A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms - Publikacja - MOST Wiedzy

Twoje konto

zaloguj

Wyszukiwarka

A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms

Abstrakt

ABSTRACT Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins present in the most dangerous poisonous mushrooms. Material and Methods. Degenerate primers in the PCR were designed on the basis of amanitins (n=13) and phallotoxins (n=5) genes in 18 species of poisonous mushrooms deposited to Genbank of the National Center for Biotechnology Information. Results. The specificity of the PCR assays was confirmed against 9 species of edible mushrooms, death cap - Amanita phalloides and panther cap - Amanita pantherina. Conclusions. Designed two couples of PCR-primers specific to amanitins and phallotoxins genes can be recommended for detection of Amanita phalloides and other mushroom species producing hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins.

Autorzy (2)

Cytuj jako

Pełna treść

pobierz publikację
pobrano 218 razy
Wersja publikacji
Accepted albo Published Version
Licencja
Creative Commons: CC-BY-NC otwiera się w nowej karcie

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuły w czasopismach recenzowanych i innych wydawnictwach ciągłych
Opublikowano w:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny nr 68, strony 247 - 251,
ISSN: 0035-7715
Język:
angielski
Rok wydania:
2017
Opis bibliograficzny:
Wołoszyn A., Kotłowski R.: A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms// Roczniki Państwowego Zakładu Higieny. -Vol. 68., nr. 3 (2017), s.247-251
Bibliografia: test
  1. Dellaporta S.L., Wood J, Hicks J.B.: A plant DNA minipreparation: Version II. Plant Molecular Biology Reporter 1983;1(4):19-21. otwiera się w nowej karcie
  2. Gausterer C., Penker M., Krisai-Greilhuber I., Stein C., Stimpfl T.: Rapid genetic detection of ingested Amanita phalloides. Forensic Sci Int Genet 2014;9:66-71. otwiera się w nowej karcie
  3. Hallen H.E., Luo H., Scott-Craig J.S., Walton J.D.: Gene family encoding the major toxins of lethal Amanita mushrooms. Proc Natl Acad Sci U S A 2007;104(48):19097-101. otwiera się w nowej karcie
  4. Hammer Ø. Harper D.A.T. Ryan P.D.: PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Paleontologia Electronica 2001;4(1):9. otwiera się w nowej karcie
  5. Maeta K., Ochi T., Tokimoto K., Shimomura N., Maekawa N., Kawaguchi N., Nakaya M., Kitamoto Y., Aimi T.: Rapid species identification of cooked poisonous mushrooms by using real-time PCR. Appl Environ Microbiol 2008 May;74(10):3306-9. otwiera się w nowej karcie
  6. Kapala M., Nowacka A., Kicka M., Rakowski M.: Mushroom (fungi) poisonings investigated at the regional centre of acute poisoning, institute of occupational medicine and environmental health, Sosnowiec, Poland. Problems of Forensic Sciences 2008;LXXV:282-293.
  7. Kotłowski R.: Mashroom toxins. In: Witczak A., Sikorski Z.E. eds. Toxins and other harmful compounds in foods. New York, CRC Press Tylor & Francis Group, 2017.
  8. Kotlowski R., Myjak P., Kur J.: Specific detection of Amanita phalloides mycelium and spores by PCR amplification of the gpd (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) gene fragment. J Food Biochem 2000;24(3):201-212. otwiera się w nowej karcie
  9. Kowalczyk M., Sekuła A., Mleczko P., Olszowy Z., Kujawa A., Zubek S., Kupiec T.: Practical aspects of genetic identification of hallucinogenic and other poisonous mushrooms for clinical and forensic purposes. Croat Med J 2015;56(1):32-40. otwiera się w nowej karcie
  10. Reports on cases of infectious diseases and poisonings in Poland -2000-2015. Available http://wwwold. pzh.gov.pl/oldpage/epimeld/index_p.html (Accesed 27.06.2017). otwiera się w nowej karcie
  11. Tsuruda S., Akaki K., Hiwaki H., Suzuki A., Akiyama H.: Multiplex real-time PCR assay for simultaneous detection of Omphalotus guepiniformis and Lentinula edodes. Biosci Biotechnol Biochem 2012;76(7):1343-9. otwiera się w nowej karcie
  12. Vilgalys R., Gonzalez D.: Organisation of ribosomal DNA in the basidiomycete Thanatephorus praticola. Current Genetics 1990;18:277-80. otwiera się w nowej karcie
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 224 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum

2016

Specific detection of Alternaria alternata by PCR and real-time PCR

2015

PCR and real-time PCR assays to detect fungi of Alternaria alternata species

2015

Detection of sulfonamide resistance genes via in situ PCR-FISH

  • A. Gnida,
  • K. Kunda,
  • A. Ziembińska
  • + 3 autorów
2014
Meta Tagi