Wyniki wyszukiwania dla: dna

Radiosensitization of DNA in presence of Pt(II)-based compounds

Publikacja

M. Śmiałek-Telega
S. Ptasińska
J. Gow
C. Da Pieve
N. J. Mason

- EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL D - Rok 2014

X-ray irradiation of plasmid DNA in presence of platinum (II)-based compounds was carried out in order to assess the radiosensitization capabilities of these drugs. In present investigations pBR322 plasmid DNA was used to monitor the effectiveness of chosen compounds in inducing strand breaks. Samples were incubated in the presence of potential radiosensitisers: platinum (II) bromide and cis-diamminedibromoplatinum (II). The results...

Pełny tekst do pobrania w portalu

NMR-Based Structural Insight into DNA G-Quadruplex

Publikacja

J. Pakuła

- Rok 2024

Emerging as a promising area in anticancer research, noncanonical DNA structures such as G-quadruplexes are studied using NMR spectroscopy. NOESY spectra reveals crucial interactions between ligands and G-quadruplexes, helping to understand non-covalent binding mechanisms. This knowledge is essential for rational drug design targeting these structures.

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań

Publikacja

Ł. Wrona
K. Woźniak

- Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Rok 2006

Biologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

The Neural Knowledge DNA Based Smart Internet of Things

Publikacja

H. Zhang
F. Li
J. Wang
Z. Wang
L. Shi
C. Sanin
E. Szczerbicki

- CYBERNETICS AND SYSTEMS - Rok 2020

ABSTRACT The Internet of Things (IoT) has gained significant attention from industry as well as academia during the past decade. Smartness, however, remains a substantial challenge for IoT applications. Recent advances in networked sensor technologies, computing, and machine learning have made it possible for building new smart IoT applications. In this paper, we propose a novel approach: the Neural Knowledge DNA based Smart Internet...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Smart Embedded Systems with Decisional DNA Knowledge Representation

Publikacja

Z. Haoxi
F. Li
C. Sanin
E. Szczerbicki

- Rok 2020

Embedded systems have been in use since the 1970s. For most of their history embedded systems were seen simply as small computers designed to accomplish one or a few dedicated functions; and they were usually working under limited resources i.e. limited computing power, limited memories, and limited energy sources. As such, embedded systems have not drawn much attention from researchers, especially from those in the artificial...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

An introduction to DNA chips: principles, technology, applications and analysis.

Publikacja

M. Gabig
G. Wegrzyn

- Acta Biochimica Polonica - Rok 2001

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

DNA base modifications in chromatin of human cancerous tissues

Publikacja

R. Olinski
T. Zastawny
J. Budzbon
J. Skokowski
W. Zegarski
M. Dizdaroglu

- FEBS LETTERS - Rok 1992

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Common variants of DNA repair genes and malignant melanoma

Publikacja

T. Dębniak
R. Scott
B. Górski
C. Cybulski
T. van
P. Serrano-Fernandez
T. Huzarski
T. Byrski
L. Nagay
B. Dębniak... i 7 innych

- EUROPEAN JOURNAL OF CANCER - Rok 2008

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Global DNA methylation level in females with idiopathic scoliosis

Publikacja

P. Janusz
M. Chmielewska
M. Andrusiewicz
T. Kotwicki
M. Kotwicka
M. Andrusiewicz

- Rok 2021

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

B35 The Significance The Level Of Mitochondrial Dna In Huntington's Disease

Publikacja

P. J drak
S. Bara ska
M. Krygier
A. Stanis awska-Sachadyn
W. So tan
E. Sitek
J. S awek
J. Limon
G. W grzyn

- JOURNAL OF NEUROLOGY NEUROSURGERY AND PSYCHIATRY - Rok 2014

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Oxidative stress in humans: validation of biomarkers of DNA damage

Publikacja

C. Gedik

- Carcinogenesis - Rok 2002

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Zastosowanie Grafiki 3D do wizualizacji dna morskiego

Publikacja

- Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Rok 2006

Technologie do wytwarzanie grafiki 3D to dynamicznie rozwijająca się gałąź przemysłu informatycznego. Znajdują one zastosowanie nie tylko przy tworzeniu gier komputerowych, ale coraz częściej są wykorzystywane w systemach trjwymiarowej wizualizacji danych pomiarowych.

