KPD | Kolekcja Plazmidów i Drobnoustrojów - Laboratorium - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

KPD | Kolekcja Plazmidów i Drobnoustrojów

KPD specjalizuje się w długoterminowym przechowywaniu próbek materiału mikrobiologicznego, jego identyfikacji i walidacji.

 

Kolekcja Plazmidów i Drobnoustrojów (KPD) działa na Wydziale Biologii Uniwersytetu Gdańskiego.

Do naszych zadań należy:

  • długoterminowe przechowywanie szczepów bakterii, bakteriofagów oraz plazmidów do celów naukowo-badawczych
  • selekcja szczepów o potencjalnym znaczeniu biotechnologicznym
  • upowszechnianie dostępu do zasobów genetycznych o znanym pochodzeniu zgodnie z Protokołem z Nagoi
  • wymiana i współpraca z innymi kolekcjami mikroorganizmów w Polsce i na świecie
  • gromadzenie i udostępnianie materiału biologiczny na potrzeby szeroko pojętej edukacji i popularyzacji wiedzy
  • upowszechnianie wiedzy o drobnoustrojach.

Promując najlepsze praktyki oraz ideę deponowania przez naukowców materiału badawczego, Kolekcja zabezpiecza cenne próbki do dalszych badań naukowych i rozwojowych.

Jako przedsięwzięcie o charakterze niekomercyjnym, którego celem jest upowszechnienie dostępu do wysokiej jakości materiału biologicznego, Kolekcja służy całemu środowisku naukowemu.

Ilustracja publikacji Ilustracja publikacji

Kolekcja dysponuje światowej klasy infrastrukturą naukowo-badawczą, umożliwiającą kompleksową charakterystykę oraz długoterminowe przechowywanie mikroorganizmów.

Zdeponowanie szczepów mikroorganizmów lub plazmidów w ogólnodostępnej części kolekcji KPD nie wiąże się z żadnymi opłatami.

DEPONOWANIE mikroorganizmów i plazmidów

W zakresie zainteresowań KPD znajdują się:

  • Naturalnie występujące szczepy bakterii i archeonów
  • Bakteriofagi
  • Plazmidy lub wektory plazmidowe

Kolekcja dokłada wszelkich starań, aby powierzony jej materiał biologiczny był przechowywany w warunkach, które zapewnią jego żywotność/ zdolność do replikacji, stabilność genetyczną oraz fizjologiczną.

Kolekcja akceptuje wyłącznie materiał biologiczny zaklasyfikowany do

  • grupy 1 zagrożenia biologicznego | Grupa P1 zagrożenia biologicznego, Klasa bezpieczeństwa biologicznego BSL-1 oraz 
  • grupy 2 zagrożenia biologicznego | P2 /  BSL-2
    (wykaz takich czynników znajduje się w Rozporządzeniu Ministra Zdrowia Roz. Min. Zdrowia  z dn. 22 kwietnia 2005 r., Dz. Ust. Nr 81 poz. 716, załącznik nr 1) 

Warunkiem zdeponowania materiału biologicznego w KPD jest wypełnienie formularza akcesyjnego (KPD ACCESSION FORM).

Przed przekazaniem KPD materiału, prosimy o kontakt z kuratorem KPD    (kpd@ug.edu.pl) w celu potwierdzenia czy kolekcja dysponuje technicznymi możliwościami przechowywania danego materiału biologicznego. 

Zdeponowanie w KPD szczepów mikroorganizmów lub plazmidów jest nieodpłatne.

Materiał biologiczny powierzony Kolekcji jako „depozyt publiczny ”, ang. public deposit jest dostępny dla naukowców zarówno z ośrodków badawczych zarówno niekomercyjnych jak i komercyjnych. Informacja o zdeponowaniu materiału biologicznego jak i jego opis naukowy udostępnione są w katalogu elektronicznym na stronie internetowej KPD. Przekazanie zdeponowanego materiału stronie trzeciej przez KPD odbywa się na zasadach określonych w Umowie o Przekazaniu Materiału (SMTA) oraz na warunkach określonych w innych umowach związanych z danym materiałem.

 

udostępnianie  szczepów i PLAZmidów

Materiał biologiczny powierzony Kolekcji jest dostępny dla naukowców z ośrodków badawczych zarówno komercyjnych, jak i niekomercyjnych. 

 Zbiory obejmują wyłącznie materiał biologiczny zaklasyfikowany do grupy 1 zagrożenia biologicznego (Grupa P1 zagrożenia biologicznego, Klasa bezpieczeństwa biologicznego BSL-1) oraz do grupy 2 zagrożenia (P2, BSL-2).

KPD udostępnia wyłącznie materiał biologiczny o znanym i wiarygodnym pochodzeniu, który został pozyskany zgodnie z prawem, w tym z ustaleniami Protokołu z Nagoi dotyczącymi „dostępu do zasobów genetycznych oraz uczciwego i sprawiedliwego podziału korzyści wynikających z ich wykorzystania” oraz zgodnie z Rozporządzeniem Rady UE i Parlamentu Europejskiego nr 511/2014, które nakłada na użytkowników zasobów genetycznych, w tym naukowców, obowiązek „należytej staranności, jeśli chodzi o dążenie do uzyskania wszystkich niezbędnych informacji dotyczących pierwotnego źródła, z którego zasoby genetyczne zostały pozyskane, jak również kolejnych użytkowników”.

KPD dokłada wszelkich starań, aby dostarczany materiał biologiczny był jak najwyższej jakości, spełniał kryteria czystości i żywotności oraz autentyczności. W przypadku złożenia pisemnej reklamacji w ciągu 30 dni od dnia wysyłki, KPD zobowiązuje się do bezpłatnej wymiany materiału.

Aby otrzymać próbki, należy wypełnić „Formularz zamówienia” i przekazać nam podpisany dokument lub przesłać jego skan z podpisem na adres e-mailowy kpd@ug.edu.pl

Zdeponowane w KPD szczepy mikroorganizmów bądź plazmidy udostępniane są na podstawie umowy o przekazaniu materiału (MTA) oraz na warunkach określonych w innych umowach związanych z danym materiałem badawczym.

Misją KPD jest zapewnienie dostępu do materiału badwczego wysokiej jakości. 
Aby pokryć koszty przygotowania próbek oraz ich wysłki, KPD pobiera opłatę manipulacyjną.

 

W publikacjach, w których wykorzystano szczepy drobnoustrojów lub plazmidy pozyskane z KPD, autorzy są zobowiązani wskazać KPD jako źródło materiału (przy nazwie szczepu/plazmidu należy podać numer nadany przez KPD).  


W przypadku użycia materiału, którego konstrukcja została opisana w publikacji naukowej, należy zacytować pracę źródłową.

Infrastruktura badawcza

Opis poszczególnych w sekcji poniżej pn. Aparatura w laboratorium

 

współpraca naukowa

Pracownicy KPD są zangażowani w realizację szeregu projektów badawczych.

Projekty międzynarodowe
  • x
  • y
  • z
Projekty  NCN

Efektem wspłópracy badawczej są niżej wymienione publikacje

Aktywność na forum międzynarodowym

KPD zarejestrowana jest w Światowym Centrum Informacji o Mikroorganizmach (Word Data Center for Microorganisms, WDCM)
pod numerem WDCM1084.

Oznacza to, że zdeponowanie mikroorganizmów  w Kolekcji KPD jest honorowane przez wszystkie czasopisma naukowe. 

Od 2016 r. KPD jest członkiem Europejskiej Organizacji Kolekcji Kultur (European Culture Collections' Organisation, ECCO). 

W styczniu 2023 r.,  Kolekcja KPD uzyskała Status Organu Depozytu Międzynarodowego na mocy Traktatu Budapesztańskiego o międzynarodowym uznawaniu depozytu drobnoustrojów dla celów postępowania patentowego.  

Tym samym Kolekcja dołączyła do grona 49 kolekcji mikroorganizmów na świecie, upoważnionych do przyjmowania, akceptacji i przechowywania próbek drobnoustrojów dla celów postępowania patentowego. Na mocy art. 3 Traktatu Budapesztańskiego depozyt dokonany w organie depozytu międzynarodowego musi być uznany do celów postępowania patentowego przez państwa-strony Traktatu i państwa te nie mogą wymagać spełnienia innych wymogów niż te, które zostały przewidziane w Traktacie i Regulaminie wykonawczym, lub wymogów dodatkowych.

Tematyka badawcza / profil działalności laboratorium

Rodzaj badań

  • Identyfikacja i charakterystyka mikroorganizmów deponowanych w Kolekcji KPD
    Identyfikacja bakterii z wykorzystaniem spektrometrii mas.
  • Fenotypowanie mikroorganizmów lub ich populacji
    Identyfikacja oraz fenotypowanie drobnoustrojów | Analiza profilu metabolicznego społeczności mikroorganizmów (CLPP – Community Level Physiological Profiles) | Fenotypowanie komórek ssaczych | Badania funkcji mitochondriów.

Dyscyplina NCN

  • NZ1 Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna / NZ1_1 Biologia molekularna

Dziedzina i obiekt badań

  • B. Badania biologicznie i biochemiczne / K. Badania mikrobiologiczne
  • D. Badania kliniczne, medyczne i weterynaryjne / M. Badania inne

Aparatura w laboratorium

Informacje szczegółowe

Kontakt:
Dr n med. Anna-Karina Kaczorowska
Opiekun:
Dr n med. Anna-Karina Kaczorowska
Jednostki powiązane:
Weryfikacja:
Brak weryfikacji

wyświetlono 5217 razy