Search results for: drzewo filogenetyczne

• Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences

  Publication

  • B. Krawczyk
  • K. Lewandowski
  • J. Kur

  - MOLECULAR AND CELLULAR PROBES - Year 2002

  Zaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...

• Matching Split Distance for Unrooted Binary Phylogenetic Trees

  Publication

  • D. Bogdanowicz
  • K. Giaro

  - IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics - Year 2011

  Rekonstrukcja drzew ewolucji jest jednym z głównych celów w bioinformatyce. Drzewa filogenetyczne reprezentuje historię ewolucji i związki pokrewieństwa między różnymi gatunkami. W pracy proponujemy nową ogólną metodę określania odległości między nieukorzenionymi drzewami filogenetycznymi, szczególnie użyteczną dla dużych zbiorów gatunków. Następnie podajemy szczegółowe własności jednej metryki określonej przy użyciu tej metody...

  Full text to download in external service

• Construction of phylogenetic trees with topological constraints

  Publication

  • T. Tretkowski

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2011

  This paper proposes a method of reconstruction of phylogenetic trees based on heuristic search with topological constraints. Using topological constraints it is possible to reduce the set of solutions as well as to enforce that the result is consistent with a given hypothesis about the evolution process within some group of species. Along with this work a number of algorithms used for phylogenetic analysis were implemented. Those...