Search results for: PROTEAZY SERYNOWE
-
Virtual screening for small molecular non-covalent binders of the SARS-CoV-2 main protease
Publication -
One Step Beyond: Design of Substrates Spanning Primed Positions of Zika Virus NS2B-NS3 Protease
Publication -
SP-1, a Serine Protease from the Gut Microbiota, Influences Colitis and Drives Intestinal Dysbiosis in Mice
Publication -
Materiały ceramiczne w węzłach ciernych protez stawów biodrowych i kolanowych.
PublicationOpisano działania zmierzające do zwiększenia trwałości elementów ciernych protez stawów biodrowych i kolanowych. Działania te nakierowane są na doskonalenie konstrukcji protez, sposobu ich mocowania do kości kończyn oraz poszukiwania nowych materiałów, szczególnie na węzły cierne protez. Opisano aktualnie stosowane skojarzenia materiałowe oraz badania zmierzające do zastosowania nowych, lepszych materiałów. Najkorzystniejsze okazały...
-
Properties of the HtrA Protease From Bacterium Helicobacter pylori Whose Activity Is Indispensable for Growth Under Stress Conditions
Publication -
Activation mechanism and activity of globupain, a thermostable C11 protease from the Arctic Mid-Ocean Ridge hydrothermal system
Publication -
Atomic resolution crystal structure of HV-BBI protease inhibitor from amphibian skin in complex with bovine trypsin
Publication -
Comparative molecular dynamics study of dimeric and monomeric forms of HIV-1 protease in ligand bound and unbound state
PublicationHuman immunodeficiency virus type 1 protease (HIV-1 PR) is a viral-encoded enzyme that forms a homodimer. HIV-1 PR is essential for replication and assembly of the virus and inactivation of HIV-1 PR enzyme causes production of immature, noninfectious viral particles and thus HIV-1 PR is an attractive target in anti-AIDS drug design. In our current work, we performed molecular dynamics (MD) calculations (500 ns) for two different...
-
Badania spękań niskotemperaturowych podbudów a AC WMS na nowobudowanej autostradzie A1 w Polsce. Część 1 - Badania terenowe i laboratoryjne
PublicationW artykule przedstawiono problem niskotemperaturowych spękań poprzecznych, które powstały na podbudowach z betonu asfaltowego o wysokim module sztywności AC WMS. Liczne spękania niskotemperaturowe powstały na analizowanych podbudowach AC WMS podczas okresu zimowego w 2012 r. zanim została zakończona cała konstrukcja nawierzchni. Spękania powstały zarówno na połączeniach technologicznych, jak i pomiędzy nimi. Problem taki nie wystąpił...
-
Regulation of the First Committed Step in Lipopolysaccharide Biosynthesis Catalyzed by LpxC Requires the Essential Protein LapC (YejM) and HslVU Protease
PublicationWe previously showed that lipopolysaccharide (LPS) assembly requires the essential LapB protein to regulate FtsH-mediated proteolysis of LpxC protein that catalyzes the first committed step in the LPS synthesis. To further understand the essential function of LapB and its role in LpxC turnover, multicopy suppressors of ΔlapB revealed that overproduction of HslV protease subunit prevents its lethality by proteolytic degradation...
-
The psychrotrophic yeast Sporobolomyces roseus LOCK 1119 as a source of a highly active aspartic protease for the in vitro production of antioxidant peptides
PublicationA psychrotrophic yeast strain producing a cold-adapted protease at low temperature was classified as Sporobolomyces roseus. In standard YPG medium, S. roseus LOCK 1119 synthesized an extracellular protease with an activity of approximately 560 U/L. Optimization of medium composition and process temperature considerably enhanced enzyme biosynthesis; an approximate 70% increase in activity (2060 U/L). The native enzyme was purified...
-
Inhibiting Activity of HIV-1: Protease, Reverse Transcriptase and Integrase All Together by Novel Compounds Using Computational Approaches
Publication -
The LD loop as an important structural element required for transmission of the allosteric signal in the HtrA (DegP) protease from Escherichia coli
Publication -
Screening of potential inhibitors for COVID-19 main protease from phytoconstituents of Tectona grandis Linn: application of molecular modeling studies
Publication -
Substrate profiling of Finegoldia magna SufA protease, inhibitor screening and application to prevent human fibrinogen degradation and bacteria growth in vitro
Publication -
Development of potent and effective SARS-CoV-2 main protease inhibitors based on maleimide analogs for the potential treatment of COVID-19
PublicationIn the present work, we report a new series of potent SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) inhibitors based on maleimide derivatives. The inhibitory activities were tested in an enzymatic assay using recombinant Mpro (3CL Protease from coronavirus SARS-CoV-2). Within the set of new Mpro inhibitors, 6e demonstrated the highest activity in the enzymatic assay with an IC50 value of 8.52 ± 0.44 mM. The IC50 value for Nirmatrelvir (PF-07321332,...
-
Występowanie oraz polimorfizm genów kodujących syntezę autotransporterów proteaz serynowych (SPATE) wśród bakterii Escherichia coli wywołujących biegunki u dzieci w regionie Gdańska
PublicationW grupie 96 szczepów bakterii Escherichia coli wyizolowanych w rejonie Gdańska od dzieci z biegunką zbadano obecność oraz polimorfizm sekwencji genów kodujących grupę białek o wspólnej nazwie: SPATE (Serine Protease Autotransporters of Enterobacteriaceae). Za pomocą analizy restrykcyjnej zidentyfikowano 8 różnych genów kodujących białka z tej grupy. Obecność jednego genu stwierdzono w 39 szczepach, w 15 szczepach występowały dwa,...
-
Inhibiting activity of HIV-1: protease, reverse transcriptase and integrase all together by novel compounds using computational approaches (flexible and rigid docking)
PublicationAcquired immunodeficiency syndrome (AIDS), caused by human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection, is one of the most challenging diseases in recent decades. Nevertheless the shortcomings of chemical drugs such as toxicity, lack of curative effects, the search for more potent anti-HIV agents have been focused in our study. In current study, novel scaffold was designed having a benzyl and imidazole in it which are very...
-
A. Computational analysis by molecular docking of thirty alkaloid compounds from medicinal plants as potent inhibitors of SARS-CoV-2 main protease(2020).
Publication -
Metodyka i system dopasowanie protez słuchu w oparciu o badanie percepcji sygnału mowy w szumie.
Publication.
-
Molecular modeling study of tectoquinone and acteoside from Tectona grandis linn: a new SARS-CoV-2 main protease inhibitor against COVID-19
Publication -
Ziemowit Suligowski prof. dr hab. inż.
People -
Christian Jungnickel dr hab.
People -
Application of hybrid signals processors to speech and hearing aids
PublicationDzięki postępowi w technice Cyfrowych Procesorów Sygnałowych (ang. DSP) stało się możliwe budowanie miniaturowych protez słuchu i mowy. Mimo niewielkich wymiarów procesory te są w stanie wykonywać złożone algorytmy. Ich dodatkową zaletą jest łatwość zmiany oprogramowania, a co za tym idzie łatwość zmiany dziedziny zastosowań. W pracy skupiono się na zagadnieniach związanych z projektowanie i implementacją algorytmów mających zastosowanie...
-
Modelling of bio-mechanical objects: recent examples
PublicationW opracowaniu przedstawiono dwa wykorzystania modelowania bio-mechanicznego wybranych obiektów: modelowanie zachowania mięśni w układzie ramię-przedramię oraz wstępny projekt protezy dłoni przy użyciu materiałów z pamięcią kształtu. Przedstawiono wyniki badań symulacyjnych oraz opis dynamiki działania układów sterowania dla protezy dłoni oraz dla układu ramię-przedramię.
-
Sławomir Milewski prof. dr hab. inż.
PeopleSławomir Milewski, born in 1955 in Puck, Poland, graduated in 1979 in Chemistry from the Faculty of Chemistry, Gdańsk University of Technology (GUT). In 1984 was employed at the Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry. In 1985 he got his PhD, in 1994 became a DSc (habilitation) and in 2002 got the professorship in chemical sciences. Currently he is a full professor and Head of the Department of Pharmaceutical Technology...
-
The design of the prosthetic index finger actuated by shape memory alloy wires
PublicationZaprezentowano projekt palca wskazującego protezy ręki, w którym poszczególne człony napędzane są za pomocą niekonwencjonalnych efektorów - stopów metali z pamięcią kształtu (SMA - NiTi).
-
A. Computational analysis by molecular docking of thirty alkaloid compounds from medicinal plants as potent inhibitors of SARS-CoV-2 main protease(2020). Focused on analysis of the Medicinal plants that have potential therapeutic ability against COVID-19.
Publication -
Contactless Hearing Aid for Infants Employing Signal Processing Algorithms. [Bezkontaktowy aparat słuchowy dla niemowląt wykorzystujący algorytmy przetwarzania sygnału]
PublicationZaprojektowany bezkontaktowy aparat słuchowy umiejscawiany jest w łóżeczku niemowlęcia. Aparat składający się z matrycy 4 mikrofonów oraz prototypowej karty z procesorem DSP pracuje w polu swobodnym. Przetworzony sygnał mowy emitowany jest z wykorzystaniem miniaturowych głośników. Opracowane algorytmy pozwalają na elminację akustycznych sprzężeń zwrotnych, które mogą wystepować ze względu na niewielką odległość mikrofonów od głośników...
