DDLMS PCR double digestion Ligation Mediated Suppression PCR - a new technique for bacterial specific differentiation
Abstrakt
A new diagnostic kit for K. oxytoca specific differentiation based on ddLMS PCR (ang. double digest ligation Mediated PCR) technique is shown. As a species-specific DNA fragment pehX gene, encoding the enzyme polygalactouronase, was chosen. The genome sequence of K. oxytoca is digested with two endonucleases: AclI and BclI which cut DNA before and after pehX gene. The polymorphic DNA fragments are ligated with AclI-end-specific linker. Only DNA fragmens which consist pehX gene are amplified from the ligation product by PCR. Variety of PCR product length can differentiate the K. oxytoca strains among species.
Autorzy (3)
Cytuj jako
Pełna treść
pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Inne
- Typ:
- supllement, wydanie specjalne, dodatek
- Opublikowano w:
-
Acta Biochimica Polonica
nr 58,
ISSN: 0001-527X - Tytuł wydania:
- Acta Biochimica Polonica.
- Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2011
- Opis bibliograficzny:
- Stojowska K., Krawczyk B., Kur J.: DDLMS PCR double digestion Ligation Mediated Suppression PCR - a new technique for bacterial specific differentiation// Acta Biochimica Polonica. -Vol. 58., nr. suppl. 4 (2011),
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 114 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
A new assay for the simultaneous identification and differentiation of Klebsiella oxytoca strains.
- K. Stojowska-Swędrzyńska,
- B. Krawczyk