Filters
total: 945
filtered: 817
-
Catalog
Chosen catalog filters
Search results for: KWAS MELDRUMA, PEPTYDY CYKLICZNE
-
A Highly Selective Biosensor Based on Peptide Directly Derived from the HarmOBP7 Aldehyde Binding Site
PublicationThis paper presents the results of research on determining the optimal length of a peptide chain to eectively bind octanal molecules. Peptides that map the aldehyde binding site in HarmOBP7 were immobilized on piezoelectric transducers. Based on computational studies, four Odorant Binding Protein-derived Peptides (OBPPs) with dierent sequences were selected. Molecular modelling results of ligand docking with selected peptides were...
-
Identification of Substrates of Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerases and Their Collective Essentiality in Escherichia Coli
PublicationProtein folding often requires molecular chaperones and folding catalysts, such as peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs). The Escherichia coli cytoplasm contains six well-known PPIs, although a requirement of their PPIase activity, the identity of their substrates and relative enzymatic contribution is unknown. Thus, strains lacking all periplasmic and one of the cytoplasmic PPIs were constructed. Measurement of their PPIase...
-
Evaluation of Three Peptide Immobilization Techniques on a QCM Surface Related to Acetaldehyde Responses in the Gas Phase
PublicationThe quartz-crystal microbalance is a sensitive and universal tool for measuring concentrations of various gases in the air. Biochemical functionalization of the QCM electrode allows a label-free detection of specific molecular interactions with high sensitivity and specificity. In addition, it enables a real-time determination of its kinetic rates and affinity constants. This makes QCM a versatile bioanalytical screening tool for...
-
Investigation of some taste substances using a set of electrodes with lipid-modified membranes.
PublicationSkonstruowano 5-cio kanałaowy sensor smaku oparty na elektordach jonoselektywnych z membranami polimerowymi modyfikowanymi lipidem. Badano potencjał elektrod w roztworach kwaśnych zawierających różne stężenie kwasu cytrynowego, solnego i octowego. Sensor jest czuły na stężenia substancji kwaśnych z wyjątkiem kwasu octowego. Testowano nowy typ elektrod zawierających polimer przewodzący PEDT/PSS i kwas oleinowy. Stwierdzono, że...
-
Mechanism of the reaction of Lawesson's reagent with N-alkylhydroxamic acids
PublicationIdentyfikacja fosforowych produktów powstających w reakcji kwasów hydroksamowych z odczynnikiem Lawessona pozwoliła ustalić mechanizm tytułowej reakcji. Wykorzystano w tym celu spektroskopię 31P NMR. Wzorce labilnych produktów otrzymano na niezależnej drodze syntetycznej lub przeprowadzono je w trwałe pochodne, które wyizolowano z mieszanin reakcyjnych. Produktem przejściowym badanej reakcji okazał się odpowiedni O-ditiofosfonylowany...
-
Molecular heteroconjugation equilibria in (n-butylamine + acetic acid) systems in binary (dimethyl sulfoxide + 1,4-dioxane) solvent mixtures
PublicationWyznaczono stałe kwasowe Ka(HA), Ka(BH+) oraz stałe równowagi KAHA-, KBHE+ i KAHB, w układach (n-butyloamina + kwas octowy) bez przeniesienia protonu w binarnych mieszaninach rozpuszczalników (DMSO + 1,4-dioksan). Wartości stałych wyznaczono z wykorzystaniem metody miareczkowania potencjometrycznego przy stałej sile jonowej. Stwierdzono, iż stałe heterokoniugacji molekularnej w badanych mieszaninach rozpuszczalników są liniowo...
-
Renal Regulation of Potassium Homeostasis in Calves in the First Week of Life Including the Role of Atrial Natriuretic Peptide
Publication -
Investigation of Serine‐Proteinase‐Catalyzed Peptide Splicing in Analogues of Sunflower Trypsin Inhibitor 1 (SFTI‐1)
Publication -
Molecular dynamics study of a gelsolin-derived peptide binding to a lipid bilayer containing phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate
Publication -
UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations
Publication -
Synthesis and SAR Studies of Antibacterial Peptidyl Derivatives Based upon the Binding Site of Human Cystatin C
Publication -
Least Squares Estimators of Peptide Species Concentrations Based on Gaussian Mixture Decompositions of Protein Mass Spectra
Publication -
99mTc-Galacto-RGD2: A Novel 99mTc-Labeled Cyclic RGD Peptide Dimer Useful for Tumor Imaging
PublicationThis study sought to evaluate [99mTc(HYNIC-Galacto-RGD2)-(tricine)(TPPTS)] (99mTc-Galacto-RGD2: HYNIC = 6-hydrazinonicotinyl; Galacto-RGD2 = Glu[cyclo[Arg-Gly-Asp-D-Phe-Lys(SAA-PEG2-(1,2,3-triazole)-1-yl-4-ethylamide)]]2 (SAA = 7-amino-L-glycero-L-galacto-2,6-anhydro-7-eoxyheptanamide, and PEG2 = 3,6-dioxaoctanoic acid); and TPPTS = trisodium triphenylphosphine-3,3',3''-trisulfonate) as a new radiotracer for tumor imaging. Galacto-RGD2...
-
Peptydowe koniugaty antrachinonów i ich aktywność biologiczna = Peptidyl anthraquinone conjugates and its biological activity
PublicationW artykule opisano syntezę i aktywność biologiczną peptydowych koniugatów antrachinonów. Koniugaty takie są nie tylko potencjalnymi chemoterapeutykami, ale także odgrywają rolę barwnych ligandów w metodach oczyszczania białek, technikach histochemicznych i badaniu helikalnej struktury DNA z zastosowaniem spektroskopii UV i UV-Vis.
-
Synthesis, Chemical Characterization and Multiscale Biological Evaluation of a dimericcRGD Peptide for Targeted Imaging of αVβ3 Integrin Activity
PublicationCyclic peptides containing the Arg-Gly-Asp (RGD) sequence have been shown to specifically bind the angiogenesis biomarker α V β3 integrin. We report the synthesis, chemical characterization, and biological evaluation of two novel dimeric cyclic RGD-based molecular probes for the targeted imaging of α V β3 activity (a radiolabeled version, 64Cu-NOTA-PEG4-cRGD2, for PET imaging, and a fluorescent version, FITC-PEG4-cRGD2, for in...
-
Determination of long-chain aldehydes using a novel quartz crystal microbalance sensor based on a biomimetic peptide
PublicationThere is an increasingly popular trend aimed at improvement of fundamental metrological parameters of sensors via implementation of materials mimicking biological olfactory systems. This study presents investigation on usefulness of the peptide mimicking HarmOBP7 region as a receptor element of the piezoelectric sensor for selective analysis of long-chain aldehydes. Identification of odorant binding proteins creates new possibilities...
-
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublicationRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...
-
Peptide conjugates of lactoferricin analogues and antimicrobials—Design, chemical synthesis, evaluation of antimicrobial activity and mammalian cytotoxicity
PublicationEight new peptide conjugates composed of modified bovine lactoferricin truncated analogues (LFcinB) and oneof the three antimicrobials — ciprofloxacin (CIP), levofloxacin (LVX), and fluconazole (FLC) — were synthesized. Four different linkers were applied to connect a peptide and an antimicrobial agent. The FLC-containing peptidic conjugates were synthesized using the “click chemistry” method. This novel approach is reported here...
-
Chiralne katalizatory tiomocznikowe w reakcji stereoselektywnego alkilowania związków heteroaromatycznych
PublicationNiniejsza praca doktorska podzielona jest na trzy zasadnicze części: wstęp teoretyczny, badania własne oraz część eksperymentalną. Studium literaturowe obejmuje przegląd doniesień z ostatnich lat z dziedziny organokatalizy niekowalenycjnej. Zaprezentowano zakres zastosowań organokatalizatorów tiomocznikowych jednofunkcyjnych i dwufunkcyjnych z uwzględnieniem ograniczeń w strukturze reagentów, roli dodatków katalitycznych i mechanizmu...
-
Creation of Hydrogen Bonded 1D Networks by Cocrystallization of N,N`-bis(2-pyridyl) aryldiamines with Dicarboxylic Acids.Tworzenie 1D sieci krystalicznych poprzez kokrystalizację N,N` -bis(2-piry- dylo) arylodiamin z kwasami dikarboksylowymi.
PublicationZsyntetyzowano szereg N,N`-bis(2-pirydylo) arylodiamin, a następnie otrzymano serię kompleksów w/w amin z kwasami dikarboksylowymi oraz kwasem kwadratowym w postaci monokryształów. Jednostki N,N`-bis(2-pirydylo) arylodiamin i kwasy dikarboksylowe oddziaływują ze sobą poprzez wiązania wodorowe tworząc ośmioczłonowy cykliczny układ. W kompleksach 1:1 cząsteczki układają się w jedno-wymiarową sieć krystaliczną tworzoną przy udziale...
-
FE-modeling of shear resistance degradation in granular materials during cyclic shearing under CNS condition
PublicationW artykule przedstawiono wyniki numerycznej analizy degradacji wytrzymałości na ścinanie w materiałach granulowanych podczas cyklicznego ścinania z warunkiem stałej sztywności normalnej. Obliczenia wykonano przy zastosowaniu metody elementów skończonych i mikropolarnego modelu hipoplastycznego.
-
Boron-doped TiO2: Characteristics and photoactivity under visible light
PublicationOtrzymano TiO2 domieszkowany borem aktywny w reakcjach fotodegradacji pod wpływem światła widzialnego (λ>400 nm). Fotokatalizatory otrzymano poprzez hydrolizę tytanianu(IV) izopropylu w obecności związków boru lub poprzez ucieranie TiO2 (ST-01, P25 i A11) z prekursorami B i następnie kalcynację w zakresie temperatur 200-600oC. Jako źródło boru zastosowano kwas borowy lub ester trietylowy kwasu borowego. Najwyższą aktywność pod...
-
1,4,7,10-Tetraazacyclododecane incorporating salicyli acid moieties. Synthesis and properties
PublicationPochodne 1,4,7,10-tetraazacyklododekanu są związkami które znalazły szerokie zastosowanie w wielu dziedzinach: medycynie, chemii, farmacji, ochronie środowiska itd. Właściwości fizykochemiczne poszczególnych związków determinowane są przez pierścień makrocykliczny i podstawniki. Kwas salicylowy i salicylamid tworzą kompleksy chelatowe z kationami II grupy jak również z metalami przejściowymi. W reakcji acylowania cyklenu pochodnymi...
-
Application of Peracetic Acid for Biological Foam Elimination in the SBR Bioreactor
PublicationPrzedstawiono wyniki wstępnych badań nad zastosowaniem kwasu nadoctowego (PAA) do likwidacji piany biologicznej, spowodowanej przez bakterię nitkowatą Microthrix parvicella. Wykazano, że okresowe zraszanie powierzchni piany małymi dawkami kwasu nadoctowego (rzędu kilkudziesięciu ml 1% roztworu PAA/na 1 m2 piany o grubości 1 cm) powoduje niemal natychmiastwy zanik piany, wytworzonej na powierzchni osadu czynnego w bioreaktorze...
-
Reactions in nanofilms of trifluoroacetic acid (CF3COOH) driven by low energy electrons
PublicationBadano modyfikacje chemiczne indukowane przez niskoenergetyczne elektrony (0-20eV) w cienkich warstwach skondensowanych molekuł CF3COOH. Do badań zastosowano dwie metody: desorpcję jonów w wyniku bombardowania elektronami (ESD - Electron Stimulated Desorption) oraz termiczną desorpcję jonów (TDS - Thermal Desorption Spectroscopy).
-
Peptide splicing in a double‐sequence analogue of trypsin inhibitor SFTI‐1 substituted in the P1 positions by peptoid monomers
Publication -
Cis/trans conformational equilibrium across the N-methylphenylalanine2- N-methylphenylalanine3 peptide bond of arginine vasopressin analogs
Publication -
New Selective Peptidyl Di(chlorophenyl) Phosphonate Esters for Visualizing and Blocking Neutrophil Proteinase 3 in Human Diseases
Publication -
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublicationThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...
-
Structural changes of a simple peptide—Trpzip-1—in aqueous solutions and the corresponding hydration phenomena under the influence of temperature
PublicationTrpzip-1, a simple β-hairpin, is a rare example of peptide with stable secondary structure and can be a convenient model to study temperature-related processes that potential prion or amyloid proteins undergo. Although its sequence is simple, the exact processes which the peptide undergoes in aqueous solutions are quite complex and not well understood. The selection of well-established experimental (DSC, FTIR) and theoretical methods...
-
Effect of ZrO2 on corrosion behaviour of chromium coatings
PublicationW celu zbadania wpływu cząstek ZrO2 na zachowania korozyjne powłok chromowych pokryto stal chromem z elektrolitów Cr(VI) z dodatkiem i bez ZrO2. Właściwości korozyjne osadzonych warstw zbadano w elektrolicie 0,01 mol L(-1) kwasu siarkowego plus 0,5 mol L(-1) siarczanu sodu za pomocą metody spektroskopii impedancyjnej i woltamperometrii cyklicznej. Zaproponowano elektryczny obwód zastępczy dla procesu korozji i wyznaczono pęd korozji....
-
Evaluating the performance of organic coatings under mechanical stress using electrochemical impedance spectroscopy
PublicationMimo, iż znaczna liczba konstrukcji zabezpieczanych przy pomocy powłok poddawana jest cyklicznym naprężeniom mechanicznym, czynnik ten wydaje się być niedoceniany jako przyczyniający się do przyspieszonego niszczenia organicznych układów powłokowych. Celem pracy było zweryfikowanie czy powtarzające się naprężenia mechaniczne stanowią istotny element wpływający na skrócenie czasu eksploatacji systemów powłokowych. W tym celu układ:...
-
Preparation and photocatalytic activity of B-doped titanium dioxide
PublicationOtrzymano TiO2 domieszkowany borem, aktywny w reakcjach fotodegradacji pod wpływem światła widzialnego (λ>400 nm). Fotokatalizatory otrzymano poprzez hydrolizę tytanianu(IV) izopropylu w obecności związków boru lub poprzez ucieranie ST-01 z prekursorami B i następnie kalcynację w temperaturze 450stC. Jako źródło boru zastosowano kwas borowy (0,5 i 10%wag.) lub trietylo ester kwasu borowego (0,5; 1; 5 i 10%wag.). Najwyższą aktywność...
-
Aktywność przeciwgrzybowa koniugatów inhibitorów enzymatycznych z nośnikami peptydowymi
PublicationCelem badań przedstawionych w rozprawie było określenie aktywności przeciwgrzybowej szeregu związków będących koniugatami peptydów z inhibitorami enzymatycznymi (FMDP, cispentacyna). Zakres badań obejmował zbadanie aktywności peptydów-FMDP, CPP oraz FMDP-CPP wobec grzybów z rodzaju Candida w różnego typu podłożach, określenie możliwości powstawania oporności na FMDP-CPP i peptydy-FMDP, a także określenie szybkości transportu i...
-
New products of reaction of Lawesson's reagent with diols.
PublicationW artykule przedstawiono syntezę i szczegółową charakterystykę strukturalną i konformacyjną 8-, 9- i 10-członowych pierścieniowych związków heterocyklicznych o unikatowym układzie atomów O-P-S-S. W wyniku reakcji a,w-dioli z odczynnikiem Lawessona wobec zasad powstają odpowiednie sole kwasów bisditiofosfonowych, które po utlenieniu dają w/w pierścieniowe disulfidy. Kwasy bisditiofosfonowe przekształcono także w trwałe diestry S-metylowe,...
-
Influence of Dimerization of Lipopeptide Laur-Orn-Orn-Cys–NH2 and an N-terminal Peptide of Human Lactoferricin on Biological Activity
Publication -
Binding modes of a new epoxysuccinyl–peptide inhibitor of cysteine proteases. Where and how do cysteine proteases express their selectivity?
Publication -
Lipidated Analogs of the LL-37-Derived Peptide Fragment KR12—Structural Analysis, Surface-Active Properties and Antimicrobial Activity
Publication -
Inhibitory activity of double‐sequence analogues of trypsin inhibitor SFTI‐1 from sunflower seeds: an example of peptide splicing
Publication -
Peptide bond modification. I. Simple and efficient method of Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH synthesis.
PublicationZaprezentowano prostą i efektywną metodę syntezy obu enancjomerów t-butoksykarbonylo chronionego pseudo dipeptydu (R) oraz (S)-Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH.
-
Relative quantification of pork and beef in meat products using global and species-specific peptide markers for the authentication of meat composition
PublicationWe used global and species-specific peptide markers for a relative quantitative determination of pork and beef in raw and processed meat products made of the two meat species. Four groups of products were prepared (i.e., minced raw meats, sausages, raw and fried burgers) in order to represent products with different extents of food processing. In each group, the products varied in the pork/beef proportions. All products were analysed...
-
Antimicrobial Activity of Chimera Peptides Composed of Human Neutrophil Peptide 1 (HNP-1) Truncated Analogues and Bovine Lactoferrampin
PublicationThree chimera peptides composed of bovine lactoferrampin and the analogue of truncated human neutrophil peptide 1 were synthesized by the solid-phase method. In two compounds peptide chains were connected via isopeptide bond, whereas in the third one disulfide bridge served as a linker. All three chimeras displayed significantly higher antimicrobial activity than the constituent peptides as well as their equimolar mixtures. The...
-
Development of a Peptide Derived from Platelet-Derived Growth Factor (PDGF-BB) into a Potential Drug Candidate for the Treatment of Wounds
PublicationObjective: This study evaluated the use of novel peptides derived from platelet-derived growth factor (PDGF-BB) as potential wound healing stimulants. One of the compounds (named PDGF2) was subjected for further research after cytotoxicity and proliferation assays on human skin cells. Further investigation included evaluation of: migration and chemotaxis of skin cells, immunological and allergic safety, the transcriptional analyses...
-
Reaction of thio and seleno phosphoric acid derivatives with O-thioacylated hydroxylamine
PublicationZbadano reakcję siarkowych i selenowych analogów kwasu O,O-neopentylidenofosforowego z O-tiopiwaloilo-N-tert-butylohydroksyloaminą, w której to następuje rozszczepienie wiązania N-O. Znaleziono korelację pomiędzy potencjałem utleniającym anionu pochodnej kwasu fosforowego a przebiegiem badanej reakcji.
-
On Decomposition-Based Surrogate-Assisted Optimization of Leaky Wave Antenna Input Characteristics for Beam Scanning Applications
PublicationRecent years have witnessed a growing interest in reconfigurable antenna systems. Travelling wave antennas (TWAs) and leaky wave antennas (LWAs) are representative examples of structures featuring a great level of flexibility (e.g., straightforward implementation of beam scanning), relatively simple geometrical structure, low profile, and low fabrication cost. Notwithstanding, the design process of TWAs/LWAs is a challenging endeavor...
-
Digital document life cycle development. W: [CD-ROM] Materiały i prezentac-je. Komputeryzacja archiwów polskich muzeów - miejsc pamięci. Konferencja Sztutowo/Kąty Rybackie, 23-24.10.2003. Sztutowo: Państ. Muzeum Stutthof** 2003, 7 s. [14 slajdów] Project IST-2001-33441-MEMORIAL. 5 Program Ramowy UE. Cykliczne życie dokumentu cyfrowego.
PublicationW referacie przedstawiono założenia i cele projektu MEMORIAL UE, jego zada-nia robocze i przebieg prac na jego półmetku. Zaprezentowano w działaniu narzędzie wchodzące w skład pakietu DDW, stanowiące główny produkt realizowane-go projektu.
-
Lipopeptides - synthesis and their properties
PublicationPrzedstawiono syntezę nowych peptydów zawierających Hyp, Met, Gly podstawionych w miejscu histydyny tripeptydu o sekwencji Gly-His-Lys oraz ich odpowiednie modyfikacje na N- i C-końcach. Syntezę zaprojektowanych analogów prowadzono na fazie stałej z zastosowaniem procedury Fmoc. Po otrzymaniu zaplanowanego łańcucha peptydowego metodą karbodiimidową (z zastosowaniem DIC oraz HOBt), przystąpiono do wprowadzania na N-koniec glicyny...
-
A Novel Biological Role for Peptidyl-Arginine Deiminases: Citrullination of Cathelicidin LL-37 Controls the Immunostimulatory Potential of Cell-Free DNA
Publication -
Design, synthesis and in vitro biological evaluation of a small cyclic peptide as inhibitor of vascular endothelial growth factor binding to neuropilin-1
Publication -
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublicationMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...