Filters
total: 820
filtered: 341
-
Catalog
- Publications 341 available results
- Journals 138 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 124 available results
- Projects 22 available results
- Research Teams 4 available results
- e-Learning Courses 162 available results
- Events 10 available results
- Open Research Data 17 available results
Chosen catalog filters
Search results for: biotechnologia molekularna
-
Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych
PublicationOpisano najczęściej wykorzystywane techniki genotypowania w badaniach zakażeń szpitalnych z uwzględnieniem ich powtarzalności i potencjału różnicującego oraz problemów technicznych i ponoszonych kosztów. Makrorestrykcyjna analiza genomowego DNA z wykorzystaniem PFGE (ang. Pulsed Field Gel Electrophoresis)jest uważana za ''złoty standard'' w typowaniu molekularnym. Jednak jest ona czasochłonna, pracochłonna i dlatego nie nadaje...
-
Nanostructured biocatalysis for biotechnological applications
PublicationThe purpose immobilization process is to enhance the performance of an enzyme for commercial processes. A large number of structures have been reported in the literature to boost the effectiveness of immobilized enzymes. The nanomaterials have the optimal properties for equilibrating key parameters that govern the performance of biocatalysts, such as high enzyme loading ability, specific surface area, and mass transfer resistance....
-
Plant Biotechnology in Food Security
Publication -
Application of NIR and Raman Spectroscopy in Biotechnology
PublicationStudium Press LLC, U.S.A.
-
Phyto-Oxylipin Bioprospecting and Biotechnology Interventions
Publication -
Charakterystyka i przydatność składników szarłatu w biotechnologii żywności
PublicationW artykule przedstawiono charakterystykę szarłatu, który jest pseudozbożem o dobrej wartości żywieniowej ze względu na zawartość lipidów o korzystnej proporcji nasyconych i nienasyconych kwasów tłuszczowych i białek o dobrym składzie aminokwasowym. Brak białek frakcji glutenu świadczy o przydatności szarłatu do wytwarzania dietetetycznej żywności przeznaczonej dla chorych na celiakię. Ze względu na małe rozmiary ziaren skrobi szarłatu...
-
Symulacje dynamiczno-molekularne ultraprecyzyjnego skrawania metali.
PublicationW pracy krótko przedstawiono powstałe w latach 1995-2001 algorytmy MD specjalizowane do symulacji przebiegu skrawania w skali nanometrycznej (ARMD iLRMD). W świetle tych algorytmów zaprezentowano opracowany przez autorów nowy algorytm i program do symulacji nanociencia, nano MD, oraz pokazano wybrane wyniki uzyskane za jego pomocą.
-
Wstęp do elektroniki molekularnej
PublicationZastosowanie pojedynczych molekuł lub układów molekularnych do budowy elementów elektronicznych jest poważnym wyzwaniem dla inżynierów i naukowców, w chwili obecnej i w najbliższej przyszłości. celem tego skryptu jest przybliżenie czytelnikowi podstawowych zagadnień dotyczących elektroniki molekularnej, opartej zarówno na układach zbudowanych z wielu molekuł, jak i jednej molekuły. Jest ona przeznaczona dla studentów i pracowników...
-
Charakterystyka bakterii rodzaju Thermus i ich przydatność w biotechnologii
PublicationGram ujemne, termofilne bakterie rodzaju Thermus o optymalnych temperaturach wzrostu mieszczących się w zakresie 55-85 C są przydatne jako źródło nukleaz, polimeraz DNA oraz wielu innych termostabilnych enzymów. W przedstawionym artykule wymieniono występowanie i morfologię bakterii rodzaju Thermus, sposoby odżywiania i warunki ich wzrostu, budowę struktur powierzchniowych, sposoby adaptacji do wzrostu w podwyższonej temperaturze...
-
Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublicationW dochodzeniu epidemiologicznym wykorzystuje się zmienność genetyczną mikroorganizmów do tzw. typowania genetycznego drobnoustrojów. W pracy omówiono metody genotypowe wykorzystujące podstawowe narzędzia molekularne, ukazano możliwości wykorzystania typowania drobnoustrojów w różnych aspektach badań mikrobiologicznych.
-
Modelowanie molekularne w projektowaniu nowych chemoterapeutyków przeciwgrzybowych
PublicationGwałtowny wzrost inwazyjnych zakażeń typu grzybowego jest jednym z największych problemów współczesnej medycyny, a mimo to na rynku leków przeciwgrzybicznych dostępnych jest zaledwie kilka chemoterapeutyków. Dzieje się tak, gdyż duże podobieństwo komórek ludzkich i grzybowych jak dotąd uniemożliwiało opracowanie w pełni skutecznych a zarazem nietoksycznych dla człowieka leków. Obecnie prowadzone badania najczęściej skupiają się...
-
Biotechnological Potential of LSD1, EDS1, and PAD4 in the Improvement of Crops and Industrial Plants
Publication -
Cold-Active beta-Galactosidases: Sources, Biochemical Properties and Their Biotechnological Potential
Publicationbeta-D-Galactosidases have been studied extensively in terms of their application to a variety of industrial technologies. To date, considerable research efforts have been devoted to characterization of new cold-active beta-D-galactosidases which were isolated directly from selected species of bacteria and yeasts, as well as with the use of metagenomic approaches. This chapter will provide a review of current research towards cold-active...
-
Molekularny mechanizm biogenezy fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli.
Publication.
-
Techniki biologii molekularnej w analityce produktów mięsnych
PublicationW pracy przedstawiono możliwości wykorzystania reakcji PCR (Polymerase Chain Reaction) do identyfikacji patogennych drobnoustrojów a także do badania składu surowcowego w mięsnych produktach żywnościowych.
-
Identyfikacja sekwencji markerowych w mikologicznej diagnostyce molekularnej
PublicationProcedury diagnostyki mikologicznej coraz częściej wykorzystują metody molekularne, oparte na analizie kwasów nukleinowych. Pozwala to na skrócenie czasu analizy oraz polepszenie wielu innych, istotnych dla procesu diagnostycznego parametrów takich jak: czułość, powtarzalność, specyficzność oraz potencjał różnicujący. Istotnym etapem przy projektowaniu układów do diagnostyki molekularnej grzybów jest wybór celu molekularnego. Powszechnie...
-
Struktury fotowoltaiczne z planarnym heterozłączem półprzewodnik II-VI / półprzewodnik molekularny
PublicationArtykuł przedstawia wybrane wyniki badań własnych nad układami hybrydowymi zbudowanymi na bazie złącza półprzewodnik nieorganiczny II-VI/półprzewodnik organiczny. Na podstawie analizy położenia pasm energetycznych warstw wchodzących w skład wytworzonych ogniw oraz charakterystyk spektralnych prądu zwarcia tych urządzeń określone zostały procesy prowadzące do fotogeneracji nośników ładunku w badanych układach. W ogniwach zbudowanych...
-
BIODIVERSITY OF YEASTS ISOLATED FROM CAVES OF THE POLISH TATRA MOUNTAINS, AND ITS BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL
PublicationMost of the Earth’s biosphere is permanently or periodically exposed to temperatures below 5°C. Cold habitats harbor a wide diversity of psychrophiles. For many years Antarctica has been the geographic area preferred for studying the diversity and properties of cold-adapted microorganisms. However, the non-Antarctic habitats like Himalayas or Alps are also extensively explored. The Tatra Mountains are Europe’s second-highest massif...
-
Techniki biologii molekularnej w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublicationPrzedstawiono przegląd i porównanie kilku najczęściej stosowanych technik genotypowania mikroorganizmów, uwzględniając molekularne podstawy metod, ich powtarzalność, siłę różnicowania, łatwość i koszt użycia. Pozwoli to zapoznać się z możliwościami klinicznego zastosowania obecnie dostępnych narzędzi molekularnego różnicowania mikroorganizmów.
-
Structural insights, biocatalytic characteristics, and application prospects of lignin-modifying enzymes for sustainable biotechnology
PublicationLignin modifying enzymes (LMEs) have gained widespread recognition in depolymerization of lignin polymers by oxidative cleavage. LMEs are a robust class of biocatalysts that include lignin peroxidase (LiP), manganese peroxidase (MnP), versatile peroxidase (VP), laccase (LAC), and dye-decolorizing peroxidase (DyP). Members of the LMEs family act on phenolic, non-phenolic substrates and have been widely researched for valorization...
-
Autofagia: mechanizm molekularny, apoptoza i nowotwory = Autophagy: molecular mechanism, apoptosis and cancer
PublicationW pracy omówiono molekularny mechanizm autofagii oraz najważniejsze szlaki sygnałowe uczestniczące w regulacji przebiegu tego procesu w komórkach nowotworowych. Omówiona została również dwojaka rola autofagii w procesie nowotworzenia oraz skutki zarówno indukcji, jak i inhibicji autofagii w terapii przeciwnowotworowej
-
Występowanie oraz charakterystyka molekularna oporności na azole wśród klinicznych i środowiskowych izolatów Aspergillus fumigatus
PublicationCelem badań prowadzonych w ramach niniejszej pracy doktorskiej było sprawdzenie występowania oporności na azole grzybów A. fumigatus pochodzących z Polski oraz jej molekularna charakterystyka. W toku badań utworzono kolekcję 200 izolatów A. fumigatus pochodzących z różnych miejsc Polski. W skład kolekcji wchodziły izolaty kliniczne, środowiskowe i weterynaryjne. Przynależność gatunkową badanych grzybów potwierdzono metodami diagnostyki...
-
Dehydrogenaza sacharopiny (NADP+, tworząca L-glutaminian) z Candida albicans jako cel molekularny
Publication......
-
alfa-Aminotransferaza kwasu L-alfa-aminoadypinowego z Candida albicans jako cel molekularny
Publication...
-
The Evaluation of Phenolic Acids and Flavonoids Content and Antiprotozoal Activity of Eryngium Species Biomass Produced by Biotechnological Methods
Publication -
Rozdział 6. Epidemiologia molekularna - nowe metody typowania diagnostycznego mikroorganizmów = Molecular epidemiology new methods for diagnostic typing of microorganismus
PublicationMolekularne metody diagnostyczne oparte o analizę kwasów nukleinowych dają nowe możliwości laboratoriom w szybkim wykrywaniu i różnicowaniu mikroorganizmów patogennych. W pracy przedstawiono panujące tendencje w zastosowaniach metod typowania genetycznego znaczących klinicznie mikroorganizmów w Europie, a także omówiono niektóre techniki stosowane w laboratoriach mikrobiologicznych, z uwzględnieniem ich zdolności aplikacyjnych,...
-
Dynamika molekularna oddziaływań przeciwgrzybowych heptaenów aromatycznych i ich izomerów all-trans ze sterolami w błonach lipidowych
PublicationAromatyczne heptaeny (AH) należą do grupy makrolidów polienowych o działaniu przeciwgrzybowym. Antybiotyki z tej grupy były pierwszymi, które zostały wykorzystane w terapii układowych infekcji grzybiczych. Amfoterycyna B (AmB) oraz nystatyna, czyli niearomatyczni przedstawiciele makrolidów heptaenowych, mają istotne znaczenie kliniczne w leczeniu, odpowiednio, grzybic wewnętrznych i zewnętrznych. Molekularne podstawy mechanizmu...
-
Effective and simple in vitro regeneration system of Miscanthus sinensis , M . × giganteus and M . sacchariflorus for planting and biotechnology purposes
Publication -
Molecular structures of two E-azobenzocrown ethers
PublicationRentgenowska analiza strukturalna monokryształów posłużyła do scharakteryzowania struktury izomerów E dwóch azobenzokoron: 13- i 16-członowej. Oba związki krystalizują w układzie jednoskośnym. W komórce elementarnej, w każdym przypadku znajdują się dwie niezależne cząsteczki, różniące się konformacją, szczególnie łańcucha eterowego. Porównując konformacje ''wolnych'' makrocykli z konformacjami ich kompleksów z jonami metali wskazano,...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół różnych konformacji poliseryny - analiza wyników dynamiki molekularnej
PublicationRozpuszczalnik w istotny sposób wpływa na preferencje peptydu do przyjmowania określonej struktury drugorzędowej. Przykładem tego może być fakt, iż w przypadku polialaniny stabilność konformacji helikalnej w wodzie jest niższa aniżeli w próżni, podczas gdy w przypadku poliseryny mamy do czynienia ze zjawiskiem odwrotnym. W celu lepszego zrozumienia tego zjawiska badano właściwości otoczek hydratacyjnych dookoła czterech konformacji...
-
Komplementarne metody optyczne do badania struktury molekularnej nowoczesnych materiałów dla optoelektroniki.
PublicationZastosowano komplementarne metody optyczne: spektroskopię ramanowską oraz spektroskopię w podczerwieni do badania reakcji zachodzących w czasie wytwarzania polimerów hybrydowych. Umożliwiło to uszczegółowienie opisu reakcji hydrolizy monomerów w trakcie żelowania.
-
Metoda głównych składowych w analizie wyników otrzymanych za pomocą dynamiki molekularnej
PublicationMetoda głównych składowych (ang. principal component analysis, PCA) jest jednym z najpopularniejszych statystycznych narzędzi do wielowymiarowej analizy dużego zestawu danych. Pozwala ona na przekształcenie danego zbioru wzajemnie skorelowanych cech (zmiennych) w nowy układ cech wzajemnie nieskorelowanych (tzw. głównych składowych), który jest porównywalny z układem pierwotnym - zastosowanie PCA upraszcza więc w znaczny sposób...
-
Wpływ osmolitów na stabilność białek w oparciu o metodę dynamiki molekularnej
PublicationCelem niniejszej pracy było zbadanie molekularnego mechanizmu wpływu biologicznie znaczących związków, tzw. osmolitów na stabilność białek. Aby zweryfikować istniejące hipotezy i dostarczyć spójnego obrazu działania osmolitów na poziomie molekularnym, wykorzystano metodę dynamiki molekularnej do zasymulowania mechanicznej denaturacji modelowych białek – lizozymu i ubikwityny. W tym podejściu odtworzony został efekt stabilizujący...
-
Konstrukcja nowych układów do diagnostyki molekularnej zakażeń o etiologii Candida spp.
PublicationDrożdżaki z rodzaju Candida należą do jednych z najczęściej izolowanych czynników etiologicznych zakażeń krwi. Szybka i bezbłędna identyfikacja gatunkowa pozwala na wdrożenie odpowiedniego leczenia i zwiększa szansę na powodzenie terapii. Celem badań była konstrukcja nowych układów wykorzystujących narzędzia diagnostyki molekularnej do specyficznej identyfikacji gatunkowej i rodzajowej drożdżaków Candida. Poszukiwano również nowych...
-
Novel monovalent and multivalent recombinant proteins of Borrelia burgdorferi sensu lato with potential diagnostic value – construction and biotechnological production
PublicationThe diverse antigenic structure of Borrelia burgdorferi sensu lato (s.l.) and the low degree of protein sequence conservation between genospecies causes many limitations in serodiagnosis of Lyme disease (LD). Using expression systems based on Escherichia coli, five monovalent B. burgdorferi s.l. recombinant proteins were produced. i.e., BB0108, BB0126, BB0298, BB0323, BB0689 (each in three variants derived from Borrelia afzelii,...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół β-warstw o zróżnicowanym składzie aminokwasowym - analiza wyników dynamiki molekularnej
Publicationβ-warstwa to jedna z najczęściej spotykanych struktur drugorzędowych w białkach. Jak dotąd mechanizmy rządzące ustrukturyzowaniem wody w warstwie solwatacyjnej wokół tej struktury są słabo poznane [1]. W celu lepszego zrozumienia zjawiska hydratacji wokół struktur o konformacji β-warstwy przeprowadzono analizę wyników pochodzących z symulacji metodą dynamiki molekularnej β-warstw składających się z 8 równoległych nici o różnym...
-
Conformation Properties, Chiroptical Spectra, and Molecular Self-Assembly of 2,3-Piperazinodiones and Their Dithiono Analogues
PublicationRodzina chiralnych cyklicznych oksamidów została otrzymana przez kondensację optycznie czynnych 1,2-diamin ze szczawianem dietylu. Tionowanie produktów odczynnikiem Lawessona doprowadziło do chiralnych 2,3-dipiperazynodionów. Geometrie cząsteczkowe badano z użyciem obliczeń kwantowo-mechanicznych DFT i porównano z wynikami analizy krystalograficznej. Sześcioczłonowy pierścień heterocykliczny przyjmuje konformację półkrzesłową,...
-
Molekularne aspekty aktywności biologicznej amfoterycyny B i jej pochodnych o podwyższonej selektywności - badania z zastosowaniem metod chemii obliczeniowej
Publication -
Termodynamika oddziaływań i przejść strukturalnych DNA w układach wodnych na podstawie symulacji metodą dynamiki molekularnej
PublicationKwas deoksyrybonukleinowy jest jednym z najistotniejszych elementów każdej żywej komórki ze względu na rolę głównego nośnika informacji genetycznej. Posiada on instrukcje potrzebne do wzrostu, budowy, funkcjonowania oraz namnażania się wielu żywych organizmów, w tym także wirusów. Okazuje się, że w zależności od warunków środowiskowych, DNA może przyjmować wiele różnych struktur drugorzędowych, z których większość stanowi formy...
-
Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A
PublicationW ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych....
-
Molecular characterization of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Poland by use of multiple genetic markers
PublicationW pracy przedstawiono wyniki genotypowania wielolekoopornych szczepów Mycobacterium tuberculosis, izolowanych od pacjentów z Polski.
-
Interactions of amphotericin B derivatives with lipid membranes - a molecular dynamics study
PublicationW pracy analizowano oddziaływanie dwóch nisko-toksycznych pochodnych amfoterycyny B (związki SAmE i PAmE) z modelami błon lipidowych. Badania wykonane zostały za pomocą dynamiki molekularnej. Modele błon oprócz fosfolipidów DMPC zawierały odpowiednio cholesterol (model błony zwierzęcej) lub ertosterol (model błony grzybowej). Analiza wyników wykazała, że obie pochodne amfoterycyny B zachowują się inaczej w błonie cholesterolowej...
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublicationWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
Phytotechnology applied to municipal wastewater treatment on irrigated fields of Gdansk (Poland) (1872-1992)
PublicationPola nawadniane ściekami w Gdańsku zbudowane zostały w roku 1872 i pracowały do roku 1992. Obejmowały one 320 ha piasków nadmorskich w miejscowości Gdansk Sianki, między Wisloujściem a Stogami. Obciążenie hydrauliczne pól wynosiło początkowqo 3000 mm rocznie, ale stopniowo wzrastało aż do poziomu 8000 mm rocznie. Pola pokryte były monokulturą trawiasta złożoną głównie z perzu, a zagłębieniach terenowych występowała głównie pokrzywa....
-
Badanie, metodami dynamiki molekularnej, hydratacji domeny katalitycznej cząsteczki kinezyny oraz wpływu efektów hydratacyjnych na jej funkcjonalność motoryczną
PublicationCelem pracy było zbadanie właściwości wody solwatacyjnej wokół domeny motorycznej kinezyny oraz pomiędzy kinezyną a dimerem tubulinowym. Ponadto, analizowany był wpływ rozpuszczalnika na siłę generowaną przez szyjkę łącznikową kinezyny. Dane otrzymane zostały z użyciem symulacji komputerowych. Odkryto liniową korelację pomiędzy współczynnikami dyfuzji wody solwatacyjnej i ruchliwością sąsiadujących atomów białka. Wpływ wody na...
-
ADSRRS-fingerprinting - nowoczesne narzędzie biologii molekularnej w badaniach epidemiologicznych - optymalizacja i walidacja metody badawczej oraz konstrukcja zestawu diagnostycznego
Publication.
-
FT-IR studies of molecular interactions in formamide-methanol mixtures
PublicationTechniką ATR zmierzono widma FT-IR roztworów metanolu(MeOH) i formamidu(FA) w całym zakresie ich składu. Przeprowadzono analizę faktorową widm, która wykazała obecność dwóch kompleksów molekularnych matanolu z formamidem. Na podstawie profilów stężeniowych indywiduów absorbujących wyznaczono średni skład kompleksów w zależności od składu mieszaniny. Przeprowadzono również analizę pasma CO formamidu metodą widm różnicowych. Wyniki...
-
Degradation of a nano-cutting tool: an MD simulation
PublicationW pracy przedstawiono wyniki symulacji wielokrotnego oddziaływania realistycznie ukształtowanego ostrza tnącego z modelowym, nieskończenie twardym ziarnem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej. Ostrze składało się z kilkuset tysięcy atomów metalu fcc, traktowanego za pomocą potencjału Suttona-Chena, przesuwane było ze stałą prędkością 20 m/s. Obserwowane deformacje plastyczne pojawiające się na skutek kontaktu ostrza...