Gromologist: A GROMACS-oriented utility library for structure and topology manipulation - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Gromologist: A GROMACS-oriented utility library for structure and topology manipulation

Abstrakt

Despite the increasing automation of workflows for the preparation of systems for molecular dynamics simulations, the custom editing of molecular topologies to accommodate non-standard modifications remains a daunting task even for experienced users. To alleviate this issue, we created Gromologist, a utility library that provides the simulation community with a toolbox of primitive operations, as well as useful repetitive procedures identified during years of research. The library has been developed in response to users’ feedback, and will continue to grow to include more use cases, thorough automatic testing and support for a broader spectrum of rare features. The program is available at gitlab.com/KomBioMol/gromologist and via Python’s pip.

Cytowania

  • 0

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 0

    Scopus

Cytuj jako

Pełna treść

pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuły w czasopismach
Opublikowano w:
SoftwareX nr 30,
ISSN:
Język:
angielski
Rok wydania:
2025
Opis bibliograficzny:
Wieczór M., Czub J., Orozco M.: Gromologist: A GROMACS-oriented utility library for structure and topology manipulation// SoftwareX -,iss. 30 (2025), s.102118-102118
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1016/j.softx.2025.102118
Źródła finansowania:
  • IDUB
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 0 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi