Wyniki wyszukiwania dla: TECHNIKA IMPLICIT SOLVENT

• Minimal parameter implicit solvent model for ab initioelectronic-structure calculations

  Publikacja

  • J. Dziedzic
  • H. Helal
  • C. Skylaris
  • A. Mostofi
  • M. Payne

  - EPL-EUROPHYS LETT - Rok 2011

  Abstract - We present an implicit solvent model for ab initio electronic-structure calculations which is fully self-consistent and is based on direct solution of the nonhomogeneous Poisson equation. The solute cavity is naturally defined in terms of an isosurface of the electronic density according to the formula of Fattebert and Gygi (J. Comput. Chem., 23 (2002) 662). While this model depends on only two parameters, we demonstrate...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Large-scale DFT calculations in implicit solvent-A case study on the T4 lysozyme L99A/M102Q protein

  Publikacja

  • J. Dziedzic
  • S. Fox
  • T. Fox
  • C. Tautermann
  • C. Skylaris

  - INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY - Rok 2013

  W ostatnich latach zaproponowano szereg modeli typu implicit solvent, ktore bazują na bezpośrednim rozwiązaniu niejednorodnego równania Poissona w przestrzeni rzeczywistej. Modele te charakteryzują się elegancją, ponieważ wnęka, w której umieszczona jest molekuła substancji rozpuszczanej zdefiniowana jest bezpośrednio w funkcji gęstości elektronowej, a rozkład ładunku jest w sposób samouzgodniony polaryzowany dzięki reakcji dielektryka,...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• SAFE - technika izolacji związków zapachowych z próbek żywności

  Publikacja

  • T. Chmiel
  • T. Dymerski
  • P. Biernacka
  • W. Wardencki

  - Analityka: Nauka i Praktyka - Rok 2010

  Oznaczanie składników odpowiedzialnych za zapach produktów żywnościowych dokonywane za pomocą technik chromatograficznych obejmuje dwa zasadnicze etapy: przygotowanie próbki i identyfikację (rozdzielenie połączone z odpowiednią metodą detekcji). Ze względu na skomplikowaną matrycę, specyfikę związków zapachowych - samoistne ich uwalnianie z matrycy, jak i możliwość zachodzenia przemian, kluczowym elementem analizy żywności jest...

• Electronically Excited States in Solution via a Smooth Dielectric Model Combined with Equation-of-Motion Coupled Cluster Theory

  Publikacja

  • J. Howard
  • J. Womack
  • J. Dziedzic
  • C. Skylaris
  • B. Pritchard
  • T. Crawford

  - Journal of Chemical Theory and Computation - Rok 2017

  We present a method for computing excitation energies for molecules in solvent, based on the combination of a minimal parameter implicit solvent model and the equation-of-motion coupled-cluster singles and doubles method (EOM-CCSD). In this method, the solvent medium is represented by a smoothly varying dielectric function, constructed directly from the quantum mechanical electronic density using only two tunable parameters. The...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Density functional theory calculations on entire proteins for free energies of binding: Application to a model polar binding site

  Publikacja

  • S. Fox
  • J. Dziedzic
  • T. Fox
  • C. Tautermann
  • C. Skylaris

  - PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS - Rok 2014

  In drug optimization calculations, the molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) method can be used to compute free energies of binding of ligands to proteins. The method involves the evaluation of the energy of configurations in an implicit solvent model. One source of errors is the force field used, which can potentially lead to large errors due to the restrictions in accuracy imposed by its empirical nature....

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Technika Transportu Szynowego

  Czasopisma

  ISSN: 1232-3829 , eISSN: 2543-5728

• Technika Chłodnicza i Klimatyzacyjna

  Czasopisma

  ISSN: 1231-188X

• Autobusy. Technika, Eksploatacja, Systemy Transportowe

  Czasopisma

  ISSN: 1509-5878 , eISSN: 2450-7725

• Gaz, Woda i Technika Sanitarna

  Czasopisma

  ISSN: 0016-5352 , eISSN: 2449-9404

• CHEMIK nauka-technika-rynek

  Czasopisma

  ISSN: 0009-2886