Filters
total: 7
Best results in : Research Potential Pokaż wszystkie wyniki (6)
Search results for: DIHEDRAL ANGLES
-
Katedry Chemii Organicznej
Research PotentialSynteza nowych związków organicznych w szczególności posiadających aktywność biologiczną. Opracowywanie i sprawdzanie w praktyce nowych metod syntezy związków organicznych. Inżynieria kryształów oraz zastosowanie dichroizmu kołowego. Badanie czynności optycznej związków konfiguracyjnie labilnych.
-
Katedra Chemii Nieorganicznej
Research Potential* Opracowanie nowych metod syntezy nieorganicznej, odkrycie nowych typów reaktywności oraz katalizatorów użytecznych w ważnych procesach chemicznych. Badania koncentrują się wokół chemii kompleksów metali przejściowych z ligandami P-donorowymi oraz chemii pierwiastków grup głównych ze szczególnym uwzględnieniem fosforu i boru – aktualne kierunki badań: -reaktywne związki niskowalencyjnego fosforu – podobnie jak kompleksy karbenowe...
-
Zespół Katedry Fizyki Atomowej, Molekularnej i Optycznej
Research PotentialKatedra Fizyki Atomowej, Molekularnej i Optycznej specjalizuje się w badaniach naukowych w zakresie: * fizyki zderzeń elektronowych * teoretycznej fizyki atomowej i molekularnej * doświadczalnej optyki kryształów
Best results in : Business Offer Pokaż wszystkie wyniki (1)
Search results for: DIHEDRAL ANGLES
-
Superkomputer Tryton
Business OfferObliczenia dużej skali, Wirtualna infrastruktura w chmurze (IaaS), Analiza danych (big data)
Other results Pokaż wszystkie wyniki (7)
Search results for: DIHEDRAL ANGLES
-
Optimization of parallel implementation of UNRES package for coarse‐grained simulations to treat large proteins
PublicationWe report major algorithmic improvements of the UNRES package for physics-based coarse-grained simulations of proteins. These include (i) introduction of interaction lists to optimize computations, (ii) transforming the inertia matrix to a pentadiagonal form to reduce computing and memory requirements, (iii) removing explicit angles and dihedral angles from energy expressions and recoding the most time-consuming energy/force terms...
-
Effect of Ion and Binding Site on the Conformation of Chosen Glycosaminoglycans at the Albumin Surface
PublicationAlbumin is one of the major components of synovial fluid. Due to its negative surface charge, it plays an essential role in many physiological processes, including the ability to form molecular complexes. In addition, glycosaminoglycans such as hyaluronic acid and chondroitin sulfate are crucial components of synovial fluid involved in the boundary lubrication regime. This study presents the influence of Na+, Mg2+ and Ca2+ ions...
-
ortho-Fluorobenzanilides and ortho-fluorothiobenzanilides: Molecular conformations and crystal packing
PublicationSeries of 2-fluoro and 2,6-difluorobenzanilides and their thiobenzanilide analogs have been synthesized to investigate the influence of the fluorine atom on their crystal structures and self-assembly in the crystal lattice. The X-ray analysis of the single crystal revealed that the synthesized molecules adopt a geometry being deflected from planarity. The deflection was investigated by analysis of dihedral angles between mean planes...
-
Changes of Conformation in Albumin with Temperature by Molecular Dynamics Simulations
PublicationThis work presents the analysis of the conformation of albumin in the temperature range of 300K – 312K, i.e., in the physiological range. Using molecular dynamics simulations, we calculate values of the backbone and dihedral angles for this molecule. We analyze the global dynamic properties of albumin treated as a chain. In this range of temperature, we study parameters of the molecule and the conformational entropy derived from...
-
Geometry optimization of steroid sulfatase inhibitors - the influence on the free binding energy with STS
PublicationIn the paper we review the application of two techniques (molecular mechanics and quantum mechanics) to study the influence of geometry optimization of the steroid sulfatase inhibitors on the values of descriptors coded their chemical structure and their free binding energy with the STS protein. We selected 22 STS-inhibitors and compared their structures optimized with MM+, PM7 and DFT B3LYP/6–31++G* approaches considering separately...