Filters
total: 869
-
Catalog
Search results for: STRATOSPHERE, BALLOONS, MICROBIOLOGY, BIOTECHNOLOGY, ASTROBIOLOGY
-
Rapid eradication of bacterial phytopathogens by atmospheric pressure glow discharge generated in contact with a flowing liquid cathode
Publication -
Isolation and characterization of the restriction endonucleasePpel fromPhormidium persicinum
Publication -
Enhanced extraction of proteins using cholinium-based ionic liquids as phase-forming components of aqueous biphasic systems
Publication -
Hot spot identification by ligand-protein surface interactions mapping – in silico study
Publication -
Software tools for identification, visualization and analysis of protein tunnels and channels
Publication -
Evolution of functionally important compartments of proteins – what can we learn from studying epoxide hydrolases?
Publication -
Water tracing as an alternative method for tunnels exploration in macromolecules
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactosidase
Publication -
Discovery and characterization of RecA protein of thermophilic bacterium Thermus thermophilus MAT72 phage Tt72 that increases specificity of a PCR-based DNA amplification
Publication -
A dependency between PRL gene polymorphism and breeding parameters in Polish Black-and-White Holstein-Friesian cows
Publication -
Direct cloning of heavy metal resistance genes from metagenomic DNA
Publication -
Effect of addition of buserelin acetate to the extender on motility and viability of bovine spermatozoa
Publication -
Correlation between chosen polymorphisms in genes coding 5HTT, 5HT2A and COMT with obesity.
Publication -
Relationship between polymorphism in the CRH gene and the traits of body conformation of Salers cows
Publication -
Flavonoid biosynthetic pathways in plants: Versatile targets for metabolic engineering
Publication -
The enhancement of anti-staphylococcal potential of plant derived naphthoquinones as a result of combination with silver nanoparticles
Publication -
Fingerprinting, structure, and genetic relationships among selected accessions of blue honeysuckle (Lonicera caerulea L.) from European collections
Publication -
The construction of bifunctional fusion proteins consisting of MutS and GFP
PublicationSkonstruowano białka chimeryczne zawierające białko MutS z Thermus thermophilus i białko zielonej fluoresceiny GFP z Aequorea victoria, posiadające dla łatwiejszego oczyszczania domeny oligo-histydynowe na N- lub C-końcu. Fuzyjne białka rozpoznawały niekomplementarności w DNA podobnie do MutS T. thermophilus. Fluorescencyjne białka rozpoznające niekomplementarne DNA mogą być użyteczne w wykrywaniu jednonukleotydowych polimorfizmów...
-
Proteases immobilized on nanomaterials for biocatalytic, environmental and biomedical applications: Advantages and drawbacks
PublicationProteases have gained significant scientific and industrial interest due to their unique biocatalytic characteristics and broad-spectrum applications in different industries. The development of robust nanobiocatalytic systems by attaching proteases onto various nanostructured materials as fascinating and novel nanocarriers has demonstrated exceptional biocatalytic performance, substantial stability, and ease of recyclability over...
-
Study on a polish peat bog “Rucianka” as a source of yeast strains capable of effective phenol biodegradation
PublicationPhenol is one of the most widely distributed environmental pollutants which can be found in wastewaters and industrial effluents. Due to its toxicity and resistance to self-degradation, it could become even lethal for humans and animals. The treatment of this toxic compound is focused on psychical–chemical methods, although biological treatment of phenol is preferable for economic aspects related to relatively...
-
Expression of a GDSL esterase from Pseudomonas sp. S9 in Pichiapastoris
PublicationCold active lipolytic enzymes are promising to replace the conventional enzymes processes of biotechnological industries. One of the most important feature of the cold-active lipases and esterases is that they offer economic benefits through energy saving. In general, they exhibit high activity at low temperatures and low thermostability at moderate temperatures. Lipolytic enzyme EstS9 was isolated from Pseudomonas sp. S9. A multiple...
-
A Colorimetric Microplate Assay for DNA-Binding Activity of His-Tagged MutS Protein
PublicationA simple microplate method was designed for rapid testing DNA-binding activity of proteins. The principle of the assay involves binding of tested DNA by his-tagged protein immobilized on a nickel-coated ELISA plate, following colorimetric detection of biotinylated DNA with avidin conjugated to horseradish peroxidase. The method was used to compare DNA mismatch binding activities of MutS proteins from three bacterial species. The...
