Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu - Publication - Bridge of Knowledge

Search

Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu

Abstract

Podstawowymi modelami historii ewolucji organizmów są drzewa i sieci filogenetyczne. Ponieważ algorytmy konstrukcji filogenów zwracają różne wyniki dla tych samych danych wejściowych, powstaje problem oceny, który filogen najlepiej reprezentuje historię ewolucji dla zadanego zbioru gatunków. W pracy podano definicję metryki dla przestrzeni drzew o n liściach, zwanej metryką błędu. Dokonano przeglądu miar odległości na przestrzeni sieci filogenetycznych, bazujących na metryce wprowadzonej dla drzew, wraz z analizą modelu, dla którego miary te spełniają nierówność trójkąta. Z wykorzystaniem programu phylonet przeprowadzono porównanie przykładowych topologii zarówno drzew, jak i sieci, oraz dokonano oceny, na ile wprowadzone miary odzwierciedlają rzeczywistość

Cite as

Full text

full text is not available in portal

Keywords

Details

Category:
Articles
Type:
artykuły w czasopismach recenzowanych i innych wydawnictwach ciągłych
Published in:
Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne no. T. 12, pages 117 - 124,
ISSN: 1732-1166
Language:
Polish
Publication year:
2007
Bibliographic description:
Bogdanowicz D., Małafiejska A.: Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu// Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne. -Vol. T. 12., (2007), s.117-124
Verified by:
Gdańsk University of Technology

seen 145 times

Recommended for you

Meta Tags