-
Some applications of thermophiles and their enzymes for protein processing
PublicationPrzedstawiono charakterystykę, właściwości oraz możliwości zastosowań enzymów proteolitycznych wytwarzanych przez termofile. Zaletą tych biokatalizatorów jest między innymi duża odporność na działanie rozpuszczalników organicznych, detergentów i innych czynników denaturujących białka oraz mała wrażliwość na zmiany pH. Dokonano też przeglądu czynników powodujących dużą stabilność proteaz z termofili.
-
Extracellular proteolytic activity of Deinococcus geothermalis
PublicationProduction of extracellular protease by extremophilic bacteria Deinococcus geothermalis cultivated in liquid media containing 0.1% (w/v) of peptone K, 0.1% yeast extract and 0.2% marine salt reached a maximum in 14 h of the cell growth at 45°C and pH 8.0. The enzyme was purified by a two-step procedure using fractionation by a graded ammonium sulphate precipitation technique and gel filtration on Sephadex G-100 column. Protease...
-
Ekspertyza dotycząca potrzeby zastosowania ochrony katodowej zbiorników podziemnych na terenie Bazy Paliw w Poznaniu
PublicationWykonano badania terenowe i laboratoryjne w celu określenia potrzeby zastosowania ochrony katodowej projektowanych zbiorników podziemnych na terenie Bazy Paliw w Poznaniu.
-
Określenie zasadności zastosowania instalacji ochrony katodowej nowych podziemnych zbiorników buforowych na terenie Bazy Paliw nr 21 OLPP w Dębogórzu.
PublicationWykonano badania terenowe i laboratoryjne w celu określenia potrzeby zastosowania ochrony katodowej nowych zbiorników buforowych na terenie Bazy Paliw OLPP w Dębogórzu.
-
Amino Acid and Peptide‐Based Antiviral Agents
PublicationA significant number of antiviral agents used in clinical practice are amino acids, short peptides, or peptidomimetics. Among them, several HIV protease inhibitors (e. g. lopinavir, atazanavir), HCV protease inhibitors (e. g. grazoprevir, glecaprevir), and HCV NS5A protein inhibitors have contributed to a significant decrease in mortality from AIDS and hepatitis. However, there is an ongoing need for the discovery of new antiviral...
-
ĆWICZENIA TERENOWE
e-Learning Courses -
A new approach to the prosthetic finger design
PublicationW pracy zaprezentowano nowy sposób projektowania protez ręki przy użyciu aplikacji CAD. Uzyskano projekt palca wskazującego, w którym zaproponowano napęd poszczególnych członów w oparciu o stopy z pamięcią kształtu.
-
Białka aktywne biologicznie obecne w soku pokrochmalnianym
PublicationPodczas przetwarzania 1 tony ziemniaków na skrobię powstaje od 5 do 12 m3 odpadów ciekłych, które zawierają 300-410 g białek na 1 kg suchej masy. Trzy główne grupy białek to: białka typu patatyny, inhibitory proteaz o charakterze zasadowym, grupa białek złożonych o wielkości 22 kDa. Białka te mogą zostać wyizolowane z soku pokrochmalnianego w formie natywnej, a następnie wykorzystane jako: środki ochrony roślin, dodatki do żywności...
-
Expert media approach to hearing aids fitting
PublicationW artykule zaprezentowano problematykę dopasowania protez słuchu. Przedstawiono system ekspercki, który pozwala na znalezienie charakterystyk aparatu słuchowego adekwatnego do uszkodzenia słuchu. System został oparty o metodę zbiorów przybliżonych i logikę rozmytą.
-
Automatic assessment of the hearing aid dynamics based on fuzzy logic
PublicationPrzedstawiono podstawy koncepcyjne systemu dopasowania protez słuchu opartego na logice rozmytej. Przeprowadzono dyskusje na temat metody skalowania głośności. Następnie podano szczegóły procesu aproksymacji funkcji przynależności odzwierciedlające słuchowe wrażenia głośności. Załączono wnioski.
-
Laboratorium terenowe 2022
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z urządzeniami i systemami wbudowanymi czasu rzeczywistego w warunkach środowiskowych zgodnych z ich przeznaczeniem.
-
Laboratorium terenowe 2024
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z urządzeniami i systemami wbudowanymi czasu rzeczywistego w warunkach środowiskowych zgodnych z ich przeznaczeniem.
-
Laboratorium terenowe 2023
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z urządzeniami i systemami wbudowanymi czasu rzeczywistego w warunkach środowiskowych zgodnych z ich przeznaczeniem.
-
Badania nośności pali formowanych iniekcją strumieniową
PublicationReferat prezentuje autorski projekt doświadczalny, przeprowadzony w pełnej skali technicznej, obejmujący terenowe badania nosności pali formowanych iniekcją strumieniową. Badania przeprowadzono na specjalnie przygotowanym do tego celu poletku doświadczalnym. Celem doświadczenia była ocena jednostkowych oporów gruntu na pobocznicy badanych pali.
-
Analiza deformacji trwałych nawierzchni asfaltowych na podstawie badań te-renowych i laboratoryjnych.**2003, 339 s. 117 rys. 24 fot. 136 tab. biblio- gr. 129 poz. Rozprawa doktorska (29.09.2003)Promotor: prof. dr. hab. inż. Józef Judycki
PublicationPraca opisuje badania terenowe deformacji trwałych na 9 wybranych odcinkachdróg krajowych. W drugiej części opisano badania laboratoryjne wpływu wy-branych czynników na deformacje trwałe. W badaniach zastosowano modyfikacjemetod badawczych. Badania pozwoliły na określenie cech betonów asfaltowychodpowiedzialnych za deformacje trwałe.
-
Stepwise development of distributed interactive simulation systems.
PublicationMetoda krokowa pozwala na budowanie wydajnych i skalowalnych systemów symu-lacji rozproszonej obiektów rzeczywistych jak np. pojazdy terenowe, samocho-dy i śmigłowce. Dzięki uwzględnianiu parametrów operacyjnych oraz parametrównarzędzi wizualizacyjnych możliwe jest znaczne ograniczenie liczby komunika-tów przesyłanych między obiektami.
-
Ocena klimatu akustycznego w przestrzeni pasażerskiej elektrycznego zespołu trakcyjnego serii EN57
PublicationW pracy przedstawiono wyniki badań poziomów dźwięku w przestrzeni pasażerskiej elektrycznego zespołu trakcyjnego (EZT) serii EN57 podczas postoju, rozruchu, jazdy oraz hamowania. Badania przeprowadzono na podstawie autorskiej metodyki badawczej bazując na normie PNEN ISO 3381:Kolejnictwo. Akustyka. Pomiar hałasu wewnątrz pojazdów szynowych. Badania przeprowadzono na linii kolejowej nr 250 od przystanku Gdańsk Śródmieście do stacji...
-
Hybrid energy storage forelectric multiple units to operate at the partially electrified line Gdynia -Hel
PublicationThe article presents calculations enabling the selection of an on-board energy storage device to replace diesel-powered trains with modern storage multiple units on the example railway line Gdynia Główna -Hel. The pioneering and currently used storage electric multiple units, mainly in Europe, were presented. The condensed results of the inventory of the line in question, including the technical condition...
-
Analiza przyczyn zużywania się (uszkadzania) szyn w zależności od warunków techniczno – eksploatacyjnych toru
PublicationDiagnostyka nawierzchni kolejowej jest istotnym elementem składowym czynników wpływających na poprawę stanu technicznego infrastruktury kolejowej w Polsce. Monitorowanie zmian zachodzących na powierzchni tocznej szyn jest bardzo ważnym elementem w kontekście poziomu bezpieczeństwa przewozów prowadzonych transportem szynowym. W artykule przedstawiono niektóre z czynników wpływające na proces degradacji powierzchni tocznej szyn w...
-
Costs of upgrading based on 131 railway line
PublicationW poszukiwaniu optymalnego wykorzystania środków finansowych przedsiębiorstwa kolejowego (PKP PLK) oraz czasu planowania napraw torowisk stworzono model trwałości toru. Model w swych założeniach opiera się na parametrach techniczno – eksploatacyjnych linii kolejowej nr 131. W artykule przedstawiono dwa warianty procesu trwałości toru. Pierwszy wariant zakłada oczyszczenie toru, drugi przeprowadzenie modernizacji. Dla obu wariantów...
-
A multi-criteria decision model for the introduction of electric storage multiple units on the partially electrified Gdynia-Hel railway
Publication: In this article a multi-criteria study of the use of independently powered electric multiple units on the partially electrified Gdynia Główna - Hel line was carried out. The use of (currently used) diesel and, as an alternative, electric and electric multiple units with an electric energy storage was considered. The analysis was carried out on the basis of three criteria for assessing the route service options, i.e. environmental,...