Search
Mechanism of substrate recognition and binding by γ-secretase on the example of the amyloid precursor protein
W ramach niniejszego projektu planowane jest wykorzystanie dynamiki molekularnej i metod pochodnych do ustalenia mechanizmu rozpoznania oraz wiązania substratów przez γ-sekretazę na przykładzie białka βCTF, które jest bezpośrednim prekursorem polipeptydów β-amyloidowych. Agregacja tych peptydów w postaci oligomerów prowadzi do dysfunkcji synaps i zaburzeń homeostazy wapnia, zaś w postaci złogów amyloidowych do uszkodzeń struktury neurytów, stanowiąc bezpośrednią przyczynę rozwoju choroby Alzheimera. Planowane symulacje obejmują: i) zbadanie termodynamiki oraz mechanizmu zmian konformacyjnych miejsca wiążącego γ-sekretazy, umożliwiających dostęp substratu do reszt katalitycznych, ii) ustalenie funkcji nikastryny w mechanizmie rozpoznawania substratów przez γ-sekretazę oraz iii) zidentyfikowanie molekularnych sił napędowych wiązania substratów peptydowych przez γ-sekretazę. Zdobyta wiedza pozwoliłaby na scharakteryzowanie molekularnego mechanizmu działania γ-sekretazy, co mogłoby w przyszłości pozwolić na zaprojektowanie związków modulujących jej aktywność. Wyniki uzyskane w ramach tego projektu zostaną zaprezentowane w postaci artykułów naukowych w prestiżowych czasopismach z Listy Filadelfijskiej, jak również w postaci doniesień konferencyjnych na konferencjach o zasięgu międzynarodowym. Mają one również stanowić istotny element rozprawy doktorskiej kierownika projektu.
Details
- Financial Program Name:
- PRELUDIUM
- Organization:
- Narodowe Centrum Nauki (NCN) (National Science Centre)
- Agreement:
- UMO-2016/23/N/ST4/00378 z dnia 2017-08-24
- Realisation period:
- 2017-08-24 - 2021-08-23
- Project manager:
- dr inż. Łukasz Nierzwicki
- Realised in:
- Department of Physical Chemistry
- Project's value:
- 150 000.00 PLN
- Request type:
- National Research Programmes
- Domestic:
- Domestic project
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 170 times