DNA methylation as a mediator of HLA-DRB1*15:01 and a protective variant in multiple sclerosis - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

DNA methylation as a mediator of HLA-DRB1*15:01 and a protective variant in multiple sclerosis

Abstrakt

The human leukocyte antigen (HLA) haplotype DRB1*15:01 is the major risk factor for multiple sclerosis (MS). Here, we find that DRB1*15:01 is hypomethylated and predominantly expressed in monocytes among carriers of DRB1*15:01. A differentially methylated region (DMR) encompassing HLA-DRB1 exon 2 is particularly affected and displays methylation-sensitive regulatory properties in vitro. Causal inference and Mendelian randomization provide evidence that HLA variants mediate risk for MS via changes in the HLA-DRB1 DMR that modify HLA-DRB1 expression. Meta-analysis of 14,259 cases and 171,347 controls confirms that these variants confer risk from DRB1*15:01 and also identifies a protective variant (rs9267649, p < 3.32 × 10-8, odds ratio = 0.86) after conditioning for all MS-associated variants in the region. rs9267649 is associated with increased DNA methylation at the HLA-DRB1 DMR and reduced expression of HLA-DRB1, suggesting a modulation of the DRB1*15:01 effect. Our integrative approach provides insights into the molecular mechanisms of MS susceptibility and suggests putative therapeutic strategies targeting a methylation-mediated regulation of the major risk gene.

Cytowania

  • 1 4 9

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 1 4 1

    Scopus

Autorzy (48)

  • Zdjęcie użytkownika  Lara Kular

    Lara Kular

  • Zdjęcie użytkownika  Yun Liu

    Yun Liu

  • Zdjęcie użytkownika  Sabrina Ruhrmann

    Sabrina Ruhrmann

  • Zdjęcie użytkownika  Galina Zheleznyakova

    Galina Zheleznyakova

  • Zdjęcie użytkownika  Francesco Marabita

    Francesco Marabita

  • Zdjęcie użytkownika  David Gomez-Cabrero

    David Gomez-Cabrero

  • Zdjęcie użytkownika  Tojo James

    Tojo James

  • Zdjęcie użytkownika  Ewoud Ewing

    Ewoud Ewing

  • Zdjęcie użytkownika  Magdalena Lindén

    Magdalena Lindén

  • Zdjęcie użytkownika  Shahin Aeinehband

    Shahin Aeinehband

  • Zdjęcie użytkownika  Pernilla Stridh

    Pernilla Stridh

  • Zdjęcie użytkownika  Jenny Link

    Jenny Link

  • Zdjęcie użytkownika  Till Andlauer

    Till Andlauer

  • Zdjęcie użytkownika  Christiane Gasperi

    Christiane Gasperi

  • Zdjęcie użytkownika  Heinz Wiendl

    Heinz Wiendl

  • Zdjęcie użytkownika  Frauke Zipp

    Frauke Zipp

  • Zdjęcie użytkownika  Ralf Gold

    Ralf Gold

  • Zdjęcie użytkownika  Björn Tackenberg

    Björn Tackenberg

  • Zdjęcie użytkownika  Frank Weber

    Frank Weber

  • Zdjęcie użytkownika  Bernhard Hemmer

    Bernhard Hemmer

  • Zdjęcie użytkownika  Konstantin Strauch

    Konstantin Strauch

  • Zdjęcie użytkownika  Stefanie Heilmann-Heimbach

    Stefanie Heilmann-Heimbach

  • Zdjęcie użytkownika  Rajesh Rawal

    Rajesh Rawal

  • Zdjęcie użytkownika  Ulf Schminke

    Ulf Schminke

  • Zdjęcie użytkownika  Carsten Schmidt

    Carsten Schmidt

  • Zdjęcie użytkownika  Tim Kacprowski

    Tim Kacprowski

  • Zdjęcie użytkownika  Andre Franke

    Andre Franke

  • Zdjęcie użytkownika  Matthias Laudes

    Matthias Laudes

  • Zdjęcie użytkownika  Alexander Dilthey

    Alexander Dilthey

  • Zdjęcie użytkownika  Elisabeth Celius

    Elisabeth Celius

  • Zdjęcie użytkownika  Helle Søndergaard

    Helle Søndergaard

  • Zdjęcie użytkownika  Jesper Tegnér

    Jesper Tegnér

  • Zdjęcie użytkownika  Hanne Harbo

    Hanne Harbo

  • Zdjęcie użytkownika  Annette Oturai

    Annette Oturai

  • Zdjęcie użytkownika  Sigurgeir Olafsson

    Sigurgeir Olafsson

  • Zdjęcie użytkownika  Hannes Eggertsson

    Hannes Eggertsson

  • Zdjęcie użytkownika  Bjarni Halldorsson

    Bjarni Halldorsson

  • Zdjęcie użytkownika  Haukur Hjaltason

    Haukur Hjaltason

  • Zdjęcie użytkownika  Elias Olafsson

    Elias Olafsson

  • Zdjęcie użytkownika  Ingileif Jonsdottir

    Ingileif Jonsdottir

  • Zdjęcie użytkownika  Kari Stefansson

    Kari Stefansson

  • Zdjęcie użytkownika  Tomas Olsson

    Tomas Olsson

  • Zdjęcie użytkownika  Fredrik Piehl

    Fredrik Piehl

  • Zdjęcie użytkownika  Tomas Ekström

    Tomas Ekström

  • Zdjęcie użytkownika  Ingrid Kockum

    Ingrid Kockum

  • Zdjęcie użytkownika  Andrew Feinberg

    Andrew Feinberg

  • Zdjęcie użytkownika  Maja Jagodic

    Maja Jagodic

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuły w czasopismach
Opublikowano w:
Nature Communications nr 9, strony 1 - 15,
ISSN: 2041-1723
Język:
angielski
Rok wydania:
2018
Opis bibliograficzny:
Kular L., Liu Y., Ruhrmann S., Zheleznyakova G., Marabita F., Gomez-Cabrero D., James T., Ewing E., Lindén M., Górnikiewicz B., Aeinehband S., Stridh P., Link J., Andlauer T., Gasperi C., Wiendl H., Zipp F., Gold R., Tackenberg B., Weber F., Hemmer B., Strauch K., Heilmann-Heimbach S., Rawal R., Schminke U., Schmidt C., Kacprowski T., Franke A., Laudes M., Dilthey A., Celius E., Søndergaard H., Tegnér J., Harbo H., Oturai A., Olafsson S., Eggertsson H., Halldorsson B., Hjaltason H., Olafsson E., Jonsdottir I., Stefansson K., Olsson T., Piehl F., Ekström T., Kockum I., Feinberg A., Jagodic M.: DNA methylation as a mediator of HLA-DRB1*15:01 and a protective variant in multiple sclerosis// Nature Communications -Vol. 9,iss. 1 (2018), s.1-15
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1038/s41467-018-04732-5
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 129 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi