Wyszukiwarka
Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period.
Abstrakt
Analiza genetyki populacji i określenie powiązań filogenetycznych pomiędzy szczepami może być niezwykle użytecznym podejściem w określaniu rozprzestrzeniania się wzorów genetycznych różnych gatunków bakterii na potrzeby epidemiologiczne. Nie ma danych, które opisywałyby długoterminowe sytuacje epidemiologiczne powodowane przez wielolekooporne, oportunistyczne szczepy Klebsiella oxytoca metodami molekularnymi. Celem przedstawionych badań była ocena różnorodności genetycznej szczepów K. oxytoca izolowanych przez ponad 50 lat z wykorzystaniem metod genetycznych ITS-PCR i PCR MP dla dużej kolekcji szczepów pozyskiwanych od pacjentów z kilku szpitali w Polsce. Analiza filogenetyczna oparta na ITS-PCR wyodrębniła sześć odrębnych grup. Zidentyfikowano dwie główne grupy Kox i KoY, odpowiednio z czterema i dwiema podgrupami wewnątrz Kox i KoY. Typowanie z zastosowaniem metody PCR MP wykazało wyższy poziom różnorodności genetycznej. Jednak wszystkie szczepy K. oxytoca były również podzielone na sześć grup genotypowych (KoA, KoB, KoC, koD, KoE i KoF). Podsumowując, możemy stwierdzić, że metody genotypowania ITS-PCR i PCR MP są przydatne w określeniu filogenetycznych relacji genetycznych K. oxytoca.
Autorzy (4)
-
Stanisław Kałużewski
Cytuj jako
Pełna treść
pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Opublikowano w:
-
EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES
nr 28,
strony 1263 - 1266,
ISSN: 0934-9723 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2009
- Opis bibliograficzny:
- Stojowska K., Krawczyk B., Kałużewski S., Kur J.: Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period. // EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES. -Vol. 28, nr. iss. 10 (2009), s.1263-1266
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 113 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
- B. Krawczyk,
- J. Leibner-Ciszak,
- A. Mielech
- + 2 autorów
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
- J. Leibner-Ciszak,
- A. Dobrowolska,
- B. Krawczyk
- + 2 autorów
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
- B. Krawczyk,
- J. Leibner,
- A. Samet
- + 1 autorów