na przykładzie strategii ECR i systemu EDI
PublicationW pracy przedstawiono współczesne trendy w handlu. Szczególnąuwagę poświęcono budowie partnerstwa między przedsiębiorstwamihandlowymi i ich dostawcami. Jako przykład współpracy, a właściwiemożliwości jej tworzenia, opisano strategie ECR i system EDI. Obydwa terozwiązania bazują na technologiach informatycznych i są coraz częściejwykorzystywane we współczesnym handlu jako źródło przewagikonkurencyjnej.
-
Złożone oddziaływanie smarów na własności warstw wierzchnich stalowych par ciernych
PublicationWęglowodory zawarte w smarach w specyficzny sposób działają na elementy par ciernych wykonane z metali i ich tlenków, będących katalizatorami. Znanymi katalizatorami są: żelazo, nikiel, platyna i pallad. W smarowanych, stalowych parach ciernych zachodzi katalityczna, chemisorbcyjna dysocjacja węglowodorów zawartych w smarze. Opisano badania wpływu tej dysocjacji na sprężyste i tłumiące własności próbek stalowych. Wynik tych badań...
-
Highly thermostable RadA protein from the archaeon Pyrococcus woesei enhances specificity of simplex and multiplex PCR assays
Publication -
Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification
PublicationW tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.
-
Isolation of Human Progenitor Epidermal Cells on Collagen Type IV and Analysis of Their Markers with Flow Cytometry and PCR Methods
PublicationEpidermal stem cells, located in the skin, together with keratinocytes are transplanted in regenerative therapies, e.g., for the treatment of burns or other wounds. Here, we describe the protocol of their enzymatic isolation from human skin. It includes separation of the epidermis form the dermis by incubation with dispase followed by cell isolation for epidermis by digestion with trypsin. Cell isolated with this method can be...
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublicationZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...
-
Metal dusting in CCR platforming unit
PublicationPrzedstawiono mechanizm pylenia metalu w stali 9Cr-1Mo w instalacji platformingu CCR, na postawie badań rury podgrzewacza wsadu po 10 latach pracy, przy temperaturze metalu koło 600C. W badaniach wykorzystano techniki elektronowej mikroskopii skaningowej, dyfrakcji rentgenowskiej i mikroanalizy rentgenowskiej. Wykazano, że dyfuzji wegla w głąb stali toarzyszy odrdzeniowa dyfuzja pierwiastków węglikotwórczych - chromu i molibdenu....
-
Regularization as quantization in reducible representations of CCR
PublicationOpis kwantowego pola elektromagnetycznego przy pomocy redukowalnych reprezentacji CCR prowadzi do automatycznej regularyzacji teorii. Sformułowanie jest jawnie relatywistycznie współzmiennicze. Przeanalizowano - jako przykład - pola kwantowe wytwarzane przez klasyczne źródła.
-
Metal dusting in CCR platforming unit
PublicationPrzedstawiono mechanizm pylenia metalu w stali 9Cr-1Mo w instalacji platformingu CCR, na postawie badań rury podgrzewacza wsadu po 10 latach pracy, przy temperaturze metalu koło 600C. W badaniach wykorzystano techniki elektronowej mikroskopii skaningowej, dyfrakcji rentgenowskiej i mikroanalizy rentgenowskiej. Wykazano, że dyfuzji wegla w głąb stali toarzyszy odrdzeniowa dyfuzja pierwiastków węglikotwórczych - chromu i molibdenu....
-
PCA based Fault Tolerant MPC
PublicationThis chapter presents a Fault Tolerant - Model Predictive Control (FT-MPC) schemes for sensor faults accommodation. A Fault Detection and Isolation (FDI) Unit, which is an integral part of FT-MPC system, is based on the Principal Component Analysis (PCA) method. Introduced approach enables efficient bias and drift faults accommodation in single, as well as simultaneous faults case. Simple simulation exercise is presented.Rozdział...
-
Metal dusting in Platforming CCR furnaces
PublicationPrzedstawiono charakterystykę zjawiska spylania metalu w stali chromowo-molibdenowej 9Cr-1Mo eksploatowanej w piecach instalacji Platformingu CCR w środowisku odsiarczonej benzyny cięzkiej i gazu wodorowego o temperaturze 500C, przy temperaturze metalu 600C.
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublicationOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublicationW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
PCR-Based Genotyping of Mycobacterium tuberculosis with New GC-Rich Repeated Sequences and IS6110 Inverted Repeats Used as Primers.
PublicationW pracy przedstawiono nową metodę genotypowania Mycobacterium tuberculosis. Zastosowanie oligonukleotydu Mtb1 5'-CCG-GCG-GGG-CCG-GCG-G lub Mtb2 5'-CGG-CGG-CAA-CGG-CGG-C wraz z oligonukleotydami specyficznymi do terminalnych sekwencji elementu insercyjnego IS6110 pozwala na różnicowanie szczepów Mycobacterium tuberculosis w metodzie PCR. Opracowana metoda może być wykorzystana w badaniach epidemiologicznych gruźlicy.
-
Evaluation of a novel method based on amplification of DNA fragments surrounding rare restriction sites (ADSRRS-figerprinting) for typing strains of vancomycin resistant Enterococcus faecium.
PublicationBadania objęły wankomycyno oporne szczepy Enterococcus faecium izolowane od pacjentów oddziału Hematologii Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że ADSRRS-fingerprinting jest metodą szybką o dużym potencjale różnicującym i dużej powtarzalności w badaniach epidemiologicznych.
-
C421 allele-specific ABCG2 gene amplification confers resistance to the antitumor triazoloacridone C-1305 in human lung cancer cells
PublicationGen ABCG2 charakteryzuje polimorficzność pozycji C341, która jest związana ze znacznym obniżeniem ekspresji tego genu i zdolności do transportu przez błonę komórkową. W pracy wykazaliśmy, że komórki raka płuc, które nabyły oporności na związek C-1305, zmieniły fenotyp z heterozygotycznego w odniesieniu do genu ABCG2 i wykazują amplifikację jedynie allelu C341 genu oraz zwiększoną zawartość mRNA i zmutowanego białka pompy ABCG2...
-
Przegląd metod oznaczania pestycydów i PCB w żywności. Methods of determination of pesticides and PCB´s in food - review
PublicationPestycydy i PCB występują w różnych elementach środowiska w dość małych stężeniach, ale związki te ulegają kumulacji i stąd są bardzo niebezpieczne dla zdrowia i życia ludzi i zwierząt. Różnorodność matryc i właściwości fizyko-chemicznych tych związków wymaga stosowania wielu metod przygotowania próbek do analizy i oznaczania. Procedura analityczna składa się z kolejnych bardzo ważnych etapów: pobrania i przygotowania próbki do...
-
Identification of Powdery Mildew Blumeria graminis f. sp. tritici Resistance Genes in Selected Wheat Varieties and Development of Multiplex PCR
Publication -
Enterococci from ready-to-eat food - horizontal gene transfer of antibiotic resistance genes and genotypic characterization by PCR melting profile
Publication -
An Experimental Facility for Rapid Testing of SCR Systems
Publication -
Evaluating Performance and Accuracy Improvements for Attention-OCR
PublicationIn this paper we evaluated a set of potential improvements to the successful Attention-OCR architecture, designed to predict multiline text from unconstrained scenes in real-world images. We investigated the impact of several optimizations on model’s accuracy, including employing dynamic RNNs (Recurrent Neural Networks), scheduled sampling, BiLSTM (Bidirectional Long Short-Term Memory) and a modified attention model. BiLSTM was...
