Modelling charge transfer processes in C2+ -tetrahydrofuran collision for ion-induced radiation damage in DNA building blocks - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Modelling charge transfer processes in C2+ -tetrahydrofuran collision for ion-induced radiation damage in DNA building blocks

Abstrakt

Investigations of collision-induced processes involving carbon ions and molecules of biological interest in particular DNA building blocks, are crucial to model the effect of radiation on cells in order to improve medical treatments for cancer therapy. Using carbon ions appears to be one of the most efficient ways to increase biological effectiveness to damage cancerous cells by irradiating deep-seated tumors. Therefore, interest in accurate calculations to understand fundamental processes occurring in ion–molecule collision systems has been growing recently. In this context, the charge transfer process in the collision of C2+(1s22s2) ions with the heterocyclic sugar moiety building block tetrahydrofuran (THF) was studied in order to interpret the mechanisms occurring at the molecular level. The molecular structure properties of THF were obtained by means of ab initio quantum chemistry methods. The role of the conformational structure and the orientation of the THF molecule in collision with C2+ ions are particularly discussed. Anisotropic effects of the process dynamics in the collision energy ranging from eV to keV by means of semiclassical treatment are also presented and compared to previous experimental and theoretical investigations. A detailed analysis of the obtained cross sections points out an increase in these values by three orders of magnitude by a change of the THF symmetry from C2v to Cs in collision with C2+, which determines a more efficient charge transfer in this case.

Cytowania

  • 6

    CrossRef

  • 8

    Web of Science

  • 8

    Scopus

Cytuj jako

Pełna treść

pobierz publikację
pobrano 22 razy
Wersja publikacji
Accepted albo Published Version
Licencja
Copyright (the Owner Societies 2017)

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
Opublikowano w:
PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS nr 19, wydanie 30, strony 1 - 11,
ISSN: 1463-9076
Język:
angielski
Rok wydania:
2017
Opis bibliograficzny:
Erdmann E., Bacchus-Montabonel M., Łabuda M.: Modelling charge transfer processes in C2+ -tetrahydrofuran collision for ion-induced radiation damage in DNA building blocks// PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS. -Vol. 19, iss. 30 (2017), s.1-11
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1039/c7cp02100c
Bibliografia: test
  1. B. D. Michael and P. D. O'Neill, Science, 2000, 287, 1603. otwiera się w nowej karcie
  2. B. Boudaïffa, P. Cloutier, D. Hunting, M. A. Huels and L. Sanche, Science, 2000, 287, 1658. otwiera się w nowej karcie
  3. G. Vall-Llosera, M. A. Huels, M. Coreno, A. Kivimäki, K. Jakubowska, M. Stankiewicz and E. Rachlew, ChemPhysChem, 2008, 9, 1020. otwiera się w nowej karcie
  4. O. González-Magaña, M. Tiemens, G. Reitsma, L. Boschman, M. Door, S. Bari, P. O. Lahaie, J. R. Wagner, M. A. Huels, R. Hoekstra and T. Schlathölter, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2013, 87, 1. otwiera się w nowej karcie
  5. F. Gianturco and R. R. Lucchese, J. Chem. Phys., 2004, 120, 7446. otwiera się w nowej karcie
  6. Z. Deng, M. Imhoff and M. A. Huels, J. Chem. Phys., 2005, 123, 144509. otwiera się w nowej karcie
  7. L. Sanche, Eur. Phys. J. D, 2005, 35, 367. otwiera się w nowej karcie
  8. J. De Vries, R. Hoekstra, R. Morgenstern and T. Schlathölter, Eur. Phys. J. D, 2003, 24, 161.
  9. J. De Vries, R. Hoekstra, R. Morgenstern and T. Schlathölter, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2002, 35, 21.
  10. T. Schlathölter, R. Hoekstra and R. Morgenstern, Int. J. Mass Spectrom., 2004, 233, 1. otwiera się w nowej karcie
  11. T. J. Wasowicz, A. Kivimäki, M. Dampc, M. Coreno, M. De Simone and M. Zubek, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2011, 83, 033411. otwiera się w nowej karcie
  12. P. M. Mayer, M. F. Guest, L. Cooper, L. G. Shpinkova, E. E. Rennie, D. M. P. Holland and D. A. Shaw, J. Phys. Chem. A, 2009, 113, 10923. otwiera się w nowej karcie
  13. M. Dampc, E. Szymanska, B. Mielewska and M. Zubek, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2011, 44, 055206. otwiera się w nowej karcie
  14. T. P. T. Do, M. Leung, M. Fuss, G. Garcia, F. Blanco, K. Ratnavelu and M. J. Brunger, J. Chem. Phys., 2011, 134, 1. otwiera się w nowej karcie
  15. P. Mozejko, E. Ptasińska-Denga, A. Domaracka and C. Szmytkowski, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2006, 74, 12708.
  16. C. J. Colyer, S. M. Bellm, B. Lohmann, G. F. Hanne, O. Al-Hagan, D. H. Madison and C. G. Ning, J. Chem. Phys., 2010, 133, 124302. otwiera się w nowej karcie
  17. M. C. Fuss, R. Colmenares, A. G. Sanz, A. Muñoz, J. C. Oller, F. Blanco, T. P. T. Do, M. J. Brunger, D. Almeida, P. Limão- Vieira and G. García, J. Phys.: Conf. Ser., 2012, 373, 12010. otwiera się w nowej karcie
  18. D. Almeida, F. Ferreira da Silva, S. Eden, G. Garcia and P. Limão-Vieira, J. Phys. Chem. A, 2014, 118, 690. otwiera się w nowej karcie
  19. D. Almeida, F. Ferreira da Silva, G. Garcia and P. Limão-Vieira, J. Chem. Phys., 2013, 139, 114304. otwiera się w nowej karcie
  20. T. J. Wasowicz and B. Pranszke, J. Phys. Chem. A, 2015, 119, 581. otwiera się w nowej karcie
  21. M. C. Bacchus-Montabonel, M. Łabuda, Y. S. Tergiman and J. E. Sienkiewicz, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2005, 72, 052706. otwiera się w nowej karcie
  22. M. C. Bacchus-Montabonel, Eur. Phys. J. D, 2012, 66, 175/7. otwiera się w nowej karcie
  23. M. C. Bacchus-Montabonel, Appl. Radiat. Isot., 2014, 83, 95. otwiera się w nowej karcie
  24. M. C. Bacchus-Montabonel and Y. S. Tergiman, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2006, 74, 054702/4. otwiera się w nowej karcie
  25. P. Sulzer, S. Ptasinska, F. Zappa, B. Mielewska, A. R. Milosavljevic, P. Scheier, T. D. Märk, I. Bald, S. Gohlke, M. A. Huels and E. Illenberger, J. Chem. Phys., 2006, 125, 044304. otwiera się w nowej karcie
  26. S.-H. Lee, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 2655. otwiera się w nowej karcie
  27. A. Lifshitz, M. Bidani and S. Bidani, J. Phys. Chem., 1986, 90, 3422. otwiera się w nowej karcie
  28. D. G. Melnik, S. Gopalakrishnan, T. A. Miller and F. C. De Lucia, J. Chem. Phys., 2003, 118, 3589. otwiera się w nowej karcie
  29. V. M. Rayón and J. A. Sordo, J. Chem. Phys., 2005, 122, 204303. otwiera się w nowej karcie
  30. A. Giuliani, P. Limão-Vieira, D. Duflot, A. R. Milosavljevic, B. P. Marinkovic, S. V. Hoffmann, N. Mason, J. Delwiche and M. J. Hubin-Franskin, Eur. Phys. J. D, 2009, 51, 97. otwiera się w nowej karcie
  31. B. Cadioli, E. Gallinella, C. Coulombeau, H. Jobic and G. Berthier, J. Phys. Chem., 1993, 97, 7844. otwiera się w nowej karcie
  32. P. K. Sahu, A. Chaudhari and S. L. Lee, Chem. Phys. Lett., 2004, 386, 351. otwiera się w nowej karcie
  33. E. Erdmann and M. Łabuda, J. Phys.: Conf. Ser., 2015, 635, 22097. otwiera się w nowej karcie
  34. M. A. Hervé du Penhoat, P. López-Tarifa, K. K. Ghose, Y. Jeanvoine, M. P. Gaigeot, R. Vuilleumier, M. F. Politis and M. C. Bacchus-Montabonel, J. Mol. Model., 2014, 20, 2221.
  35. M. C. Bacchus-Montabonel, J. Phys. Chem. A, 2014, 118, 6326. otwiera się w nowej karcie
  36. M. C. Bacchus-Montabonel, J. Phys. Chem. A, 2013, 117, 14169. otwiera się w nowej karcie
  37. M. Łabuda, Y. S. Tergiman, M. C. Bacchus-Montabonel and J. E. Sienkiewicz, Chem. Phys. Lett., 2004, 394, 446. otwiera się w nowej karcie
  38. M. Łabuda, Y. S. Tergiman, M. C. Bacchus-Montabonel and J. E. Sienkiewicz, Int. J. Mol. Sci., 2004, 5, 265. otwiera się w nowej karcie
  39. M. C. Bacchus-Montabonel, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 1999, 59, 3569. otwiera się w nowej karcie
  40. M. C. Bacchus-Montabonel, M. Łabuda, Y. S. Tergiman and J. E. Sienkiewicz, Progress in Theoretical Chemistry and Physcis, Springer, College. Park. Md., 2007, vol. 16, p. 203. otwiera się w nowej karcie
  41. E. Bene, P. Martínez, G. J. Halász, Á. Vibók and M. C. Bacchus-Montabonel, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2009, 80, 012711. otwiera się w nowej karcie
  42. M. C. Bacchus-Montabonel and Y. S. Tergiman, Chem. Phys. Lett., 2011, 503, 45. otwiera się w nowej karcie
  43. N. Vaeck, M. Desouter-Lecomte and J. Liévin, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 1999, 32, 409. otwiera się w nowej karcie
  44. N. Vaeck, M. C. Bacchus-Montabonel, E. Baloïtcha and M. Desouter-Lecomte, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2001, 63, 427041. otwiera się w nowej karcie
  45. E. Baloïtcha, M. Desouter-Lecomte, M. C. Bacchus-Montabonel and N. Vaeck, J. Chem. Phys., 2001, 114, 8741.
  46. M. Łabuda, J. González-Vázquez and L. González, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 5439. otwiera się w nowej karcie
  47. M. Łabuda, J. González-Vázquez, F. Martín and L. González, Chem. Phys., 2012, 400, 165. otwiera się w nowej karcie
  48. A. Chenel, E. Mangaud, Y. Justum, D. Talbi, M. C. Bacchus- Montabonel and M. Desouter-Lecomte, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2010, 43, 245701. otwiera się w nowej karcie
  49. R. J. Allan, C. Courbin, P. Salas and P. Wahnon, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 1990, 23, L461. otwiera się w nowej karcie
  50. H.-J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby and M. Schütz, Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci., 2012, 2, 242. otwiera się w nowej karcie
  51. H.-J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby, M. Schütz, P. Celani, W. Györffy, D. Kats, T. Korona, R. Lindh, A. Mitrushenkov, G. Rauhut, K. R. Shamasundar, T. B. Adler, R. D. Amos, A. Bernhardsson, A. Berning, D. L. Cooper, M. J. O. Deegan, A. J. Dobbyn, F. Eckert, E. Goll, C. Hampel, A. Hesselmann, G. Hetzer, T. Hrenar, G. Jansen, C. Köppl, Y. Liu, A. W. Lloyd, R. A. Mata, A. J. May, S. J. McNicholas, W. Meyer, M. E. Mura, A. Nicklass, D. P. O'Neill, P. Palmieri, D. Peng, K. Pflüger, R. Pitzer, M. Reiher, T. Shiozaki, H. Stoll, A. J. Stone, R. Tarroni, T. Thorsteinsson and M. Wang, MOLPRO ver.2015.1, 2015. otwiera się w nowej karcie
  52. A. D. Becke, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 1988, 38, 3098. otwiera się w nowej karcie
  53. A. D. Becke, J. Chem. Phys., 1993, 98, 5648. otwiera się w nowej karcie
  54. C. Lee, W. Yang and R. G. Parr, Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys., 1988, 37, 785. otwiera się w nowej karcie
  55. J. F. Stanton and R. J. Bartlett, J. Chem. Phys., 1993, 98, 7029. otwiera się w nowej karcie
  56. B. O. Roos, Ab initio methods in Quantum Chemistry II, Wiley-VCH, Chichester, 1987, pp. 399-445.
  57. T. Schlathölter, F. Alvarado, S. Bari and R. Hoekstra, Phys. Scr., 2006, 73, C113. otwiera się w nowej karcie
  58. F. Alvarado, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, J. Chem. Phys., 2007, 127, 034301. otwiera się w nowej karcie
  59. S. Maclot, M. Capron, R. Maisonny, A. Lawicki, A. Mery, J. Rangama, J.-Y. Chesnel, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, ChemPhysChem, 2011, 12, 930. otwiera się w nowej karcie
  60. M. C. Bacchus-Montabonel, Eur. Phys. J. D, 2015, 69, 107. otwiera się w nowej karcie
  61. A. N. Agnihotri, S. Kasthurirangan, S. Nandi, A. Kumar, M. E. Galassi, R. D. Rivarola, O. Fojon, C. Champion, J. Hanssen, H. Lekadir, P. F. Weck and L. C. Tribedi, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2012, 85, 1. otwiera się w nowej karcie
  62. C. Illescas, L. F. Errea and L. Méndez, Phys. Scr., 2013, T156, 14033. otwiera się w nowej karcie
  63. M. C. Bacchus-Montabonel, Y. S. Tergiman and D. Talbi, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2009, 79, 012710. otwiera się w nowej karcie
  64. F. Alvarado, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, Phys. Chem. Chem. Phys., 2006, 8, 1922. otwiera się w nowej karcie
  65. Z. Deng, I. Bald, E. Illenberger and M. A. Huels, Phys. Rev. Lett., 2005, 95, 153201. otwiera się w nowej karcie
  66. T. J. Wasowicz and B. Pranszke, Eur. Phys. J. D, 2016, 70, 175. otwiera się w nowej karcie
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 67 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi