Search results for: GROMOS

• Molecular modelling of membrane sterols with the use of the GROMOS 96 forcefield

  Publication

  • M. Baran
  • J. Mazerski

  - CHEMISTRY AND PHYSICS OF LIPIDS - Year 2002

  Podstawowym zadaniem tego projektu było udowodnienie zasadności stosowania pola siłowego GROMOS 96 do symulacji steroli błonowych metodą dynamiki molekularnej. Uzyskane wyniki jasno wskazują, że to pole siłowe bardzo dobrze nadaje się do symulacji silnie lipofilowych układów.

• Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water

  Publication

  • M. Baran
  • J. Mazerski

  - BIOPHYSICAL CHEMISTRY - Year 2002

  Badano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.