Search
Abstract
Metryki filogenetyczne umożliwiają ocenę jakości wyników analizy filogenetycznej oraz wiarygodności algorytmów przeprowadzających taką analizę. Aplikacja TreeCmp oferuje efektywne, wielomianowe implementacje ośmiu takich metryk (dla drzew nieukorzenionych i zawierających korzeń) zdefiniowanych dla dowolnych filogenez (nie koniecznie binarnych). Program ten jako pierwszy umożliwia wyznaczanie nowych metryk, definiowanych w oparciu o najlżejsze skojarzenie w grafie dwudzielnym. Zaprezentowano też przykład zastosowania omawianego oprogramowania do oceny nowego algorytmu rekonstrukcji drzew filogenetycznych.
Citations
-
8 9
CrossRef
-
0
Web of Science
-
8 5
Scopus
Authors (3)
Cite as
Full text
download paper
downloaded 53 times
- Publication version
- Accepted or Published Version
- DOI:
- Digital Object Identifier (open in new tab) 10.4137/ebo.s9657
- License
-
open in new tab
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Published in:
-
Evolutionary Bioinformatics
no. 8,
pages 475 - 487,
ISSN: 1176-9343 - Language:
- English
- Publication year:
- 2012
- Bibliographic description:
- Bogdanowicz D., Giaro K., Wróbel B.: TreeCmp: Comparison of Trees in Polynomial Time// Evolutionary Bioinformatics. -Vol. 8, (2012), s.475-487
- DOI:
- Digital Object Identifier (open in new tab) 10.4137/ebo.s9657
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 217 times