Quality Control of Bacterial Extracellular Vesicles with Total Protein Content Assay, Nanoparticles Tracking Analysis, and Capillary Electrophoresis
Abstrakt
Extracellular vesicles (EVs) were isolated from Pectobacterium zantedeschiae culturing media using direct ultracentrifugation (UC), iodixanol cushion ultracentrifugation (ICUC), and iodixanol density gradient ultracentrifugation (IDGUC) techniques. The isolates were characterized with total protein content assay (bicinchoninic acid assay, BCA), nanoparticles tracking analysis (NTA), and capillary electrophoresis (CE). A satisfactory correlation (R2 > 0.94) between quantitative results obtained with BCA, NTA and CE was achieved only for isolates obtained with the IDGUC. The correlation between protein content and CE was proved to be related to the isolates’ purity. The NTA was found unable to provide reliable information on EVs quantity in samples isolated with UC and ICUC, due to the co-isolated particulate impurities. Moreover, the work reports polysaccharides, used as culturing media components, as a potential source of bias of quantitation with total protein content assay and NTA. The study demonstrates the advantageous selectivity of CE in quality control of EVs and its ability to differentiate subpopulations of EVs of Pectobacterium.
Cytowania
-
1 4
CrossRef
-
0
Web of Science
-
1 2
Scopus
Autorzy (8)
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.3390/ijms23084347
- Licencja
- otwiera się w nowej karcie
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuły w czasopismach
- Opublikowano w:
-
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
nr 23,
ISSN: 1661-6596 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2022
- Opis bibliograficzny:
- Steć A., Jońca J., Waleron K., Waleron M., Płoska A., Kalinowski L., Wielgomas B., Dziomba S.: Quality Control of Bacterial Extracellular Vesicles with Total Protein Content Assay, Nanoparticles Tracking Analysis, and Capillary Electrophoresis// INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES -Vol. 23,iss. 8 (2022), s.4347-
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.3390/ijms23084347
- Źródła finansowania:
-
- Publikacja bezkosztowa
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 93 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
Isolation of Citrus lemon extracellular vesicles: Development and process control using capillary electrophoresis
- A. Steć,
- M. Chodkowska,
- J. Kasprzyk-Pochopień
- + 7 autorów
Protein overproduction alters exosome secretion in Chinese hamster ovary cells
- A. Steć,
- M. Targońska,
- E. Karkosińska
- + 7 autorów
Keratinocyte-derived small extracellular vesicles supply antigens for CD1a-resticted T cells and promote their type 2 bias in the context of filaggrin insufficiency
- A. Kobiela,
- W. Hewelt-Belka,
- J. Frackowiak
- + 10 autorów