Modeling the Structure, Dynamics, and Transformations of Proteins with the UNRES Force Field - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Modeling the Structure, Dynamics, and Transformations of Proteins with the UNRES Force Field

Abstrakt

The physics-based united-residue (UNRES) model of proteins ( www.unres.pl ) has been designed to carry out large-scale simulations of protein folding. The force field has been derived and parameterized based on the principles of statistical-mechanics, which makes it independent of structural databases and applicable to treat nonstandard situations such as, proteins that contain D-amino-acid residues. Powered by Langevin dynamics and its replica-exchange extensions, UNRES has found a variety of applications, including ab initio and database-assisted protein-structure prediction, simulating protein-folding pathways, exploring protein free-energy landscapes, and solving biological problems. This chapter provides a summary of UNRES and a guide for potential users regarding the application of the UNRES package in a variety of research tasks.

Cytowania

  • 0

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 0

    Scopus

Autorzy (12)

Cytuj jako

Pełna treść

pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja monograficzna
Typ:
rozdział, artykuł w książce - dziele zbiorowym /podręczniku w języku o zasięgu międzynarodowym
Język:
angielski
Rok wydania:
2022
Opis bibliograficzny:
Sieradzan A. K., Czaplewski C., Krupa P., Mozolewska M., Karczyńska A. S., Lipska A. G., Lubecka E., Gołaś E., Wirecki T., Makowski M., Ołdziej S., Liwo A.: Modeling the Structure, Dynamics, and Transformations of Proteins with the UNRES Force Field// Protein Folding. Methods and Protocols.Methods in Molecular Biology/ : , 2022, s.399-416
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1007/978-1-0716-1716-8_23
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 1 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi