Filtry
wszystkich: 4388
-
Katalog
- Publikacje 3775 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 39 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 10 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 63 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 3 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 2 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 43 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 5 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 447 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: protein folding
-
Limit Analysis of a Strip Footing on Stochastic Subsoil.
PublikacjaW pracy analizowana jest ława fundamentowa posadowiona na losowym podłożu.Poszukiwane są oszacowania nośności podłoża na podstawie twierdzeń o dolnej i górnej ocenie obciążenia granicznego. Dla różnych statycznie dopuszczalnych pól naprężenia i kinematycznie dopuszczalnych pól prędkości, wyznaczono wartości oczekiwane i wariancje obciążenia granicznego. Pozwoliło to na określenie odpowiednich dystrybuant, rozumianych...
-
Sierpinski Monopole Antenna - Uniplanar Feeding Technique.
PublikacjaPrzedstawiono różne techniki zasilania monopolowych anten fraktalnych typu Sierpinskiego. Zaproponowano nowe sposoby zasilania: poprzez linię współosiową ze zmodyfikowaną rozszerzoną płaszczyzną masy oraz poprzez linię współosiową i falowód koplanarny. W obu przypadkach możliwa była znaczna miniaturyzacja struktury. Wykonane i przebadane prototypy anten potwierdziły przydatność przedstawionych rozwiązań.
-
Molecular basis of TRF proteins and their interactions with peptides
Publikacja -
1.21 Computation of Structure, Dynamics, and Thermodynamics of Proteins
Publikacja -
Coarse-Grained Models of Proteins: Theory and Applications
Publikacja -
Computational techniques for efficient conformational sampling of proteins
Publikacja -
The measurement of conformational stability of proteins adsorbed on siloxanes
Publikacja -
Non-coding RNA
Czasopisma -
Novel approaches to wideband speech coding
PublikacjaDwie metoda kodowania szerokopasmowego mowy zostały zaprezentowane. W pierwszej metodzie wykorzystano algorytm kompresji i ekspansji czasowej sygnału mowy, pozwalający na kodowanie szerokopasmowe sygnału mowy z wykorzystaniem ustandaryzowanych kodeków. Metoda ta jest przewidziana do zastosowania w adaptacyjnych algorytmach kodowania mowy. Drugie z proponowanych rozwiazan dotyczy nowej metody estymacji obwiedni widma sygnalu mowy...
-
Transient detection for speech coding applications
PublikacjaSignal quality in speech codecs may be improved by selecting transients from speech signal and encoding them using a suitable method. This paper presents an algorithm for transient detection in speech signal. This algorithm operates in several frequency bands. Transient detection functions are calculated from energy measured in short frames of the signal. The final selection of transient frames is based on results of detection...
-
Integration of speech enhancement and coding techniques
Publikacja -
Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9, Angiopoietin-Like Protein 8, Sortilin, and Cholesteryl Ester Transfer Protein—Friends of Foes for Psoriatic Patients at the Risk of Developing Cardiometabolic Syndrome?
Publikacja -
Patterned protein microarrays for bacterial detection. Langmuir**2003 vol.19 s. 436-439, 5 rys. bibliogr. 25 poz. Specyficzne mikroukłady protein do wykrywania bakterii.
PublikacjaSkonstruowano i przetestowano specyficzne mikroukłady przeciwciał selektyw-nie wiążących bakterie. Otrzymane układy umożliwiają wykrywanie bakterii E.coli0157:H7 oraz Renibacterium salmoninarum (RS). Matryce wytworzono techni-ką nadruku mikrokontaktów (ćCP). Charakterystykę układów uzyskano stosującmikroskopię skaningową (SPM). Ustalono, że selektywność otrzymanych układówobniża się podczas ekspozycji na bakterie niespecyficzne.
-
Hot spot identification by ligand-protein surface interactions mapping – in silico study
Publikacja -
Prediction of Protein Structure by Template-Based Modeling Combined with the UNRES Force Field
Publikacja -
Performance of protein-structure predictions with the physics-based UNRES force field in CASP11
Publikacja -
Recent improvements in prediction of protein structure by global optimization of a potential energy function
Publikacja -
A comparative study of water distribution and dehydrin protein localization in maturing pea seeds
Publikacja -
Mapping Mechanostable Pulling Geometries of a Therapeutic Anticalin/CTLA-4 Protein Complex
Publikacja -
Molecular dynamics insights into protein‐glycosaminoglycan systems from microsecond‐scale simulations
Publikacja -
Local and long range potentials for heparin‐protein systems for coarse‐grained simulations
Publikacja -
Chromatin-associated microprocessor assembly is regulated by the U1 snRNP auxiliary protein PRP40
Publikacja -
Depression as is Seen by Molecular Spectroscopy. Phospholipid- Protein Balance in Affective Disorders and Dementia
Publikacja -
MUTL PROTEIN AS A COMMON CONSTITUENT OF VSP, BER, NER AND MMR REPAIR SYSTEMS
PublikacjaMutS and MutL proteins are renowned mostly for their functions in well-characterized, post-DNA replication mismatch repair system (MMR). However, there is growing evidence that MMR system is not the only field of action of these proteins. Moreover, involvement in MMR does not even have to be their primary function. There are some reports indicating involvement of MutL in BER, NER and VSP (very short patch repair). MutL protein...
-
How water mediates the long-range interactions between remote protein molecules
PublikacjaThe high crowding of macromolecules in the cytoplasm affects the processes that occur inside a living cell. It can, for example, promote the forming of various loosely connected structures of proteins. It also means that bulk water is, essentially, not present there. The relatively thin layer of solvent that separates macromolecules may be able to participate in the long-range interactions between them and make them respond to...
-
Chitosan-protein scaffolds loaded with lysostaphin as potential antistaphylococcal wound dressing materials.
PublikacjaAIMS: The development of technology for preparing chitosan-protein scaffolds loaded with lysostaphin, which potentially could be used as dressing for wound treatment and soft tissue infections caused by Staphylococcus aureus. METHODS AND RESULTS: The unique technology of chitosan solubilization using gaseous CO(2) instead of organic or inorganic acids was used for the incorporation of lysostaphin, the enzyme that exhibits bactericidal...
-
Unusual structural properties of water within the hydration shell of hyperactive antifreeze protein
PublikacjaMany hypotheses can be encountered explaining the mechanism of action of antifreeze proteins. One widespread theory postulates that the similarity of structural properties of solvation water of antifreeze proteins to ice is crucial to the antifreeze activity of these agents. In order to investigate this problem, the structural properties of solvation water of the hyperactive antifreeze protein from Choristoneura fumiferana were...
-
Assembly of Lipopolysaccharide in Escherichia coli Requires the Essential LapB Heat Shock Protein
PublikacjaHere, we describe two new heat shock proteins involved in the assembly of LPS in Escherichia coli, LapA and LapB (lipopolysaccharide assembly protein A and B). lapB mutants were identified based on an increased envelope stress response. Envelope stress responsive pathways control key steps in LPS biogenesis and respond to defects in the LPS assembly. Accordingly, the LPS content in ΔlapB or Δ(lapA lapB) mutants was elevated, with...
-
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublikacjaInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
A Colorimetric Microplate Assay for DNA-Binding Activity of His-Tagged MutS Protein
PublikacjaA simple microplate method was designed for rapid testing DNA-binding activity of proteins. The principle of the assay involves binding of tested DNA by his-tagged protein immobilized on a nickel-coated ELISA plate, following colorimetric detection of biotinylated DNA with avidin conjugated to horseradish peroxidase. The method was used to compare DNA mismatch binding activities of MutS proteins from three bacterial species. The...
-
General Mechanism of Osmolytes’ Influence on Protein Stability Irrespective of the Type of Osmolyte Cosolvent
PublikacjaThe stability of proteins in an aqueous solution can be modified by the presence of osmolytes. The hydration sphere of stabilizing osmolytes is strikingly similar to the enhanced hydration sphere of a protein. This similarity leads to an increase in the protein stability. Moreover, the hydration sphere of destabilizing osmolytes is significantly different. These solutes generate in their surroundings so-called “structurally different...
-
Modeling protein structures with the coarse-grained UNRES force field in the CASP14 experiment
PublikacjaThe UNited RESidue (UNRES) force field was tested in the 14th Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP14), in which larger oligomeric and multimeric targets were present compared to previous editions. Three prediction modes were tested (i) ab initio (the UNRES group), (ii) contact-assisted (the UNRES- contact group), and (iii) template-assisted (the UNRES-template...
-
Justification of quasi-stationary approximation in models of gene expression of a self-regulating protein
PublikacjaWe analyse a model of Hes1 gene transcription and protein synthesis with a negative feedback loop. The effect of multiple binding sites in the Hes1 promoter as well as the dimer formation process are taken into account. We consider three, possibly different, time scales connected with: (i) the process of binding to/dissolving from a binding site, (ii) formation and dissociation of dimers, (iii) production and degradation of Hes1...
-
Determination of viscosity changes of protein hydrolyzate solutions depending on shear rate
Dane BadawczeRheological characteristics of connective tissue protein solutions were made on the basis of viscosity measurement using a Brookfield viscometer using LV SC4 - 27 spindles and shear rate of 85 s-1 (Fig. 1). Solutions of protein hydrolysates with a concentration of 2% in 0.5M acetic acid were prepared.
-
Karaś P., Kochanowicz K., Pitek M., Domański P., Obuchowski I., Tomiczek B., Liberek K.: Evolution towards simplicity in bacterial small heat shock protein system// eLife -, (2023), s.1-21
PublikacjaEvolution can tinker with multi-protein machines and replace them with simpler single-protein systems performing equivalent functions in an equally efficient manner. It is unclear how, on a molecular level, such simplification can arise. With ancestral reconstruction and biochemical analysis, we have traced the evolution of bacterial small heat shock proteins (sHsp), which help to refold proteins from aggregates using either...
-
Investigation of Mechanical and Microstructural Properties of Welded Specimens of AA6061-T6 Alloy with Friction Stir Welding and Parallel Friction Stir Welding Methods
PublikacjaThe present study investigates the effect of two parameters of process type and tool offset on tensile, microhardness, and microstructure properties of AA6061-T6 aluminum alloy joints. Three methods of Friction Stir Welding (FSW), Advancing Parallel-Friction Stir Welding (AP-FSW), and Retreating Parallel-Friction Stir Welding (RP-FSW) were used. In addition, four modes of 0.5, 1, 1.5, and 2 mm of tool offset were used in two welding...
-
Finding deformation of the straight rail track by GNSS measurements
PublikacjaW 2009 roku na Politechnice Gdańskiej i Akademii Marynarki Wojennej w Gdyni zostały przeprowadzone, po raz pierwszy, ciągłe pomiary satelitarne toru kolejowego z wykorzystaniem względnej metody fazowej na bazie polskiej Aktywnej Sieci Geodezyjnej ASG-EUPOS i serwisu czasu rzeczywistego RTK (GPRS) - NAVGEO. Przeprowadzona analiza wykazała silny związek między lokalizacją odbiornika GNSS i dokładnością wyznaczania pozycji, wpływ...
-
Probability of flooding a compartment (the pi factor) - a critique and a proposal
PublikacjaArtykuł podaje krytyczny przegląd stanu wiedzy dot. obliczania prawdopodobirństwa zatopienia przedziału (mnożnika pi), ze szczególnym uwzględnieniem projektu badawczego ''Harder'' oraz podaje poprawne rozwiązanie dotyczące tego mnożnika. Kończy się propozycją przepisu do zamieszczenia w konwencji SOLAS.
-
Manufacturing of resistant joints by rolling for light tubular structures
PublikacjaKoncepcja łączenia aluminiowych elementów rurowych z zastosowaniem nagniatania plastycznego jest alternatywą do istniejących metod łączenia przez spawanie i skręcanie. W artykule prezentowane są oryginalne wyniki badań wpływu parametrów nagniatania wewnętrznego i zewnętrznego oraz różnych postaci powierzchni łączonych na wytrzymałość złącza (aluminium-aluminium) pod wpływem rozciągających sił osiowych.Badania przeprowadzono na...
-
Evolutionary approach to solving multi-ship encounter situations
PublikacjaW artykule wprowadzono nowe podejście do rozwiązywania sytuacji spotkań wielu statków poprzez połączenie założeń teorii gier z programowaniem ewolucyjnym. Spotkanie wielu statków jest zamodelowane jako gra rozgrywana przez ''myślących graczy'' - statki o różnych, potencjalnie zmiennych strategiach. Rozwiązanie - zbiór kooperujących (niekolidujących) trajektorii jest znajdowane za pomocą algorytmu ewolucyjnego.
-
Test loading of the longest span arch bridge in Poland
PublikacjaBridge structures undergo thorough examination during test loading before they come into use. The aim of the examination is to check the correctness of the working structure and construction design assumptions. Test loading on the bridge is preceded by examination specification. This paper describes computational model and test loading results carried out during examibation of the bridge over the Vistula within the bypass of Puławy...
-
Effects of workpiece feeding errors on multi-rip saws
PublikacjaW pracy przedstawiono przyczyny i efekty błędów prowadzenia materiału na wielopiłach tarczowych. Ich znajomość umożliwia szybką diagnostykę przyczyn, a także skuteczną minimalizację błędów prowadzenia materiału.
-
Application of Numerical Simulations on 10GN2MFA Steel Multilayer Welding
Publikacja -
Numerical Simulations of X22CrMoV12-1 Steel Multilayer Welding
Publikacja -
Heat Source Models in Numerical Simulations of Laser Welding
Publikacja -
Parallelisation of genetic algorithms for solving university timetabling problems
PublikacjaAlgorytmy genetyczne stanowią ważną metodę rozwiązywania problemów optymalizacyjnych. W artykule skupiono się na projekcie równoległego algorytmu genetycznego pozwalającego uzyskiwać uniwersyteckie rozkłady zajęć, spełniające zarówno twarde jak i miękkie ograniczenia. Czytelnika wprowadzono w niektóre znane sposoby zrównoleglenia, przedstawiono również podejście autorów, ykorzystujące MPI. Przyjęto strukturę zarządzania opartą...
-
Compact Planar Balun for the UWB Dipole Feeding Network
PublikacjaW pracy opisano wyniki z badań numerycznych ultra szerokopasmowego symetryzatora planarnego o zredukowanych wymiarach. Układ został zaprojektowany w oparciu o konfigurację opisaną w literaturze. Względem konfiguracji bazowej, układ przeprojektowano na inne podłoże. W celu weryfikacji przydatności układu, przeprowadzono symulację anteny dipolowej zasilanej opisywanym symetryzatorem. Na podstawie otrzymanych rezultatów przekazano...
-
Modernization of the Trailer for Tyre/Road Rolling Resistance Measurements
PublikacjaIn the article the ways of defining tyre rolling resistance are presented. The advantages of the laboratory tests of tyre/road rolling resistance and the advantages and disadvantages of on the road tyre/road rolling resistance tests are described. The description of the special trailer used for tyre/road rolling resistance measurements designed and constructed in the Faculty of Mechanical Engineering at Gdansk University of Technology,...
-
The Rolling Contact Fatigue of PVD Coated Spur Gears
Publikacja -
A polynomial algorithm for finding T-span of generalized cacti
Publikacja