Publications
Filters
total: 42
Catalog Publications
-
Interactions of amphotericin B derivatives with lipid membranes - a molecular dynamics study
PublicationW pracy analizowano oddziaływanie dwóch nisko-toksycznych pochodnych amfoterycyny B (związki SAmE i PAmE) z modelami błon lipidowych. Badania wykonane zostały za pomocą dynamiki molekularnej. Modele błon oprócz fosfolipidów DMPC zawierały odpowiednio cholesterol (model błony zwierzęcej) lub ertosterol (model błony grzybowej). Analiza wyników wykazała, że obie pochodne amfoterycyny B zachowują się inaczej w błonie cholesterolowej...
-
Molekularne aspekty aktywności biologicznej amfoterycyny B i jej pochodnych o podwyższonej selektywności - badania z zastosowaniem metod chemii obliczeniowej
Publication -
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions.
PublicationIn this paper production of a cold-active esterase EstA from the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A in E. coli expression system was described. The purification and biochemical characteristic of EstA were performed in the presence of urea and then compared with results obtained for the esterase with no addition of urea and isolated from the native source. In both cases the cold-active enzyme displayed similar properties....
-
Influence of a lipid bilayer on the conformational behavior of amphotericin B derivatives - A molecular dynamics study.
PublicationAmphotericin B (AmB) is an effective but very toxic antifungal antibiotic. In our laboratory a series of AmB derivatives of improved selectivity of action was synthesized and tested. To understand molecular basis of this improvement, comparative conformational studies of amphotericin B and its two more selectivederivatives were carried out in an aqueous solution and in a lipid membrane. These molecular simulation studies revealed...
-
Modeling of the alcohol dehydrogenase active site. Two different modes of alcohol binding in crystals of zinc and cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates evidenced by X-ray diffraction and solid state vibrational spectroscopy
PublicationOpisano syntezę, struktury cząsteczkowe oraz widma FT-IR, 1H. 13C, 29Si, 113Cd NMR dziesięciu nowych, mieszanoligandowych kompleksów cynku i kadmu z ligandem tri-tert-butoksysilanotiolanowym i pochodnymi imidazolu. Za pomocą rentgenowskiej analizy strukturalnej i spektroskopii w podczerwieni udokumentowano dwa różne sposoby wiązania etanolu i metanolu w kryształach tych związków. Opisane kompleksy stanowią modele miejsca aktywnego...
-
Amphotericin B and Its New Derivatives - Mode of Action
PublicationAmphotericin B (AmB) is a well known antifungal and antiprotozoal antibiotic used in the clinic for several decades. Clinicalapplications of AmB, however, are limited by its nephrotoxicity and many other acute side effects which are not acceptable by patientswhen their life is not threaten. In order to improve the therapeutic index of this drug, lipid formulations have been introduced and manyefforts have been made to obtain less...
-
Molecular Determinants of Proton Transfer in ATP Synthase FO Complex
Publication -
How do sterols determine the antufungal activitiy of amphotericin B? Free energy of binding between the drug and its membrane targets.
PublicationAmphotericin B (AmB) is a well-known polyene antibiotic used to treat systemic fungal infections. It is commonly accepted that the presence of sterols in the membrane is essential for the AmB biological activity, that is, for the formation of transmembrane ion channels. The selective toxicity of AmB for fungal cells is attributed to the fact that it is more potent against fungal cell membranes containing ergosterol than against...
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Partition coefficients of selected environmentally important volatile organic compounds determined by gas - liquid chromatography with polydimethylsiloxane stationary phase
PublicationPrzedstawiono wartości współczynników podziału (stałych podziału) 14 lotnych związków organicznych istotnych dla stanu środowiska (często oznaczanych w powietrzu w pomieszczeniach zamkniętych) między fazą gazową (N2) a ciekłą (PDMS). Wyznaczano je dwiema technikami (izotermiczną i z liniowo programowanym wzrostem temperatury). Dowiedziono, że istnieje możliwość wyznaczania współczynników podziału techniką LTPRI w oparciu o skalę...
-
Thick film traps with an irregular film. Preparation and evaluation.
PublicationOpisano nową metodę wytwarzania otwartych pułapek kapilarnych do wzbogacania lotnych związków organicznych z próbek gazowych. Badanie właściwości tego typu pułapek wykazało, że spadek ich sprawności chromatograficznej w porównaniu z pułapkami z filmem regularnym, jest rzędu 20-30%. Opracowana technologia jest bardzo prosta i pozwala na szybkie i tanie wytwarzanie dużych ilości pułapek z grubymi filmami również przez niewyspecjalizowane...
-
Molecular aspects of the interaction between amphotericin B and a phospholipid bilayer: molecular dynamics studies.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem z grupy polienów makrolidowych. Stosowany jest on w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Wiadomo że związek ten oddziałuje ze składnikami błon lipidowych i tworzy kanały. W przedstawianej pracy prezentowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną układu składającego się z 200 cząsteczek lipidów DMPC i jednej cząsteczki amfoterycyny ułożonej na powierzchni błony. Z przeprowadzonej...
-
Automated high-capacity sorption probe for extraction of organic compounds in aqueous samples followed by gas chromatographic analysis.
PublicationOpracowano zautomatyzowany zestaw wyposażony w próbnik o dużej pojemności sorpcyjnej do oznaczania związków śladowych z zastosowaniem chromatografii gazowej. Zestaw łączy prostotę SPME z wysoką wydajnością techniki ekstrakcji z zastosowaniem ruchomego elementu sorpcyjnego (SBSE). Procedura pobierania próbek była przeprowadzana z zastosowaniem podajnika automatycznego. Ze względu na pełną automatyzację zestawu, możliwa jest bezobsługowa...
-
Solvation and partial molar volumes of some transition metal cations in N,N-dimethylacetamide, triethylphosphate and acetonitrile.
PublicationW oparciu o precyzyjne pomiary gęstości roztworów nadchloranów metali przejściowych szeregu Mn(II)-Zn(II) w DMA, TEP i AN wyznaczono pozorne molowe oraz graniczne wartości cząstkowych molowych objętości sole w temperaturach 293, 298 i 303,15 K. Wyznaczone wartości rozdzielono na udziały jonowe. Przeanalizowano czynniki decydujące o wielkości cząstkowych molowych objętości solwatowanych kationów.
-
Ultra thick open tubular traps with an increased inner diameter.
PublicationPrzeanalizowano zagadnienia związane z zastosowaniem otwartych pułapek kapilarnych z grubym nieregularnym filmem polidimetylosiloksanu do wzbogacania lotnych związków organicznych. Przeprowadzone rozważania teoretyczne oraz prace eksperymentalne wykazały, że zwiększenie średnicy wewnętrznej pułapek może znacząco polepszyć ich właściwości. Dla danego natężenia przepływu próbki oraz danego stosunku objętości faz w pułapce, liczba...
-
Apparent molar volumes of divalent transition metal perchlorates and chlorides in N,N-dimethylacetamide.
PublicationZmierzono gęstości roztworów nadchloranów i chlorków manganu(II), kobaltu(II), niklu(II), miedzi(II) i cynku(II) w temperaturach 10, 20,25, 30, 40, 50 i 60(o)C. Obliczono pozorne objętości molowe. Wyznaczono graniczne wartości cząstkowych molowych objętości tych soli oraz odpowiednie rozszerzalności. Przeanalizowano i wyjaśniono różnice we właściwościach wolumetrycznych roztworów nadchloranów i chlorków.
-
Ionic hydration in LiPF6, NaPF6, and KPF6 aqueous solutions derived from infrared HDO spectra.
PublicationZbadano hydratację LiPF6, NaPF6 oraz KPF6 przy pomocy metody FTIR, z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego HDO w H2O. Dane widmowe poddano analizie metodą ważonych widm różnicowych. Główne wnioski pracy stanowią uzupełnienie i rozszerzenie pasmowego modelu hydratacji kationów, wcześniej postulowanego na podstawie widm w podczerwieni HDO wodnych roztworów różnych elektrolitów.
-
Thermodynamic properties of inorganic salts in nonaqueous solvents. I. Apparent molar volumes and compressibilities of divalent transition-metal perchlorates in N,N-dimethylformamide.
PublicationZmierzono gęstości i szybkość dźwięku dla roztworów nadchloranów dwuwartościowych metali przejściowych w N,N-dimetyloformamidzie. W oparciu o uzyskane wyniki wyznaczono pozorne objętości molowe, cząstkowe objętości molowe, rozszerzalności izobaryczne oraz ściśliwości adiabatyczne. Dokonano analizy oraz zbadano wpływ rodzaju kationu metalu.
-
Wykorzystanie zjawiska sorpcji w opracowaniu nowych technik izolacji analitów organicznych z mediów gazowych oraz ciekłych z zastosowaniem polidimetylosiloksanu.
Publication.
-
Nowoczesne techniki przygotowania próbki do oznaczania analitów organicznych z zastosowaniem chromatografii gazowej. Część II. Aparatura. Modern techniques of preparation of samples for determining organic analytes by gas chromatography. Part II. Instrumentation.
PublicationW pracy dokonano przeglądu szerokiego spektrum technik przygotowania próbki ze szczególnym uwzględnieniem technik o charakterze prośrodowiskowym. Opisu technik dokonano pod kątem wykorzystywanych mechanizmów izolacji analitów oraz stosowanych rozwiązań aparaturowych.