Tytułowy związek składa się z kompleksowego kationu, w którym do żelaza(II) oktaedrycznie koordynują trzy bidentne ligandy fenantrolinowe oraz dwóch jednoujemnych agregatów: [Cl(MeOH)2](-) i [Cl(MeOH)4](-), gdzie jony chlorkowe i cząsteczki metanolu są powiązane wiązaniami wodorowymi.

Tytułowy związek, [Fe(C4H6N2)6]Cl2.2H2O jest izostrukturalny z odpowiednimi związkami Co, Ni i Ru. W kompleksowym kationie żelazo(II) jest koordynowane oktaedrycznie przez sześć ligandów 1-metyloimidazolowych. Jon ujemny jest agregatem dwóch jonów chlorkowych i dwóch cząsteczek wody połączonych wiązaniami wodorowymi.