Search
Filters
total: 117
Best results in : Research Potential Pokaż wszystkie wyniki (96)
Search results for: COMPARISON OF PHYLOGENETIC TREES, MATCHING METRICS, PHYLOGENETIC TREE DISTANCE
-
Zespół Algorytmów i Modelowania Systemów
Research PotentialStudiowanie problemów i modeli teoriografowych ma na celu badanie złożoności obliczeniowej uogólnień problemu klasycznego kolorowania wierzchołków i krawędzi grafu znajdujących zastosowania w modelowaniu praktycznych problemów oraz badanie nowych miar oceny skuteczności algorytmów. W zakresie szeregowania zadań badania koncentrują się na konstrukcji harmonogramów optymalnych z punktu widzenia długości harmonogramu i średniego czasu...
-
Zespół Katedry Rachunku Prawdopodobieństwa i Biomatematyki
Research Potential* modele ryzyka i ich zastosowania * probabilistyczne i grafowe metody w biologii * stochastyczne równania różniczkowe * statystyczna analiza danych * teoria grafów * teoria i zastosowania stochastycznych układów dynamicznych w biologii i medycynie
-
Inteligentne Systemy Interaktywne
Research PotentialNaturalne interfejsy, umożliwiające inteligentną interakcję człowiek-maszyna z możliwością oddziaływania na możliwie wszystkie zmysły człowieka równocześnie i bez potrzeby jego wcześniejszego szkolenia w zakresie używania typowych urządzeń zewnętrznych komputera, w tym z wykorzystaniem metod automatycznego rozpoznawania i syntezy mowy, biometrii, proaktywnych (samo-wykonywalnych) dokumentów elektronicznych, rozpoznawania emocji...
Best results in : Business Offer Pokaż wszystkie wyniki (21)
Search results for: COMPARISON OF PHYLOGENETIC TREES, MATCHING METRICS, PHYLOGENETIC TREE DISTANCE
-
Superkomputer Tryton
Business OfferObliczenia dużej skali, Wirtualna infrastruktura w chmurze (IaaS), Analiza danych (big data)
-
Laboratorium Wysokich Napięć
Business OfferBadania układów probierczych i pomiarowych stosowanych w technice wysokiego napięcia
-
Laboratorium Innowacyjnych Zastosowań Informatyki
Business OfferBadania nad użytecznością i jakością oprogramowania w różnych zastosowaniach, w szczególności rozpoznawanie emocji użytkowników komputerów oraz badanie użyteczności oprogramowania i doświadczenia użytkownika aplikacji.
Other results Pokaż wszystkie wyniki (196)
Search results for: COMPARISON OF PHYLOGENETIC TREES, MATCHING METRICS, PHYLOGENETIC TREE DISTANCE
-
On a matching distance between rooted phylogenetic trees
PublicationThe Robinson–Foulds (RF) distance is the most popular method of evaluating the dissimilarity between phylogenetic trees. In this paper, we define and explore in detail properties of the Matching Cluster (MC) distance, which can be regarded as a refinement of the RF metric for rooted trees. Similarly to RF, MC operates on clusters of compared trees, but the distance evaluation is more complex. Using the graph theoretic approach...
-
Generalization of Phylogenetic Matching Metrics with Experimental Tests of Practical Advantages
PublicationThe ability to quantify a dissimilarity of different phylogenetic trees is required in various types of phylogenetic studies, for example, such metrics are used to assess the quality of phylogeny construction methods and to define optimization criteria in supertree building algorithms. In this article, starting from the already described concept of matching metrics, we define three new metrics for rooted phylogenetic trees. One...
-
Comparing Arbitrary Unrooted Phylogenetic Trees Using Generalized Matching Split Distance
PublicationIn the paper, we describe a method for comparing arbitrary, not necessary fully resolved, unrooted phylogenetic trees. Proposed method is based on finding a minimum weight matching in bipartite graphs and can be regarded as a generalization of well-known Robinson-Foulds distance. We present some properties and advantages of the new distance. We also investigate some properties of presented distance in a common biological problem...
-
Comparing Phylogenetic Trees by Matching Nodes Using the Transfer Distance Between Partitions
PublicationAbility to quantify dissimilarity of different phylogenetic trees describing the relationship between the same group of taxa is required in various types of phylogenetic studies. For example, such metrics are used to assess the quality of phylogeny construction methods, to define optimization criteria in supertree building algorithms, or to find horizontal gene transfer (HGT) events. Among the set of metrics described so far in...
-
Matching Split Distance for Unrooted Binary Phylogenetic Trees
PublicationRekonstrukcja drzew ewolucji jest jednym z głównych celów w bioinformatyce. Drzewa filogenetyczne reprezentuje historię ewolucji i związki pokrewieństwa między różnymi gatunkami. W pracy proponujemy nową ogólną metodę określania odległości między nieukorzenionymi drzewami filogenetycznymi, szczególnie użyteczną dla dużych zbiorów gatunków. Następnie podajemy szczegółowe własności jednej metryki określonej przy użyciu tej metody...