Filtry
wszystkich: 25487
wybranych: 20466
-
Katalog
- Publikacje 20466 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 51 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 3 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 5 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 720 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 102 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 286 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 18 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 43 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 8 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 1826 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 601 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 1358 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: rna sequencing
-
Novel staphylococci nucH taxonomical marker used in identification of human-associated Staphylococcus succinus subsp. casei
PublikacjaThe aim of our study was to assess the sequencing of unique nucH gene fragment based on performed bioinformatics analysis as a novel diagnostic method for the identification of difficult to identify staphylococcal human pathogenic strains. Initially, PCR-RFLP-rrn analysis specific to the spacers between 16SrDNA and 23SrDNA followed by HhaI restriction analysis was performed. Further, sequencing of nucH and 16S rDNA genes fragments...
-
Mechanism of reaction of RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2
PublikacjaWe combine molecular dynamics, statistical mechanics, and hybrid quantum mechanics/molecular mechanics simulations to describe mechanistically the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Our study analyzes the binding mode of both natural triphosphate substrates as well as remdesivir triphosphate (the active form of drug), which is bound preferentially over ATP by RdRp while...
-
The hypoxia‐induced changes in miRNA‐mRNA in RNA ‐induced silencing complexes and HIF ‐2 induced miRNAs in human endothelial cells
Publikacja -
NASBA – IZOTERMICZNA AMPLIFIKACJA RNA
PublikacjaNASBA (ang. Nucleic Acid Sequence-Based Amplification) jest skuteczną i czułą techniką izotermicznej amplifikacji opartej na transkrypcji, służąca głównie do detekcji cząsteczek RNA. Znalazła ona zastosowanie do wykrywania RNA wirusowego, bakteryjnego i grzybiczego w próbkach klinicznych oraz żywości.
-
Anticancer Imidazoacridinone C-1311 is Effective in Androgen-Dependent and Androgen-Independent Prostate Cancer Cells
PublikacjaAndrogen receptor (AR) plays a crutial role in prostate cancer (PCa) development and metastasis. Here, we reported potent anti-PCa activity of a small molecule imidazoacridinone C-1311. In AR-positive PCa cells, C-1311 was found to inhibit the transcriptional activity of AR uncovering a novel mechanism that may be relevant for its anticancer effect. Mechanistically, C-1311 decreased AR binding to prostate-specific antigen (PSA)...
-
Data regarding a new, vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for the construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins, as well as biological effects of selected polypeptides obtained using this method
PublikacjaApplications of bioactive peptides and polypeptides are emerging in areas such as drug development and drug delivery systems. These compounds are bioactive, biocompatible and represent a wide range of chemical properties, enabling further adjustments of obtained biomaterials. However, delivering large quantities of peptide derivatives is still challenging. Several methods have been developed for the production of concatemers –...
-
The effects of RNA editing in cancer tissue at different stages in carcinogenesis
Publikacja -
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublikacjaW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
Obliczenia numeryczne konstrukcji dna jachtu podczas wejścia na mieliznę
PublikacjaPozytywne zmiany w dostępie do żeglarstwa, które dokonały się w ostatnim dziesięcioleciu spowodowały wzrost liczby osób uprawiających ten sport. Przepisy, wg których projektowane są jachty nie stawiają żadnych wymagań wytrzymałości konstrukcji na wypadek kolizji jednostki z dnem. Z doświadczenia wiadomo, że wejście jachtu na piaszczystą mieliznę nie musi powodować uszkodzeń, jednak kolizja z podwodną skałą w szkierach szwedzkich...
-
Wpływ dodatku kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych
PublikacjaKwasy nukleinowe cieszą się coraz większym zainteresowaniem pod względem zastosowania ich w przemyśle farmaceutycznym, kosmetycznym oraz żywnościowym. Określono wpływ dodatku długo- i krótkołańcuchowych kwasów nukleinowych na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych. Badania wykazały występowanie specyficznych interakcji pomiędzy żelatyną a kwasami nukleinowymi oraz pozwoliły na ocenę wpływu tych oddziaływań na twardość, kohezyjność,...
-
The structure and role of mammalian sperm RNA: a review
Publikacja -
SERRATE: a key factor in coordinated RNA processing in plants
Publikacja -
Early Stages of RNA-Mediated Conversion of Human Prions
PublikacjaPrion diseases are characterized by the conversion of prion proteins from a PrPC fold into a disease-causing PrPSC form that is self-replicating. A possible agent to trigger this conversion is polyadenosine RNA, but both mechanism and pathways of the conversion are poorly understood. Using coarse-grained molecular dynamic simulations we study the time evolution of PrPC over 600 μs. We find that both the D178N mutation and interacting...
-
Numeryczna analiza wpływu budowy podpory mostu na rzece Wiśle na przepływ i rozmycie dna koryta rzeki
PublikacjaW artykule opisano wyniki hydraulicznej analizy wpływu jednego z filarów mostu w Kwidzynie na zmianę pola prędkości przepływu i warunków transportu rumowiska w rzece Wiśle, powodujących lokalne rozmywanie dna koryta rzeki w rejonie filara zlokalizowanego w nurcie rzeki. Bezpośrednią przyczyną podjęcia badań były zaobserwowane podczas budowy mostu lokalne rozmycia dna w sąsiedztwie podpory nr 24.
-
Novel Nuclear Functions of Arabidopsis ARGONAUTE1: Beyond RNA Interference
Publikacja -
EASY ACCESS TOOL FOR SMALL INTERFERING RNA (siRNA) DATA
PublikacjaFor many decades it was an accepted dogma of molecular genetics that the expression of genes is a “one-way-road” leading only in one direction from DNA to RNA to proteins. Recent discoveries in modern molecular genetics have challenged this dogma showing that specific RNA molecules play a central role in controlling the activity of genes by changing the structure of DNA sequences, targeting other RNAs for degradation or blocking...
-
SiMiSnoRNA: Collection of siRNA, miRNA, and snoRNA database for RNA Interference
PublikacjaObjective:The discovery of sequence specific gene silencing which occurs due to the presence of double-stranded RNAs has considerable impact on biology, revealing an unknown level of regulation of gene expression. This process is known as RNA interference (RNAi) or RNA silencing in which RNA molecules inhibit gene expression, typically by causing the destruction of specific mRNA molecule. Two types of small RNA molecules - small...
-
Klasyfikacja dna morskiego na podstawie kątowej zależności cech echa z sonaru wielowiązkowego
PublikacjaPrzedstawiono metodę rozpoznawania i klasyfikacji rodzaju dna morskiego opartą na przetwarzaniu echa z sonaru wielowiązkowego. Metoda ta polega na obliczaniu zbioru parametrów obwiedni ech dla poszczególnych wiązek, podobnie jak w metodach wykorzystujących echosondy jednowiązkowe. Następnie estymowana jest zależność wartości poszczególnych parametrów od kąta wiązki oraz badane jest powiązanie otrzymanej zależności z rodzajem dna...
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Opinia na temat wpływu budowanego w ciągu drogi S7 mostu przez Wisłę w Kiezmarku na kształtowanie hydrodynamiki przepływu wód i rozmycia dna w warunkach umocnienia dna w rejonie podpór nurtowych
PublikacjaCelem pracy było wykonanie obliczeń hydraulicznych i hydrologicznych sprawdzających wpływ budowy w korycie głównym Wisły podpór nurtowych nr 10 i 11 wraz z wariantowymi umocnieniami dna i filarów mostu drogowego budowanego w Kiezmarku na dynamikę przepływu wody w rzece i erozję dna Wisły w przekroju mostowym.
-
Bayesian multilevel model of micro RNA levels in ovarian-cancer and healthy subjects
Publikacja -
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublikacjaRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...
-
Wpływ osiadania dna o postaci niecki na stan naprężenia w stalowej konstrukcji pionowego zbiornika walcowego
PublikacjaBezpośrednim powodem podjęcia prac naukowo - badawczych był rzeczywisty problem techniczny,który wystąpił w rafinerii w Gdańsku. W pracy zamieszczono obszerny przegląd literatury i norm technicznych dotyczących problemu osiadania zbiorników na paliwa. W ramach badań zaplanowano i zrealizowano pomiary tensometryczne oraz pomiary osiadań rzeczywistego stalowego, dwupłaszczowego zbiornika o pojemności V=20.000m3. Wykonano liczne testy...
-
Termodynamika oddziaływań i przejść strukturalnych DNA w układach wodnych na podstawie symulacji metodą dynamiki molekularnej
PublikacjaKwas deoksyrybonukleinowy jest jednym z najistotniejszych elementów każdej żywej komórki ze względu na rolę głównego nośnika informacji genetycznej. Posiada on instrukcje potrzebne do wzrostu, budowy, funkcjonowania oraz namnażania się wielu żywych organizmów, w tym także wirusów. Okazuje się, że w zależności od warunków środowiskowych, DNA może przyjmować wiele różnych struktur drugorzędowych, z których większość stanowi formy...
-
Effect of unlabeled helper probes on detection of an RNA target by bead-based sandwich hybridization
Publikacja -
A Data Driven Model for Predicting RNA-Protein Interactions based on Gradient Boosting Machine
Publikacja -
A Data Driven Model for Predicting RNA-Protein Interactions based on Gradient Boosting Machine
PublikacjaRNA protein interactions (RPI) play a pivotal role in the regulation of various biological processes. Experimental validation of RPI has been time-consuming, paving the way for computational prediction methods. The major limiting factor of these methods has been the accuracy and confidence of the predictions, and our in-house experiments show that they fail to accurately predict RPI involving short RNA sequences such as TERRA RNA....
-
Posttranscriptional coordination of splicing and miRNA biogenesis in plants
Publikacja -
DNA repair is responsible for the presence of oxidatively damaged DNA lesions in urine
Publikacja -
Investigation of Microbes in the Stratosphere – Stardust Project
PublikacjaThe stratospheric microbiota has been investigated many times using the methods of classical microbiology. In this research a few modern methods, including NGS sequencing and multiple displacement amplification of DNA, were in use. The analysis of metagenome helped to determine the content of various species of bacteria in the sample collected in the stratosphere by a hydrogen-filled balloon holding...
-
DNA and its Metaphors
Publikacja -
Una egemonia instabile
Publikacjail ruolo degli Stati Uniti nell'economia globale e la sfida giapponese e cinese
-
Una crisi diversa?
PublikacjaIl capitolo tratta della recente crisi finanziaria, analizzandone cause e conseguenze per il sistema bancario e finanziario mondiale
-
Trichrome Mallory's stain may indicate differential rates of RNA synthesis in eutopic and ectopic endometrium.
Publikacja -
The Escherichia coli RNA polymerase alpha subunit and transcriptional activation by bacteriophage lambda CII protein.
Publikacja -
Defects in RNA polyadenylation impair both lysogenization by and lytic development of Shiga toxin-converting bacteriophages
Publikacja -
Hyponastic Leaves 1 Interacts with RNA Pol II to Ensure Proper Transcription of MicroRNA Genes
Publikacja -
imPlatelet classifier: image‐converted RNA biomarker profiles enable blood‐based cancer diagnostics
PublikacjaLiquid biopsies offer a minimally invasive sample collection, outperforming traditional biopsies employed for cancer evaluation. The widely used material is blood, which is the source of tumor-educated platelets. Here, we developed the imPlatelet classifier, which converts RNA-sequenced platelet data into images in which each pixel corresponds to the expression level of a certain gene. Biological knowledge from the Kyoto Encyclopedia...
-
Total DNA Methylation Changes Reflect Random Oxidative DNA Damage in Gliomas
Publikacja -
Total DNA methylation as a biomarker of DNA damage and tumor malignancy in intracranial meningiomas
Publikacja -
Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity
PublikacjaWe demonstrate here a new class of DNA‐based nanoswitches that, upon enzymatic repair, could undergo a conformational change mechanism leading to a change in fluorescent signal. Such folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are synthetic DNA sequences containing O6‐methyl‐guanine (O6‐MeG) nucleobases and labelled with a fluorophore/quencher optical pair. The nanoswitches are rationally designed so that only upon enzymatic demethylation...
-
Indukcja procesu pseudostarzenia komórkowego przez inhibitory DNA topoizomerazy II i jego rola w oporności na leki przeciwnowotworowe
Publikacja -
Differences in sequences between HBV-relaxed circular DNA and covalently closed circular DNA
Publikacja -
Interactions of antitumor triazoloacridinones with DNA
PublikacjaW niniejszej pracy zbadano oddziaływanie sześciu wybranych pochodnych triazoloakrydonu z DNA. Analiza wiskozymetryczna pokazała, że związki te interkalują do DNA. Jednocześnie dalsze badania wykazały, że proces interkalacji nie jest istotny aktywności cytotoksycznej tej grupy związków. Badania z wykorzystaniem fibroblastów dowiodły, że jedna z pochodnych triazoloakrydonu, związek C-1305, po uprzedniej metabolicznej aktywacji indukuje...
-
Abstract DNA-type systems
PublikacjaAbstrakcyjny system typu DNA jest definiowany przez zestaw nieliniowych kinetycznych równań z wielomianowymi nieliniowościami, które przyjmują rozwiązania solitonowe związane z geometrią helis. Zestaw równań pozwala na dwie różne reprezentacje Laxa: forma von Neumanna i Darboux-kowariantna para Laxa. Wyjaśniamy dlaczego nie-Kolmogorowskie modele prawdopodobieństwa pojawiające się w kinetyce solitonowej są naturalnie związane z...
-
Viability of decisional DNA in robotics
PublikacjaThe Decisional DNA is an artificial intelligence system that uses prior experiences to shape future decisions. Decisional DNA is written in the Set Of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and is capable of capturing and reusing a broad range of data. Decisional DNA has been implemented in several fields including Alzheimer’s diagnosis, geothermal energy and smart TV. Decisional DNA is well suited to use in robotics due to the...
-
Decisional DNA and Optimization Problem
PublikacjaMany researchers have proved that Decisional DNA (DDNA) and Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS or SOE) is a technology capable of gathering information and converting it into knowledge to help decision-makers to make precise decisions in many ways. These techniques have a feature to combine with different tools, such as data mining techniques and web crawlers, helping organization collect information from different sources...
-
Towards neural knowledge DNA
PublikacjaIn this paper, we propose the Neural Knowledge DNA, a framework that tailors the ideas underlying the success of neural networks to the scope of knowledge representation. Knowledge representation is a fundamental field that dedicates to representing information about the world in a form that computer systems can utilize to solve complex tasks. The proposed Neural Knowledge DNA is designed to support discovering, storing, reusing,...
-
Improving platelet‐RNA‐based diagnostics: a comparative analysis of machine learning models for cancer detection and multiclass classification
PublikacjaLiquid biopsy demonstrates excellent potential in patient management by providing a minimally invasive and cost-effective approach to detecting and monitoring cancer, even at its early stages. Due to the complexity of liquid biopsy data, machine-learning techniques are increasingly gaining attention in sample analysis, especially for multidimensional data such as RNA expression profiles. Yet, there is no agreement in the community...
-
Taq DNA polymerase fused with DNA binding protein with increased resistance to inhibitors from clinical samples
PublikacjaNowadays PCR method is commonly used in molecular diagnostic. However, in many cases PCR is limited, by the presence of inhibitory substances in biological, soil or food samples Efficiency and fidelity of amplification is strongly connected with DNA polymerase and reaction conditions. To meet the requirements of modern diagnostic methods it is essential to seeking for new DNA polymerases with better properties useful in these field....