Wyszukiwarka
Abstrakt
Single-stranded DNA (ssDNA) is an important intermediate generated during various cellular DNA transactions, primarily during long-patch base excision repair. When displaced by DNA polymerase during strand displacement DNA synthesis, ssDNA forms 5′ overhangs (flaps) that are either cleaved by DNA nucleases or protected from degradation upon binding of single-stranded DNA-binding proteins (SSB). Several nucleases are involved in the removal of ssDNA flaps in human mitochondria, namely the endonucleases FEN1 and DNA2, as well as the exonuclease MGME1. In this study, we show that another mitochondrial nuclease, EXOG, cleaves DNA flaps in both free and SSB-protected forms. We established that the presence of the Wing domain in EXOG structure provides additional binding site for ssDNA and 5′ flaps irrespective of monovalent salt concentration. Importantly, DNA flap cleavage by EXOG is compatible with the activity of other mitochondrial enzymes involved in DNA replication/repair, e.g. mtSSB, Pol γ, and Lig III, as we were able to reconstitute a multistep reaction of DNA synthesis, flap removal, and nick ligation. Our findings highlight the versatile role of EXOG in maintaining mitochondrial DNA integrity, expanding its DNA processing repertoire to include ssDNA flap removal.
Cytowania
-
0
CrossRef
-
0
Web of Science
-
0
Scopus
Autorzy (6)
-
Anna Karłowicz
-
Andrzej B. Dubiel
-
Marta Wyszkowska
-
-
Michał R. Szymański
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1093/nar/gkaf099
- Licencja
-
otwiera się w nowej karcie
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuły w czasopismach
- Opublikowano w:
-
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
nr 53,
strony 1 - 16,
ISSN: 0305-1048 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2025
- Opis bibliograficzny:
- Karłowicz A., Dubiel A., Wyszkowska M., Hossain K. A., Czub J.: Mitochondrial exonuclease EXOG supports DNA integrity by the removal of single-stranded DNA flaps// NUCLEIC ACIDS RESEARCH -,iss. 53 (2025), s.gkaf09-
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1093/nar/gkaf099
- Źródła finansowania:
-
- Publikacja bezkosztowa
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 2 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
Novel single-stranded DNA-binding proteins from extreme psychrophilic bacterium Psychromonas ingrahamii 37
- M. Olszewski,
- M. Nowak,
- N. Maciejewska
- + 1 autorów