-
Degradacja stali 9CR-1Mo pod wpływem podwyższonej temperatury. Degradation of 9Cr-1Mo steel under the influence of elevated temperature
PublicationBadano charakterystyczne cechy degradacji mikrostruktury i właściwości mechanicznych stali 9Cr-1Mo gat. P9 ASTM SA-335 po eksploatacji w piecu rafineryjnym w temperaturze 390-500 stopni C. Wykazano, że po 30 000 godzin wydłużenie obniżyło się o około 30%. Przyczyną spadku wydłużenia były zmiany mikrostruktury związane z umocnieniem osnowy metalicznej przez chrom oraz wynikające z kruchości odpuszczania stali. Większy spadek wydłużenia...
-
Badania nad identyfikacją produktów korozji w instalacji Platformingu CCR = Studies on identification of corrosion products in Platforming CCR unit
PublicationPrzedstawiono badania dotyczące identyfikacji produktów korozji w instalacji Platformingu CCR. Badano próbki pyłów pobrane z wewnętrznej powierzchni rury pieca, z kolektora pieca i katalizatora przeznaczonego do regeneracji. Badania przeprowadzono posługując się techniką dyfrakcji rentgenowskiej i skaningowej mikroskopii elektronowej.
-
Use of rapid immunochromatographic tests and PCR for the detection of vaccine viruses (CPV, CDV CAV) in faeces and conjunctival sac swabs of vaccinated dogs
Publication -
Ultradźwiękowy moduł antymaskingu dla czujek ruchu PIR
PublicationPrzedstawiono podstawowe założenia, jakie powinien spełniać moduł funkcji antymaskingu, stosowany wraz z czujnikami ruchu opartymi o technologię PIR, umożliwiający spełnienie podstawowych wymagań zawartych w normach serii EN50131. W oparciu o wymagania, stworzono układ spełniający wszystkie wymagania zawarte w normach i dostosowano go do zainstalowania w istniejących obudowach czujek. W pracy przybliżone zostaną podstawy teoretyczne...
-
MultiRegional PCA for leakage detection and localisation in DWDS - approach
PublicationMonitoring is one of the most important parts in advanced control of complex dynamic systems. Information about systems behavior, including failures indicating, enables for efficient control. The chapter describes an approach to detection and localisation of pipe leakage in Drinking Water Distribution Systems (DWDS) representing complex and distributed dynamic system of large scale. Proposed MultiRegional Principal Component Analysis...
-
ECG-based prediction of ventricular fibrillation by means of the PCA
PublicationA Sudden Cardiac Death (SCD) is a death resulting from cardiac failure with no significant symptoms earlier than one hour before occurrence. It is the cause of for approximately 400000 deaths per year in United States and millions of deaths worldwide. The proposed system, including two-stage algorithm and wearable diagnostic device allows for SCD risk estimation and continuous monitoring of high risk patients. A single channel...
-
DSC coupled with PCA as a tool for butter authenticity assessment
Publication -
Różnicowanie C. albicans i C. dubliniensis w oparciu o polimorfizm genu syntazy homocytrynianowej z wykorzystaniem metody PCR RFLP
PublicationNajczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażeń wywołanych przez drożdżaki z rodzaju Candida jest C. albicans. Gatunek ten posiada bardzo zbliżone cechy fenotypowe do C. dubliniensis co często wiąże się z błędną identyfikacją. Skutkuje to wtórnym zakażeniem wywołanym przez współwystepujący gatunek C. dubliniensis, który nabywa oporność na flikonazol stosowany w terapii C. albicans. Celem badań była konstrukcja układu diagnostycznego...
-
Analysis of thoracic regional impedance changes using PCA approach
PublicationA multichannel impedance and one lead electrocardiographic recording system has been developed. The impedance measurement unit is built using a four-electrode technique. It consists of a sinusoidal, 40 kHz, current source and five measurement channels. Circumferential current electrodes have been located at a neck and an abdomen. Voltagemeasurement disk electrodes formed five two-electrode measurement ports. The impedance change...