Decisional DNA Based Conceptual Framework for Smart Manufacturing

Publikacja

S. I. Shafiq
C. Sanin
E. Szczerbicki
C. Toro

- Advances in Intelligent Systems and Computing - Rok 2016

This paper presents the conceptual framework for systematic knowledge representation, storage and reuse of manufacturing information in a production scenario. This knowledge structure is designed for three levels in a manufacturing set up viz. first at the engineering objects level, second at process and finally at factory level. Virtual engineering object (VEO) deals with knowledge at the individual object/component/machine level...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

5-Bromo-2′-deoxycytidine—a potential DNA photosensitizer

Publikacja

M. Zdrowowicz
P. Wityk
B. Michalska
J. Rak

- ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY - Rok 2016

A double-stranded oligonucleotide, 80 base pairs in length, was multiply labeled with 5-bromo-2′-deoxycytidine (BrdC) using polymerase chain reaction (PCR). The modified oligonucleotide was irradiated with 300 nm photons and its damage was assayed by employing DHPLC, LC-MS and denaturing polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). Two types of damage were demonstrated, namely, single strand breaks (SSBs) and intrastrand cross-links...

Pełny tekst do pobrania w portalu

An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations

Publikacja

T. Saha
S. Sappati
S. Das

- INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES - Rok 2023

An important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...

Pełny tekst do pobrania w portalu

A vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins for novel biomaterials, biomedical and industrial applications

Publikacja

P. Skowron
N. Krawczun
J. Żebrowska
D. Krefft
O. Żołnierkiewicz
M. Bielawa
J. Jeżewska-Frąckowiak
Ł. Janus
M. Witkowska
M. Palczewska... i 10 innych

- Materials Science & Engineering C-Materials for Biological Applications - Rok 2020

A DNA fragment amplification/expression technology for the production of new generation biomaterials for scientific, industrial and biomedical applications is described. The technology enables the formation of artificial Open Reading Frames (ORFs) encoding concatemeric RNAs and proteins. It recruits the Type IIS SapI restriction endonuclease (REase) for an assembling of DNA fragments in an ordered head-to-tail-orientation. The...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Replicating DNA by cell factories: roles of central carbon metabolism and transcription in the control of DNA replication in microbes, and implications for understanding this process in human cells

Publikacja

S. Barańska
M. Glinkowska
A. Herman-Antosiewicz
M. Maciąg-Dorszyńska
D. Nowicki
A. Szalewska-Pałasz
A. Węgrzyn
G. Węgrzyn

- Microbial Cell Factories - Rok 2013

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Viral infection-oxidative stress/DNA damage-aberrant DNA methylation: separate or interrelated events responsible for genetic instability and childhood ALL development?

Publikacja

R. Olinski
J. Styczynski
E. Olinska
D. Gackowski

- BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-REVIEWS ON CANCER - Rok 2014

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Measuring the density of DNA films using ultraviolet-visible interferometry

Publikacja

M. Śmiałek-Telega
N. C. Jones
S. Vronning Hoffmann
N. J. Mason

- PHYSICAL REVIEW E - Rok 2013

In order to determine a proper value for the density of dry DNA films we have used a method based upon the measurement of interference effects in transmission spectra of thin DNA layers. Our results show that the methodology is effective and the density of DNA in this state, 1.407 g/cm3, is much lower than the commonly used 1.7 g/cm3. Obtaining accurate values for the DNA film density will allow the optical constants for DNA to...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Interstrand crosslinking of DNA by C-1311 (Symadex) and other imidazoacridinones

Publikacja

- CANCER RESEARCH - Rok 2005

Imidazoakrydony, w tym pochodna C-1311 (Symadex) znajdująca się w pierwszej fazie badań klinicznych prowadzonych w USA, należą do grupy bardzo aktywnych związków przeciwnowotworowych zsyntetyzowanych w Katedrze Technologii Leków i Biochemii PG. Za pomocą zmodyfikowanej metody Parsons'a wykazaliśmy, że C-1311 indukuje, w sposób zależny od stężenia, międzyłańcuchowe wiązania sieciujące w komórkach różnych nowotworów ludzkiego pochodzenia...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Binding free energy of selected anticancer compounds to DNA - theoreticalcalculations

Publikacja

M. Bagiński
P. Polucci
I. Antonini
S. Martelli

- JOURNAL OF MOLECULAR MODELING - Rok 2002

Praca dotyczy swobodnej energii wiązania z DNA trzech związków o działaniu przeciwnowotworowym (mitoksantronu i dwóch pochodnych pirymidoakrydyny). Obliczenia wykorzystywały metody Poissona-Boltzmanna (udział elektrostatyczny) i metody SASA (udział nieelektrostatyczny). W wyniku badań zaproponowano struktury kompleksów jakie tworzą badane ligandy z DNA.

