Molekularny mechanizm wpływu stresu oksydacyjnego na stabilność strukturalną i dynamikę kompleksów telomerowego DNA z białkami - Project - MOST Wiedzy

Search

Molekularny mechanizm wpływu stresu oksydacyjnego na stabilność strukturalną i dynamikę kompleksów telomerowego DNA z białkami

W ramach projektu badaniu poddany zostanie wpływ 8-okso-7,8-dihydroguaniny (8-oxoG) - pochodnej guaniny powstającej w DNA na skutek działania czynników utleniających - na molekularny mechanizm rozpoznania sekwencji telomerowej przez domeny wiążące DNA należące do czterech białek telomerowych: TRF1, TRF2, HOT1 i POT1. Dodatkowo przedmiotem analizy będzie dynamika zmian konformacyjnych indukowanych przez modyfikację kowalencyjną białka TRF1 (fosforylację pT371), związaną z sygnalizacją uszkodzeń DNA. Do przeprowadzenia badań wykorzystane zostaną metody molekularnej biofizyki obliczeniowej oparte na symulacjach dynamiki molekularnej (MD). Głównym celem projektu jest wyjaśnienie molekularnych podstaw jednego z dwóch potencjalnych mechanizmów wiążących ekspozycję na warunki stresu oksydacyjnego z indukcją stanu senescencji (starości) komórkowej lub apoptozy. Ponadto prowadzone badania mogą przyczynić się do ugruntowania i rozszerzenia stosowalności metod symulacyjnych opartych na koncepcji profilu energii swobodnej do analizowania oddziaływań między biomolekułami. Jako że wyniki badań opublikowane zostaną w postaci publikacji w prestiżowych czasopismach tzw. Listy Filadelfijskiej, a także prezentowane będą na międzynarodowych konferencjach, realizacja projektu może zwiększyć rozpoznawalność Politechniki jako ośrodka naukowego związanego z zagadnieniami obliczeniowej biofizyki molekularnej.

Details

Project's funding:
DIAMENTOWY GRANT
Agreement:
0059/DIA/2014/43 0059/DIA/2014/43 z dnia 2014-09-18
Realisation period:
2014-09-18 - 2018-09-17
Project manager:
dr hab. inż. Jacek Czub
Realised in:
Department of Physical Chemistry
Project's value:
169 400.00 PLN
Request type:
Krajowy Program Badawczy
Domestic:
Domestic project
Verification:
Gdańsk University of Technology

seen 21 times