-
Cloning and characterization of a novel cold-active glycoside hydrolase family 1 enzyme with beta-glucosidase, beta-fucosidase and beta-galactosidase activities.
PublicationBackground: Cold-active enzymes, sourced from cold-adapted organisms, are characterized by high catalytic efficiencies at low temperatures compared with their mesophilic counterparts, which have poor activity. This property makes them advantageous for biotechnology applications as it: (i) saves energy costs, (ii) shortens the times for processes operated at low temperatures, (iii) protects thermosensitive substrates or products...
-
Production of tropane alkaloids in Hyoscyamus niger (black henbane) hairy roots grown in bubble-column and spray bioreactors
PublicationHairy root cultures of Hyoscyamus niger were cultivated in shake-flasks, a bubble-column bioreactor and a hybrid bubble-column/spray bioreactor and evaluated for alkaloid production.
-
Interspecies distances between propionic acid degraders and methanogens in syntrophic consortia for optimal hydrogen transfer
PublicationA mixed culture from an anaerobic biowaste digester was enriched on propionate and used to investigate interspecies hydrogen transfer in dependence of spatial distances between propionate degraders and methanogens. From 20.3 mM propionate, 20.8 mM acetate and 15.5 mM methane were formed. Maximum specific propionate oxidation and methane formation rates were 49 and 23 mmol mg−1day−1, respectively. Propionate oxidation was inhibited by...
-
Production of trehalose in a single step enzymatic reaction
PublicationThe aim of this study was isolation and cloning of trehalose synthase gene derived from extremophilic microorganisms Deinoccoci to the expressive E. coli vectors and its biosythesis in different hosts.
-
Isolation and properties of recombinant trehalose synthase
PublicationBiosynthesis of trehalose is carried out via various matabolic pathways, including the use of trehalose synthase. Bacteria of the genus Deionococcus are microorganisms which produce trehalose synthase catalizing conversion of maltose into trehalose. In this work recombinant trehalose synthase from D.radiodurans was characterized.
-
In vitro affinity of Deinococcus radiodurans MutS towards mismatched DNA exceeds that of its orthologues from Escherichia coli and Thermus thermophilus
PublicationThe mismatch binding protein MutS is responsible for the recognition of mispaired and unpaired bases, which is the initial step in DNA repair. Among the MutS proteins most extensively studied in vitro are those derived from Thermus thermophilus, Thermus aquaticus and Escherichia coli. Here, we present the first report on the in vitro examination of DNA mismatch binding activity of MutS protein from Deinococcus radiodurans and confront...
-
cDNA fingerprint from the hepatopancreatic glands of pond snails (Lymnaea stagnalis) exposed to benzo[a]pyrene
PublicationIdentification of differentially expressed genes that could be potentially used as biomarkers of PAH exposure of common invertebrate animal (like freshwater snail) would be a valuable resource for investigators interested in toxicology and biomonitoring of aquatic environments. Therefore, the aim of this research was to investigate effects of waterborne benzo[a]pyrene (B[a]P) exposure on mRNA expression in the pond snail’s (Lymnaea...
-
Characterization of d-xylose reductase, XyrB, from Aspergillus niger
PublicationD-xylose reductase is a member of the aldo-keto reductase family, and is involved in D-xylose and L-arabinose conversion through the Pentose Catabolic Pathway (PCP) in fungi. In this study, we biochemically characterized a newly identified second D-xylose reductase (XyrB) from Aspergillus niger. This NADPH-dependent reductase is able to efficiently convert D-xylose and L-arabinose, and it has the highest affinity for these sugars...
-
Wykorzystanie komórek Escherichia coli transformowanych genem termostabilnej beta-galaktozydazy z Pyrococcus woesei do wytwarzania galaktozylofruktozy
PublicationKomórki rekombinantowej Escherichia coli transformowane genem beta-galaktozydazy z Pyrococcus woesei wykorzystano jako biokatalizator syntezy galaktozylofruktozy. Największą aktywność syntezy wymienionego prebiotyku (7,6 g/L x godz)uzyskano w 80C przy pH 5,4, stosując jako substrat roztwór zawierający 10% laktozy i 20% fruktozy. Aktywność transgalaktozylacji nie ulegała istotnym zmianom podczas sześciu kolejnych szarż produkcyjnych.
-
Ocena przydatności bakterii Thermus ruber jako źródła termostabilnej alfa-glukozydazy użytecznej do wytwarzania syropów glukozowych
PublicationThermus ruber wytwarza alfa-glukozydazę o maksymalnej aktywności w temperaturze 65 C i przy pH 6,0. Wymieniony enzym zachowuje aktywność w zakresie pH 5,5-8,0 i prawie nie zmniejsza aktywności po 60 min inkubacji w 65 C. Szybkość hydrolizy maltozy, maltotetraozy, maltopentaozy oraz maltoheksaozy maleje wraz ze wzrostem masy cząsteckowej substratu.
-
Ocena przydatności bakterii Thermus ruber jako źródła syntazy trehalozy
PublicationWykazano, że termofilna bakteria Thermus ruber jest źródłem syntazy trehalozy,katalizującej wewnątrzcząsteczkową transglikozylację maltozy. Wymieniony enzym przejawia największą aktywność w temp. 65 st. C przy pH 6,5. Najlepszą wydajność syntazy trehalozy uzyskiwano podczas hodowli bakterii w 55 st. C na podłożu zawierającym 0,5% peptonu 0,1% wyciągu drożdżowego i 0,5% maltozy lub skrobi.
-
Albuminy 2S - roślinne białka zapasowe o właściwościach alergennych
PublicationRoślinne albuminy 2S są znane jako białka zapasowe obecne w nasionach niektórych roślin jadalnych, takich jak: soja, słonecznik, gorczyca i orzech brazylijski. Białka te posiadają niezwykłą strukturę drugorzędową, będącą wynikiem obecności bogatych w cysteinę motywów C-Xn-CXn-CC-Xn-CXC-Xn-C-Xn-C oraz czterech wiązań disiarczkowych. Dzięki tej strukturze, albuminy 2S są odporne na obróbkę termiczną i proteolizę. Niektóre z tych...
-
Otrzymywanie i niektóre zastosowania unieruchomionych enzymów
PublicationWyjaśniono, dlaczego immobilizacja enzymów ma duże znaczenie w przemyśle. W artykule przedstawiono sposoby immobilizacji enzymów, jak też rodzaje i właściwości stosowanych nośników. Podano także charakterystykę rozmaitych preparatów unieruchomionych enzymów, przyczyny zmian właściwości biokatalizatorów spowodowane immibilizacją oraz określono najważniejsze zastosowania wymienionych preparatów.
-
Optymalizacja i walidacja metody ADSRRS-fingerprinting - konstrukcja zestawu diagnostycznego do różnicowania genetycznego drobnoustrojów
PublicationSpośród wszystkich metod typowania mikroorganizmów na szczególną uwagę zasługują metody oparte na analizie całego materiału genetycznego zawartego w komórce. Jedną z nich jest stosunkowo nowa technika ADSRRS-fingerprinting (ang. Amplification of DNA Fragments Surrounding Rare Restriction Sites). Na podstawie naszych badań można stwierdzić, iż charakteryzuje się ona wysokim potencjałem różnicującym, wiarygodnością, powtarzalnością...
-
Niektóre przyczyny unikatowej oporności cieplnej hipertermofili
PublicationWyjątkowa odporność cieplna hipertermofili stanowiących dogodne źródło termostabilnych enzymów wynika z niewielkich zmian budowy cząsteczek białek i kwasów nukleinowych oraz modyfikacji błon biologicznych. Przeżycie komórek hipertermofili w podwyższonych temperaturach umożliwia także synteza białek szoku cieplnego i rozmaitych substancji stabilizujących cząsteczki oraz szybka resynteza szczególnie termostabilnych intermediatów...
-
Charakterystyka preparatów beta- galaktozydazy z Sulfolobus shibatae.
PublicationCelem pracy było zbadanie przydatności cytoplazamatycznej beta- galaktozydazy/beta- glukozydazy z hipertermofilnego archeona Sulfolobus shibatae do hydrolizy laktozy. 16-krotny stopień oczyszczenia ekstraktu bezkomórkowego,zapewniający aktywność specyficzną 29,5 U/mg białka uzyskiwano poprzez frakcjonowanie siarczanem amonu, chromatografię jonowymienną i sączenie molekularne. Otrzymany preparat wykazywał największą aktywność...
-
Methods of ZnO nanoparticles synthesis
PublicationZinc oxide nanostructures are interesting nanomaterials with a wide range of applications. Since the physical and chemical properties of ZnO nanoparticles are influenced both by their shape and size, a control of morphology of ZnO structures is needed for their commercial usage. Different chemical, physical, and biological methods used to produce ZnO nanostructures can be found in the literature. The production of ZnO nanoparticles...
-
Termofile jako żródło alfa-glukozydaz użytecznych w produkcji syropów glukozowych
PublicationOkreślono różnice optymalnych warunków działania alfa-glukozydaz z różnych mikroorganizmów. Stwierdzono, że niektóre alfa-glukozydazy wyizolowane z ekstremalnych termofili zachowują aktywność w temperaturze około 100 C i są przydatne do wytwarzania syropów glukozowych.
-
A new division of bacterial UvrA homologues
PublicationThe UvrA protein is a DNA-binding and damage-recognition enzyme which participates in the prokaryotic type nucleotide excision repair (NER) pathway. It has recently been noted that some bacterial genomes comprise additional uvrA genes which encode five distinct types of UvrA homologue. We investigated the sequences of over 2400 bacterial genomes and found 130 examples of bacteria containing uvrA 2 genes. The sequence analyses conducted...
-
A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms
PublicationABSTRACT Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic...
-
SEMINARIUM DYPLOMOWE
e-Learning CoursesSeminarium dyplomowe dla kierunku Biotechnologia, specjalność Biotechnologia molekularna.
-
Biotechnologia Leków
e-Learning Courses -
Biotechnologia Leków
e-Learning CoursesW ramach wykładów przedstawiane są rodzaje leków biotechnologicznych i preparatów medycznych o takim charakterze, w tym antybiotyków, biofarmaceutyków białkowych i opartych na kwasach nukleinowych oraz szczepionek. Omawia się metody otrzymywania, izolacji i oceny właściwości chemicznych i biologicznych.
-
BIOTECHNOLOGIA LEKÓW
e-Learning CoursesW ramach wykładów przedstawiony zostanie aktualny stan wiedzy na temat leków i preparatów medycznych wytwarzanych metodami biotechnologicznymi, w tym antybiotyków, biofarmaceutyków białkowych, leków opartych na kwasach nukleinowych oraz szczepionkach.
-
Biotechnologia Leków
e-Learning Courses1. Biotechnologia farmaceutyczna rys historyczny, zakres działania, uwarunkowania prawne, problemy etyczne, odbiór społeczny.2. Drobnoustroje jako źródło nowych substancji biologicznie czynnych i przesiewowe techniki poszukiwania tych substancji3. Badania przedkliniczne i kliniczne nowych potencjalnych leków4. Znajomość metabolizmu drobnoustrojów podstawą planowania procesów biotechnologicznych.5. Peryferyjne szlaki metaboliczne...
-
Agnieszka Pladzyk dr hab. inż.
PeopleAgnieszka Pladzyk, born in 1973 in Pisz, graduated in 1998 in Biotechnology from the Faculty of Chemistry GUT. Her MSc thesis entitled Production of recombinant human calcitonin in bacterial system and its purification with the use of metal affinity chromatography was done under the supervision of professor Józef Kur. In 2003 she defended the PhD with distinctions and her PhD thesis entitled Cobalt tri-tert-butoxysilanethiolates...
-
CFD COUPLING OF VOF MODEL WITH ARRHENIUS EQUATION FOR ANALYSIS OF LASER-INDUCED THERMAL DEACTIVATION OF E. COLI
PublicationUnderstanding bacterial deactivation at the micro-scale, particularly with E. coli, is crucial for advancing microbiology and has promising applications in biomedical research. In this research contribution, we investigate the thermal inactivation of E. coli bacteria using gold nanoparticles irradiated by a green 1-W laser within a microfluidic chamber. The microfluidic device comprises a fluidic chamber filled with a thin film...
-
Bartosz Rybacki
PeopleA scientist, engineer, graduate of molecular biotechnology, R&D of the Stardust project, coordinator of the AMBER rocket project, member of the Polish Astrobiological Society, Polish Rocketry Association, Innspace Team and PTAstrobio Working Group. Employee of the Blirt S.A.. Ad Astra!