Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
Abstrakt
Zakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E. coli pobranych z materiału klinicznego pacjentów Akademii Medycznej w Gdańsku w latach 2006-2009. W przeprowadzonych badaniach wykrywano obecność siedmiu czynników wirulencji charakterystycznych dla uropatogennych szczepów E. coli ,takich jak adhezyny czy cytotoksyny z wykorzystaniem klasycznej techniki PCR oraz techniki złożonego PCR (tzw. multipleks PCR).W multipleksowej reakcji PCR wykrywano obecność: fimbrii typu P, fimbrii typu S, cytotoksycznego czynnika nekrotyzującego CNF1, bakteriocyny Usp charakterystycznej tylko dla szczepów uropatogennych, fimbrii typu I oraz alfa hemolizyny. W oddzielnej reakcji PCR wykrywano obecność adhezyn z rodziny Dr. Celem badań było badanie transmisji uropatogennych szczepów E. coli z układu moczowego do układu krwionośnego. Do badania pokrewieństwa genetycznego wykorzystano referencyjną technikę REA-PFGE (ang. Restriction Enzyme Analysis - Pulsed Field Gel Electrophoresis) uznawaną za "złoty standard" w genotypowaniu oraz alternatywną technikę PCR MP (ang. Melting Profiles). Technika REA-PFGE jest analizą restrykcyjną połączoną z elektroforezą pulsacyjną, natomiast technika PCR MP oparta jest na amplifikacji PCR poprzedzonej ligacją adaptorów oligonukleotydowych do fragmentów restrykcyjnych genomowego DNA. Na podstawie uzyskanych wyników stwierdzono, że w większości przypadków izolaty pochodzące z krwi i z moczu były identyczne pod względem genetycznym.Uzyskane wyniki były porównywane z użyciem techniki REA-PFGE. Przedstawiona analiza sugeruje, że prawdopodobną przyczyną wystąpienia urosepsy w badanych przypadkach może być zakażenie układu moczowego.
Autorzy (5)
Cytuj jako
Pełna treść
pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Aktywność konferencyjna
- Typ:
- publikacja w wydawnictwie zbiorowym recenzowanym (także w materiałach konferencyjnych)
- Tytuł wydania:
- III Ogólnopolska Konferencja : Biotechnologia Molekularna: ''Biotechnologia- od badań podstawowych do wdrożeń'': BioMillenium 2009: materiały konferencyjne, Gdańsk, 22-24 października 2009
- Język:
- polski
- Rok wydania:
- 2009
- Opis bibliograficzny:
- Mielech A., Krawczyk B., Śledzińska A., Samet A., Kur J.: Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital// III Ogólnopolska Konferencja : Biotechnologia Molekularna: ''Biotechnologia- od badań podstawowych do wdrożeń'': BioMillenium 2009: materiały konferencyjne, Gdańsk, 22-24 października 2009/ ed. J. Kur. - Politechnika Gdańska Wydział Chemiczny Katedra Mikrobiologii. [Gdańsk: B.w.], 2009,
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 193 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
- B. Krawczyk,
- A. Samet,
- J. Leibner
- + 1 autorów
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
- B. Krawczyk,
- A. Śledzińska,
- A. Samet
- + 4 autorów
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
- B. Krawczyk,
- A. Śledzińska,
- A. Samet
- + 4 autorów