Search
Search results for: CPG
-
Comparative Analysis of CpG Sites and Islands Distributed in Mitochondrial DNA of Model Organisms
Publication -
DNA methylation pattern is altered in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia patients as compared with normal thymic subsets: insights into CpG island methylator phenotype in T-ALL
Publication -
Epigenetic Basis of Regeneration: Analysis of Genomic DNA Methylation Profiles in the MRL/MpJ Mouse
PublicationEpigenetic regulation plays essential role in cell differentiation and dedifferentiation, which are the intrinsic processes involved in regeneration. To investigate the epigenetic basis of regeneration capacity, we choose DNA methylation as one of the most important epigenetic mechanisms and the MRL/MpJ mouse as a model of mammalian regeneration known to exhibit enhanced regeneration response in different organs. We report the...
-
A simple modification to improve the accuracy of methylation-sensitive restriction enzyme quantitative polymerase chain reaction
PublicationDNA digestion with endonucleases sensitive to CpG methylation such as HpaII followed by polymerase chain reaction (PCR) quantitation is commonly used in molecular studies as a simple and inexpensive solution for assessment of region-specific DNA methylation. We observed that the results of such analyses were highly overestimated if mock-digested samples were applied as the reference.We determined DNA methylation levels in several...
-
Metylotransferazy ssaków – inhibitory i aktywatory
PublicationWśród metylotransferaz ssaków możemy wyróżnić metylotransferazy histonowe oraz metylotransferazy DNA. Metylacja DNA w obrębie wysp CpG oraz metylacja histonów wpływają na poziom ekspresji genów w komórkach ssaczych. Dodatkowo dzięki metylacji zapewniana jest stabilność i integralność genomu ludzkiego. Metylotransferazy DNA, będące głównym tematem tego artykułu, są często przedmiotem badań, gdyż nieprawidłowa metylacja DNA jest...
-
Roman Kotlowski dr hab. inż.
People -
Molecular differences in mitochondrial DNA (mtDNA) genomes of dogs with malignant mammary tumours
Open Research DataThe aim of this study was to determine molecular defects in mitochondrial DNA with the use of large-scale genome analysis in malignant canine mammary gland tumours and indicate whether these changes were linked with the carcinogenesis process. With the use of the NGS technology, we sequenced 27 samples of mtDNA isolated from blood and tumours obtained...
-
Immunological response of sheep to injections of plasmids encoding Toxoplasma gondii SAG1 and ROP1 genes
PublicationInfection with the intracellular protozoan parasite Toxo¬plasma gondii (T. gondii) causes health problems to both humans and livestock and has a large economic impact worldwide. The immune response in sheep following infection with T. gondii was evaluated using six different combinations of plasmid DNA, recombinant antigen and adjuvant. Sheep were generally vaccinated twice by intramuscular injection with plasmid DNA containing...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublicationMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
Genome-Wide DNA Methylation and Gene Expression in Patients with Indolent Systemic Mastocytosis
PublicationMastocytosis is a clinically heterogenous, usually acquired disease of the mast cells with a survival time that depends on the time of onset. It ranges from skin-limited to systemic disease, including indolent and more aggressive variants. The presence of the oncogenic KIT p. D816V gene somatic mutation is a crucial element in the pathogenesis. However, further epigenetic regulation may also affect the expression of genes that...
-
Dendritic cells as regulators of immune response and their application in therapy
PublicationW publikacji opisano rolę komórek dendrytycznych (DC) w regulowaniu układu immunologicznego. W ostatnich latach nastąpił przełom w postrzeganiu komórek dendrytycznych, które są jedną z kluczowych populacji komórek odpornościowych, nie tylko jako komórek prezentujących antygeny i indukujących układ odpornościowy, lecz także posiadających zdolność do wyciszania jego aktywności czy do aktywnego zabijania komórek nowotworowych.