Evaluating experimental molecular physics studies of radiation damage in DNA*

Publikacja

M. Śmiałek-Telega

- EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL D - Rok 2016

The field of Atomic and Molecular Physics (AMP) is a mature field exploring the spectroscopy, excitation, ionisation of atoms and molecules in all three phases. Understanding of the spectroscopy and collisional dynamics of AMP has been fundamental to the development and application of quantum mechanics and is applied across a broad range of disparate disciplines including atmospheric sciences, astrochemistry, combustion and environmental...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Intercalation of imidazoacridinones to DNA and its relevance to cytotoxicand antitumor activity

Publikacja

J. Dzięgielewski
B. Ślusarski
A. Konitz
A. Składanowski
J. Konopa

- BIOCHEMICAL PHARMACOLOGY - Rok 2002

.

Metylacja DNA w rozwoju, diagnostyce i terapii nowotworów

Publikacja

J. Lewandowska
A. Bartoszek-Pączkowska

- Rok 2008

Dotychczas kowalencyjna modyfikacja DNA, jaką jest zarówno naturalna metylacja DNA, jak i addukty DNA egzogennych niskocząsteczkowych związków chemicznych, były ropatrywane z punktu widzenia genomu. W świetle obecnej wiedzy dotyczącej epigenomu można sądzić, że stosunkowo niewielkie modyfikacje czy to w postaci metylacji cytozyny, czy adduktu DNA mogą mieć znaczący wpływ na działanie komórki, a co za tym idzie także jej transformację...

Raman spectroscopic study of Ni2+-DNA interactions in aqueous systems

Publikacja

J. Stangret
R. Savoie

- PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS - Rok 2002

Metodą ramanowskich widm różnicowych określono sposób oddziaływania jonu Ni2+ z DNA(CT) w układach wodnych. Kation Ni(II) koordynuje w pozycjach N7 guaniny (G) i adeniny (A) w powtarzających się sekwencjach GG, AA i GA cząsteczki DNA. Jednocześnie Ni2+ oddziałuje zewnątrz sferowo poprzez cząsteczki wody z grupami fosforanowymi DNA.

Set of Experience and Decisional DNA: Experience-Based Knowledge Structures

Publikacja

C. Sanin
E. Szczerbicki

- Rok 2020

This chapter presents a description of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA), argumentation for a knowledge representation, composition, configuration and metrics. SOEKS is a combination of filtered and amalgamated information obtained from formal decision events. It facilitates effective explicit representation of decisional experience taken from different technologies. SOEKS comprises variables,...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Decisional DNA, reflexive ontologies, and security: developing decisional trust

Publikacja

E. Szczerbicki
C. Sanin

- Rok 2010

Omowiono model osiagania zaufania decyzjnego opartego na decyzyjnym DNA, refleksyjnych ontologiach oraz na bezpieczenstwie technologicznym.

Obrazy akustyczne dna morskiego w wybranych akwenach Bałtyku

Publikacja

- Rok 2017

Metody akustyczne obserwacji obszarów podwodnych mórz i oceanów stosowane są od początku XX wieku. Początkowo były to echosondy nawigacyjne najczęściej składające się z pojedynczych przetworników. Następnie zaczęto stosować sonary do wykrywania obiektów stanowiących przeszkody nawigacyjne pod woda, które miały głównie zastosowanie w marynarce wojennej. W drugiej połowie XX wieku rozpoczęto konstruowanie urządzeń akustycznych, których...

Radio- and photosensitization of DNA with compounds containing platinum and bromine atoms

Publikacja

M. Śmiałek-Telega
S. Ptasińska
J. Gow
S. Hoffmann
N. J. Mason

- EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL D - Rok 2015

. Irradiations of plasmid DNA by both X-rays and UV light in the presence and absence of compounds containing platinum and bromine atoms were performed in order to asses the sensitization potential of these compounds. Plasmid DNA pBR322 was incubated with platinum (II) bromide, hydrogen hexabromoplatinate (IV), hydrogen hexahydroxyplatinate (IV) and sodium hexahydroxyplatinate (IV). Incubation was followed by X-ray or UV irradiations....

Pełny tekst do pobrania w portalu

Smart innovation process enhancement using SOEKS and decisional DNA

Publikacja

M. Waris
C. Sanin
E. Szczerbicki

- Journal of Information and Telecommunication - Rok 2017

Product innovation always requires a foundation based on both knowledge and experience. The production and innovation process of products is very similar to the evolution process of humans. The genetic information of humans is stored in genes, chromosomes and DNA. Similarly, the information about the products can be stored in a system having virtual genes, chromosomes and decisional DNA (DDNA). The present paper proposes...

Pełny tekst do pobrania w portalu

The interaction of antitumor 1-nitroacridines with DNA in cell-free systems

Publikacja

J. Lewandowska
A. Prędkiewicz
J. Konopa
M. Demeunynck
J. Constant
A. Bartoszek-Pączkowska

- Rok 2005

Uzyskano nowe pochodne 1-nitro i 3-nitroakrydyny wykazujące zdolność do specyficznego cięcia DNA w miejscach bezzasadowych. Z użyciem oligonukleotydu z indukowanym miejscem bezzasadowym potwierdzono taką aktywność u obu otrzymanych pochodnych.

Teloxantron inhibits the processivity of telomerase with preferential DNA damage on telomeres

Publikacja

N. Maciejewska
M. Olszewski
J. Jurasz
M. Bagiński
S. Maryna
Z. Viktor
M. Folini
N. Zaffaroni

- Cell Death and Disease - Rok 2022

Telomerase reactivation is one of the hallmarks of cancer, which plays an important role in cellular immortalization and the development and progression of the tumor. Chemical telomerase inhibitors have been shown to trigger replicative senescence and apoptotic cell death both in vitro and in vivo. Due to its upregulation in various cancers, telomerase is considered a potential target in cancer therapy. In this study, we identified...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Introducing the concept of Decisional DNA-Based web content mining

Publikacja

P. Wang
C. Sanin
E. Szczerbicki

- CYBERNETICS AND SYSTEMS - Rok 2012

Przedstawiono koncepcje zastosowania struktury reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA w procesie wyszukiwania informacji w internecie. Dokonano analizy eksperymentow tak wspomaganego wyszukiwania oraz sformulowano wnioski na temat przyszlych badan prowadzacych do dalszej integracji procesu wyszukiwania z doswiadczeniami zdobytymi w trakcie tego wyszukiwania.

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Decisional DNA based framework for representing Virtual Engineering Objects

Publikacja

S. I. Shafig
E. Szczerbicki
C. Sanin
C. Toro

- Rok 2014

In this paper, we propose a frame-work to represent the Virtual Engineering Objects (VEO) utilizing Set of Knowledge Experience Structure (SOEKS) and Decisional DNA. A VEO will enable the discovery of new knowledge in a manufacturing unit and the generation of new rules that drive reasoning. The proposed VEO framework will not only be knowledge based representation but it will also have its associated experience embedded within...

Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu

Publikacja

Ł. Wrona
K. Woźniak

- Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Rok 2006

Moduł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Decisional-DNA Based Smart Production Performance Analysis Model

Publikacja

S. Imran
E. Szczerbicki
C. Sanin

- CYBERNETICS AND SYSTEMS - Rok 2019

n order to allocate resources effectively according to the production plan and to reduce disturbances, a framework for smart production performance analysis is proposed in this article. Decisional DNA based knowledge models of engineering objects, processes and factory are developed within the proposed framework. These models are the virtual representation of manufacturing resources, and with help of Internet of Things, are capable...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Experience-Based Decisional DNA (DDNA) to Support Product Development

Publikacja

E. Szczerbicki
M. Ahmed
C. Sanin

- CYBERNETICS AND SYSTEMS - Rok 2018

Knowledge and experience are important requirements for product development. The aim of this paper is to propose a systematic approach for industrial product development. This approach uses smart knowledge management system comprising of Set of Experience Knowledge Structure and Decisional DNA (DDNA) along with Virtual Engineering Tools (Virtual engineering object, Virtual engineering process, and Virtual engineering factory)....

Pełny tekst do pobrania w portalu

Experience-based Intelligence Augmentation with Decisional DNA: Upcoming direction

Publikacja

E. Szczerbicki
C. Sanin

- Rok 2022

Intelligence amplification systems and technologies have gained significant interest from academia and industry during the past few decades. One of the main reasons behind this trend is the fact that most experts agree that truly intelligent artificial system is yet to be developed. The question increasing often asked is this: Is full replication of human intelligence desirable key aim in intelligence related technology and research?...

Pełny tekst do pobrania w portalu

Experience based decisional DNA to support smart product design

Publikacja

M. Ahmed
C. Sanin
S. I. Shafiq
E. Szczerbicki

- JOURNAL OF INTELLIGENT & FUZZY SYSTEMS - Rok 2019

This paper presents the idea of Smart Virtual Product Development (SVPD) system to support product design. The foundations of the system are based upon smart knowledge management techniques called Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). It enhances the industrial product development process by using the previous experiential knowledge gathered from the formal decisional activities. This experiential...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

Smart Innovation Engineering Using Set of Experience and Decisional DNA

Publikacja

M. Waris
C. Sanin
E. Szczerbicki

- Rok 2020

Knowledge-based Engineering Systems are founded upon integration of knowledge into computer systems and are one of the core requirements for the future Industry 4.0. Since the fourth industrial revolution is passing through the developing phase, implementation of Cyber-Physical Production Systems require more realistic approach. Knowledge Management and Knowledge Engineering plays an important role in manufacturing industries facing...

Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym