Filters
total: 142
Best results in : Research Potential Pokaż wszystkie wyniki (109)
Search results for: phylogenetic tree comparison
-
Zespół Algorytmów i Modelowania Systemów
Research PotentialStudiowanie problemów i modeli teoriografowych ma na celu badanie złożoności obliczeniowej uogólnień problemu klasycznego kolorowania wierzchołków i krawędzi grafu znajdujących zastosowania w modelowaniu praktycznych problemów oraz badanie nowych miar oceny skuteczności algorytmów. W zakresie szeregowania zadań badania koncentrują się na konstrukcji harmonogramów optymalnych z punktu widzenia długości harmonogramu i średniego czasu...
-
Zespół Katedry Rachunku Prawdopodobieństwa i Biomatematyki
Research Potential* modele ryzyka i ich zastosowania * probabilistyczne i grafowe metody w biologii * stochastyczne równania różniczkowe * statystyczna analiza danych * teoria grafów * teoria i zastosowania stochastycznych układów dynamicznych w biologii i medycynie
-
KatedrA Chemii Fizycznej
Research Potential1.Termodynamika i struktura roztworów, oddziaływania międzycząsteczkowe w roztworach - badania termodynamiczne, spektroskopowe i teoretyczne. 2. Fizykochemiczne podstawy analizy środowiskowej.
Best results in : Business Offer Pokaż wszystkie wyniki (33)
Search results for: phylogenetic tree comparison
-
Laboratorium Wysokich Napięć
Business OfferBadania układów probierczych i pomiarowych stosowanych w technice wysokiego napięcia
-
Laboratorium Innowacyjnych Zastosowań Informatyki
Business OfferBadania nad użytecznością i jakością oprogramowania w różnych zastosowaniach, w szczególności rozpoznawanie emocji użytkowników komputerów oraz badanie użyteczności oprogramowania i doświadczenia użytkownika aplikacji.
-
Brain and Mind Electrophysiology lab
Business OfferNeurofizjologia pamięci i funkcji poznawczych mózgu
Other results Pokaż wszystkie wyniki (2082)
Search results for: phylogenetic tree comparison
-
Critical Case Stochastic Phylogenetic Tree Model via the Laplace Transform
PublicationBirth–and–death models are now a common mathematical tool to describe branching patterns observed in real–world phylogenetic trees. Liggett and Schinazi (2009) is one such example. The authors propose a simple birth–and–death model that is compatible with phylogenetic trees of both influenza and HIV, depending on the birth rate parameter. An interesting special case of this model is the critical case where the birth rate equals the...
-
Visual TreeCmp : Comprehensive Comparison of Phylogenetic Trees on the Web
Publication1. We present Visual TreeCmp—a package of applications for comparing phylogenetic tree sets. 2. Visual TreeCmp includes a graphical web interface allowing the visualization of compared trees and command line application extended by comparison methods recently proposed in the literature. 3. The phylogenetic tree similarity analysis in Visual TreeCmp can be performed using eighteen metrics, of which 11 are dedicated to rooted trees...
-
Comparing Arbitrary Unrooted Phylogenetic Trees Using Generalized Matching Split Distance
PublicationIn the paper, we describe a method for comparing arbitrary, not necessary fully resolved, unrooted phylogenetic trees. Proposed method is based on finding a minimum weight matching in bipartite graphs and can be regarded as a generalization of well-known Robinson-Foulds distance. We present some properties and advantages of the new distance. We also investigate some properties of presented distance in a common biological problem...
-
Analyzing sets of phylogenetic trees obtained from bayesian MCMC process using topology metrics
PublicationThe reconstruction of evolutionary trees is one of the primary objectives in phylogenetics. Such a tree represents historical evolutionary relationship between different species or organisms. Tree comparisons are used for multiple purposes, from unveiling the history of species to deciphering evolutionary associations amongorganisms and geographical areas.In the paper, we describe a general method for comparing hylogenetic trees....
-
Generalization of Phylogenetic Matching Metrics with Experimental Tests of Practical Advantages
PublicationThe ability to quantify a dissimilarity of different phylogenetic trees is required in various types of phylogenetic studies, for example, such metrics are used to assess the quality of phylogeny construction methods and to define optimization criteria in supertree building algorithms. In this article, starting from the already described concept of matching metrics, we define three new metrics for rooted phylogenetic trees. One...