Wyszukiwarka
Abstrakt
Abstract - We present an implicit solvent model for ab initio electronic-structure calculations which is fully self-consistent and is based on direct solution of the nonhomogeneous Poisson equation. The solute cavity is naturally defined in terms of an isosurface of the electronic density according to the formula of Fattebert and Gygi (J. Comput. Chem., 23 (2002) 662). While this model depends on only two parameters, we demonstrate that by using appropriate boundary conditions and dispersion-repulsion contributions, solvation energies obtained for an extensive test set including neutral and charged molecules show dramatic improvement compared to existing models. Our approach is implemented in, but not restricted to, a linear-scaling density functional theory (DFT) framework, opening the path for self-consistent implicit solvent DFT calculations on systems of unprecedented size, which we demonstrate with calculations on a 2615-atom proteinligand complex.
Autorzy (5)
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1209/0295-5075/95/43001
- Licencja
- Copyright (2011 IOP Publishing)
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Opublikowano w:
-
EPL-EUROPHYS LETT
nr 95,
strony 43001 - 43006,
ISSN: 0295-5075 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2011
- Opis bibliograficzny:
- Dziedzic J., Helal H., Skylaris C., Mostofi A., Payne M.: Minimal parameter implicit solvent model for ab initioelectronic-structure calculations// EUROPHYSICS LETTERS. -Vol. 95, nr. No.4 (2011), s.43001-43006
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 128 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
Large-scale DFT calculations in implicit solvent-A case study on the T4 lysozyme L99A/M102Q protein
- J. Dziedzic,
- S. Fox,
- T. Fox
- + 2 autorów