Visual TreeCmp : Comprehensive Comparison of Phylogenetic Trees on the Web - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Visual TreeCmp : Comprehensive Comparison of Phylogenetic Trees on the Web

Abstrakt

1. We present Visual TreeCmp—a package of applications for comparing phylogenetic tree sets. 2. Visual TreeCmp includes a graphical web interface allowing the visualization of compared trees and command line application extended by comparison methods recently proposed in the literature. 3. The phylogenetic tree similarity analysis in Visual TreeCmp can be performed using eighteen metrics, of which 11 are dedicated to rooted trees and seven to the un-rooted ones. Additionally, in the case of different sets of labels, the compared trees can be pruned so that the sets are identical. 4. The Visual TreeCmp is dedicated to people who need a universal and easy-to-use tool designed to compare arbitrary (not necessary binary) phylogenetic trees. An example of its use in a supertree accuracy analysis is described in section 3. 5. The Visual TreeCmp package Web application is available at: (https://eti.pg.edu.pl/TreeCmp), and its source codes available under the GNU license can be reached through several repositories located at: (https://github.com/TreeCmp)

Cytowania

  • 7

    CrossRef

  • 4

    Web of Science

  • 3

    Scopus

Cytuj jako

Pełna treść

pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuły w czasopismach
Opublikowano w:
Methods in Ecology and Evolution nr 11, strony 494 - 499,
ISSN: 2041-210X
Język:
angielski
Rok wydania:
2020
Opis bibliograficzny:
Goluch T., Bogdanowicz D., Giaro K.: Visual TreeCmp : Comprehensive Comparison of Phylogenetic Trees on the Web// Methods in Ecology and Evolution -Vol. 11,iss. 4 (2020), s.494-499
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1111/2041-210x.13358
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 105 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi