Abstrakt
Metryki filogenetyczne umożliwiają ocenę jakości wyników analizy filogenetycznej oraz wiarygodności algorytmów przeprowadzających taką analizę. Aplikacja TreeCmp oferuje efektywne, wielomianowe implementacje ośmiu takich metryk (dla drzew nieukorzenionych i zawierających korzeń) zdefiniowanych dla dowolnych filogenez (nie koniecznie binarnych). Program ten jako pierwszy umożliwia wyznaczanie nowych metryk, definiowanych w oparciu o najlżejsze skojarzenie w grafie dwudzielnym. Zaprezentowano też przykład zastosowania omawianego oprogramowania do oceny nowego algorytmu rekonstrukcji drzew filogenetycznych.
Cytowania
-
8 9
CrossRef
-
0
Web of Science
-
8 5
Scopus
Autorzy (3)
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.4137/ebo.s9657
- Licencja
- otwiera się w nowej karcie
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Opublikowano w:
-
Evolutionary Bioinformatics
nr 8,
strony 475 - 487,
ISSN: 1176-9343 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2012
- Opis bibliograficzny:
- Bogdanowicz D., Giaro K., Wróbel B.: TreeCmp: Comparison of Trees in Polynomial Time// Evolutionary Bioinformatics. -Vol. 8, (2012), s.475-487
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.4137/ebo.s9657
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 222 razy