Modelling charge transfer processes in C2+ -tetrahydrofuran collision for ion-induced radiation damage in DNA building blocks
Abstrakt
Investigations of collision-induced processes involving carbon ions and molecules of biological interest in particular DNA building blocks, are crucial to model the effect of radiation on cells in order to improve medical treatments for cancer therapy. Using carbon ions appears to be one of the most efficient ways to increase biological effectiveness to damage cancerous cells by irradiating deep-seated tumors. Therefore, interest in accurate calculations to understand fundamental processes occurring in ion–molecule collision systems has been growing recently. In this context, the charge transfer process in the collision of C2+(1s22s2) ions with the heterocyclic sugar moiety building block tetrahydrofuran (THF) was studied in order to interpret the mechanisms occurring at the molecular level. The molecular structure properties of THF were obtained by means of ab initio quantum chemistry methods. The role of the conformational structure and the orientation of the THF molecule in collision with C2+ ions are particularly discussed. Anisotropic effects of the process dynamics in the collision energy ranging from eV to keV by means of semiclassical treatment are also presented and compared to previous experimental and theoretical investigations. A detailed analysis of the obtained cross sections points out an increase in these values by three orders of magnitude by a change of the THF symmetry from C2v to Cs in collision with C2+, which determines a more efficient charge transfer in this case.
Cytowania
-
7
CrossRef
-
0
Web of Science
-
9
Scopus
Autorzy (3)
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- Licencja
- Copyright (the Owner Societies 2017)
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Opublikowano w:
-
PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
nr 19,
wydanie 30,
strony 1 - 11,
ISSN: 1463-9076 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2017
- Opis bibliograficzny:
- Erdmann E., Bacchus-Montabonel M., Łabuda M.: Modelling charge transfer processes in C2+ -tetrahydrofuran collision for ion-induced radiation damage in DNA building blocks// PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS. -Vol. 19, iss. 30 (2017), s.1-11
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1039/c7cp02100c
- Bibliografia: test
-
- B. D. Michael and P. D. O'Neill, Science, 2000, 287, 1603. otwiera się w nowej karcie
- B. Boudaïffa, P. Cloutier, D. Hunting, M. A. Huels and L. Sanche, Science, 2000, 287, 1658. otwiera się w nowej karcie
- G. Vall-Llosera, M. A. Huels, M. Coreno, A. Kivimäki, K. Jakubowska, M. Stankiewicz and E. Rachlew, ChemPhysChem, 2008, 9, 1020. otwiera się w nowej karcie
- O. González-Magaña, M. Tiemens, G. Reitsma, L. Boschman, M. Door, S. Bari, P. O. Lahaie, J. R. Wagner, M. A. Huels, R. Hoekstra and T. Schlathölter, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2013, 87, 1. otwiera się w nowej karcie
- F. Gianturco and R. R. Lucchese, J. Chem. Phys., 2004, 120, 7446. otwiera się w nowej karcie
- Z. Deng, M. Imhoff and M. A. Huels, J. Chem. Phys., 2005, 123, 144509. otwiera się w nowej karcie
- L. Sanche, Eur. Phys. J. D, 2005, 35, 367. otwiera się w nowej karcie
- J. De Vries, R. Hoekstra, R. Morgenstern and T. Schlathölter, Eur. Phys. J. D, 2003, 24, 161.
- J. De Vries, R. Hoekstra, R. Morgenstern and T. Schlathölter, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2002, 35, 21.
- T. Schlathölter, R. Hoekstra and R. Morgenstern, Int. J. Mass Spectrom., 2004, 233, 1. otwiera się w nowej karcie
- T. J. Wasowicz, A. Kivimäki, M. Dampc, M. Coreno, M. De Simone and M. Zubek, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2011, 83, 033411. otwiera się w nowej karcie
- P. M. Mayer, M. F. Guest, L. Cooper, L. G. Shpinkova, E. E. Rennie, D. M. P. Holland and D. A. Shaw, J. Phys. Chem. A, 2009, 113, 10923. otwiera się w nowej karcie
- M. Dampc, E. Szymanska, B. Mielewska and M. Zubek, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2011, 44, 055206. otwiera się w nowej karcie
- T. P. T. Do, M. Leung, M. Fuss, G. Garcia, F. Blanco, K. Ratnavelu and M. J. Brunger, J. Chem. Phys., 2011, 134, 1. otwiera się w nowej karcie
- P. Mozejko, E. Ptasińska-Denga, A. Domaracka and C. Szmytkowski, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2006, 74, 12708.
- C. J. Colyer, S. M. Bellm, B. Lohmann, G. F. Hanne, O. Al-Hagan, D. H. Madison and C. G. Ning, J. Chem. Phys., 2010, 133, 124302. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Fuss, R. Colmenares, A. G. Sanz, A. Muñoz, J. C. Oller, F. Blanco, T. P. T. Do, M. J. Brunger, D. Almeida, P. Limão- Vieira and G. García, J. Phys.: Conf. Ser., 2012, 373, 12010. otwiera się w nowej karcie
- D. Almeida, F. Ferreira da Silva, S. Eden, G. Garcia and P. Limão-Vieira, J. Phys. Chem. A, 2014, 118, 690. otwiera się w nowej karcie
- D. Almeida, F. Ferreira da Silva, G. Garcia and P. Limão-Vieira, J. Chem. Phys., 2013, 139, 114304. otwiera się w nowej karcie
- T. J. Wasowicz and B. Pranszke, J. Phys. Chem. A, 2015, 119, 581. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, M. Łabuda, Y. S. Tergiman and J. E. Sienkiewicz, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2005, 72, 052706. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, Eur. Phys. J. D, 2012, 66, 175/7. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, Appl. Radiat. Isot., 2014, 83, 95. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel and Y. S. Tergiman, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2006, 74, 054702/4. otwiera się w nowej karcie
- P. Sulzer, S. Ptasinska, F. Zappa, B. Mielewska, A. R. Milosavljevic, P. Scheier, T. D. Märk, I. Bald, S. Gohlke, M. A. Huels and E. Illenberger, J. Chem. Phys., 2006, 125, 044304. otwiera się w nowej karcie
- S.-H. Lee, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 2655. otwiera się w nowej karcie
- A. Lifshitz, M. Bidani and S. Bidani, J. Phys. Chem., 1986, 90, 3422. otwiera się w nowej karcie
- D. G. Melnik, S. Gopalakrishnan, T. A. Miller and F. C. De Lucia, J. Chem. Phys., 2003, 118, 3589. otwiera się w nowej karcie
- V. M. Rayón and J. A. Sordo, J. Chem. Phys., 2005, 122, 204303. otwiera się w nowej karcie
- A. Giuliani, P. Limão-Vieira, D. Duflot, A. R. Milosavljevic, B. P. Marinkovic, S. V. Hoffmann, N. Mason, J. Delwiche and M. J. Hubin-Franskin, Eur. Phys. J. D, 2009, 51, 97. otwiera się w nowej karcie
- B. Cadioli, E. Gallinella, C. Coulombeau, H. Jobic and G. Berthier, J. Phys. Chem., 1993, 97, 7844. otwiera się w nowej karcie
- P. K. Sahu, A. Chaudhari and S. L. Lee, Chem. Phys. Lett., 2004, 386, 351. otwiera się w nowej karcie
- E. Erdmann and M. Łabuda, J. Phys.: Conf. Ser., 2015, 635, 22097. otwiera się w nowej karcie
- M. A. Hervé du Penhoat, P. López-Tarifa, K. K. Ghose, Y. Jeanvoine, M. P. Gaigeot, R. Vuilleumier, M. F. Politis and M. C. Bacchus-Montabonel, J. Mol. Model., 2014, 20, 2221.
- M. C. Bacchus-Montabonel, J. Phys. Chem. A, 2014, 118, 6326. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, J. Phys. Chem. A, 2013, 117, 14169. otwiera się w nowej karcie
- M. Łabuda, Y. S. Tergiman, M. C. Bacchus-Montabonel and J. E. Sienkiewicz, Chem. Phys. Lett., 2004, 394, 446. otwiera się w nowej karcie
- M. Łabuda, Y. S. Tergiman, M. C. Bacchus-Montabonel and J. E. Sienkiewicz, Int. J. Mol. Sci., 2004, 5, 265. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 1999, 59, 3569. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, M. Łabuda, Y. S. Tergiman and J. E. Sienkiewicz, Progress in Theoretical Chemistry and Physcis, Springer, College. Park. Md., 2007, vol. 16, p. 203. otwiera się w nowej karcie
- E. Bene, P. Martínez, G. J. Halász, Á. Vibók and M. C. Bacchus-Montabonel, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2009, 80, 012711. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel and Y. S. Tergiman, Chem. Phys. Lett., 2011, 503, 45. otwiera się w nowej karcie
- N. Vaeck, M. Desouter-Lecomte and J. Liévin, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 1999, 32, 409. otwiera się w nowej karcie
- N. Vaeck, M. C. Bacchus-Montabonel, E. Baloïtcha and M. Desouter-Lecomte, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2001, 63, 427041. otwiera się w nowej karcie
- E. Baloïtcha, M. Desouter-Lecomte, M. C. Bacchus-Montabonel and N. Vaeck, J. Chem. Phys., 2001, 114, 8741.
- M. Łabuda, J. González-Vázquez and L. González, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 5439. otwiera się w nowej karcie
- M. Łabuda, J. González-Vázquez, F. Martín and L. González, Chem. Phys., 2012, 400, 165. otwiera się w nowej karcie
- A. Chenel, E. Mangaud, Y. Justum, D. Talbi, M. C. Bacchus- Montabonel and M. Desouter-Lecomte, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 2010, 43, 245701. otwiera się w nowej karcie
- R. J. Allan, C. Courbin, P. Salas and P. Wahnon, J. Phys. B: At., Mol. Opt. Phys., 1990, 23, L461. otwiera się w nowej karcie
- H.-J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby and M. Schütz, Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci., 2012, 2, 242. otwiera się w nowej karcie
- H.-J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby, M. Schütz, P. Celani, W. Györffy, D. Kats, T. Korona, R. Lindh, A. Mitrushenkov, G. Rauhut, K. R. Shamasundar, T. B. Adler, R. D. Amos, A. Bernhardsson, A. Berning, D. L. Cooper, M. J. O. Deegan, A. J. Dobbyn, F. Eckert, E. Goll, C. Hampel, A. Hesselmann, G. Hetzer, T. Hrenar, G. Jansen, C. Köppl, Y. Liu, A. W. Lloyd, R. A. Mata, A. J. May, S. J. McNicholas, W. Meyer, M. E. Mura, A. Nicklass, D. P. O'Neill, P. Palmieri, D. Peng, K. Pflüger, R. Pitzer, M. Reiher, T. Shiozaki, H. Stoll, A. J. Stone, R. Tarroni, T. Thorsteinsson and M. Wang, MOLPRO ver.2015.1, 2015. otwiera się w nowej karcie
- A. D. Becke, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 1988, 38, 3098. otwiera się w nowej karcie
- A. D. Becke, J. Chem. Phys., 1993, 98, 5648. otwiera się w nowej karcie
- C. Lee, W. Yang and R. G. Parr, Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys., 1988, 37, 785. otwiera się w nowej karcie
- J. F. Stanton and R. J. Bartlett, J. Chem. Phys., 1993, 98, 7029. otwiera się w nowej karcie
- B. O. Roos, Ab initio methods in Quantum Chemistry II, Wiley-VCH, Chichester, 1987, pp. 399-445.
- T. Schlathölter, F. Alvarado, S. Bari and R. Hoekstra, Phys. Scr., 2006, 73, C113. otwiera się w nowej karcie
- F. Alvarado, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, J. Chem. Phys., 2007, 127, 034301. otwiera się w nowej karcie
- S. Maclot, M. Capron, R. Maisonny, A. Lawicki, A. Mery, J. Rangama, J.-Y. Chesnel, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, ChemPhysChem, 2011, 12, 930. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, Eur. Phys. J. D, 2015, 69, 107. otwiera się w nowej karcie
- A. N. Agnihotri, S. Kasthurirangan, S. Nandi, A. Kumar, M. E. Galassi, R. D. Rivarola, O. Fojon, C. Champion, J. Hanssen, H. Lekadir, P. F. Weck and L. C. Tribedi, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2012, 85, 1. otwiera się w nowej karcie
- C. Illescas, L. F. Errea and L. Méndez, Phys. Scr., 2013, T156, 14033. otwiera się w nowej karcie
- M. C. Bacchus-Montabonel, Y. S. Tergiman and D. Talbi, Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys., 2009, 79, 012710. otwiera się w nowej karcie
- F. Alvarado, S. Bari, R. Hoekstra and T. Schlathölter, Phys. Chem. Chem. Phys., 2006, 8, 1922. otwiera się w nowej karcie
- Z. Deng, I. Bald, E. Illenberger and M. A. Huels, Phys. Rev. Lett., 2005, 95, 153201. otwiera się w nowej karcie
- T. J. Wasowicz and B. Pranszke, Eur. Phys. J. D, 2016, 70, 175. otwiera się w nowej karcie
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 126 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
The Role of Electron Transfer in the Fragmentation of Phenyl and Cyclohexyl Boronic Acids
- A. Lozano,
- B. Pamplona,
- T. Kilich
- + 7 autorów
A non-adiabatic wavepacket dynamical study of the low energy chargetransfer process in the S3+ + H collision
- M. Łabuda,
- J. GONZáLEZ-VáZQUEZ,
- F. MARTíN
- + 1 autorów