Search
Filters
total: 124
Best results in : Research Potential Pokaż wszystkie wyniki (97)
Search results for: COARSE-GRAINED SIMULATION
-
Architektura Systemów Komputerowych
Research PotentialGłówną tematyką badawczą podejmowaną w Katedrze jest rozwój architektury aplikacji i systemów komputerowych, w szczególności aplikacji i systemów równoległych i rozproszonych. "Architecture starts when you carefully put two bricks together" - stwierdza niemiecki architekt Ludwig Mies von der Rohe. W przypadku systemów komputerowych dotyczy to nie cegieł, a modułów sprzętowych lub programowych. Przez architekturę systemu komputerowego...
-
Katedra Geotechniki, Geologii i Budownictwa Morskiego
Research Potential* badania teoretyczne i doświadczalne oraz analizy numeryczne w Mechanice Gruntów; * badania laboratoryjne i polowe gruntów; * metody wzmacniania podłoża gruntowego; * “zieloną geotechnikę” z zastosowaniem ekologicznych materiałów, technologii i zagospodarowaniem produktów ubocznych; * badania teoretyczne, doświadczalne oraz zagadnienia praktyczne fundamentowania w odniesieniu do fundamentów bezpośrednich i głębokich, tunelowania,...
-
Katedra Technologii Leków i Biochemii
Research PotentialRacjonalne projektowanie, synteza i badanie właściwości biologicznych nowych związków o działaniu przeciwnowotworowym lub przeciwgrzybowym
Best results in : Business Offer Pokaż wszystkie wyniki (27)
Search results for: COARSE-GRAINED SIMULATION
-
Superkomputer Tryton
Business OfferObliczenia dużej skali, Wirtualna infrastruktura w chmurze (IaaS), Analiza danych (big data)
-
Laboratorium Badań Drogowych
Business Offer -
Środowiskowe Laboratorium Technologii Bezprzewodowych
Business OfferŚrodowiskowe Laboratorium Technologii Bezprzewodowych powstało w ramach realizacji projektu CZT Centrum Zaawansowanych Technologii POMORZE i mieści się w Katedrze Inżynierii Mikrofalowej i Antenowej na Wydziale Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki Politechniki Gdańskiej. Laboratorium zostało wyposażone w specjalistyczne zaplecze aparaturowe, które w połączeniu z kompetencjami naukowymi i technologicznymi kadry pozwala na...
Other results Pokaż wszystkie wyniki (2024)
Search results for: COARSE-GRAINED SIMULATION
-
Coarse-grained simulation - an efficient approach for studying motions of large proteins
PublicationOne of the most important challenges in performing Molecular Dynamics (MD) simulations of large protein complexes is to accommodate the model accuracy and the simulation timescale. Hitherto, for the most relevant dynamics of protein aggregates in an explicit aqueous environment, the timescale reachable for the all-atoms simulations is of hundreds of nanoseconds. This range is four to six orders of magnitude smaller than processes...
-
Local and long range potentials for heparin‐protein systems for coarse‐grained simulations
Publication -
Optimization of parallel implementation of UNRES package for coarse‐grained simulations to treat large proteins
PublicationWe report major algorithmic improvements of the UNRES package for physics-based coarse-grained simulations of proteins. These include (i) introduction of interaction lists to optimize computations, (ii) transforming the inertia matrix to a pentadiagonal form to reduce computing and memory requirements, (iii) removing explicit angles and dihedral angles from energy expressions and recoding the most time-consuming energy/force terms...
-
UNRES server for physics-based coarse-grained simulations and prediction of protein structure, dynamics and thermodynamics
Publication -
UNRES-GPU for Physics-Based Coarse-Grained Simulations of Protein Systems at Biological Time- and Size-Scales
PublicationThe dynamics of the virus like particles (VLPs) corresponding to the GII.4 Houston, GII.2 SMV, and GI.1 Norwalk strains of human noroviruses (HuNoV) that cause gastroenteritis was investigated by means of long-time (about 30 μs in the laboratory timescale) molecular dynamics simulations with the coarse-grained UNRES force field. The main motion of VLP units turned out to be the bending at the junction between the P1 subdomain (that...