Search
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
Abstract
W celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja aminokwasowa DgrSSB wykazuje odpowiednio 45%, 44% i 82% identyczności a DprSSB - 43%, 43%i 69% identyczności z białkami SSB pochodzącymi z Thermus aquaticus (TaqSSB), Thermus thermophilus (TthSSB) and Deinococcus radiodurans. Wykazano, że DgrSSB i DprSSB są podobne do białek SSB z Thermus/Deinococcus w ich właściwościach biochemicznych. Funkcjonują jako homodimery z monomerem charakteryzującym się dwiema domenami OB wiążącymi jednoniciowe DNA. W eksperymencie wygaszania naturalnej fluorescencji tryptofanów z poly(dT), oba białka wiążą ssDNA o długości ok. 33 nt na homodimer. DgrSSB i DprSSB wykazują zdolność komplemetacji funkcji EcoSSB w warunkach in vivo. Termostabilność z okresem półtrwania wynoszącym 1 min w 65-67,5°C czyni DgrSSB i DprSSB podobnymi do znanego białka SSB pochodzącego z Deinococcus radiodurans (DraSSB).
Cite as
Full text
- Publication version
- Accepted or Published Version
- License
-
open in new tab
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuł w czasopiśmie z listy filadelfijskiej
- Published in:
-
Acta Biochimica Polonica
no. 54,
pages 79 - 87,
ISSN: 0001-527X - Language:
- English
- Publication year:
- 2007
- Bibliographic description:
- Filipkowski P., Kur J.: Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)// Acta Biochimica Polonica. -Vol. 54., iss. 1 (2007), s.79-87
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 83 times