Filters
total: 157
Best results in : Research Potential Pokaż wszystkie wyniki (110)
Search results for: PROTEIN-STRUCTURE MODELING, COARSE GRAINING, UNRES MODEL OF POLYPEPTIDE CHAINS, MOLECULAR DYNAMICS, DATA-ASSISTED SIMULATIONS
-
KatedrA Chemii Fizycznej
Research Potential1.Termodynamika i struktura roztworów, oddziaływania międzycząsteczkowe w roztworach - badania termodynamiczne, spektroskopowe i teoretyczne. 2. Fizykochemiczne podstawy analizy środowiskowej.
-
Zespół Algorytmów i Modelowania Systemów
Research PotentialStudiowanie problemów i modeli teoriografowych ma na celu badanie złożoności obliczeniowej uogólnień problemu klasycznego kolorowania wierzchołków i krawędzi grafu znajdujących zastosowania w modelowaniu praktycznych problemów oraz badanie nowych miar oceny skuteczności algorytmów. W zakresie szeregowania zadań badania koncentrują się na konstrukcji harmonogramów optymalnych z punktu widzenia długości harmonogramu i średniego czasu...
-
Katedra Technologii Leków i Biochemii
Research PotentialRacjonalne projektowanie, synteza i badanie właściwości biologicznych nowych związków o działaniu przeciwnowotworowym lub przeciwgrzybowym
Best results in : Business Offer Pokaż wszystkie wyniki (47)
Search results for: PROTEIN-STRUCTURE MODELING, COARSE GRAINING, UNRES MODEL OF POLYPEPTIDE CHAINS, MOLECULAR DYNAMICS, DATA-ASSISTED SIMULATIONS
-
Superkomputer Tryton
Business OfferObliczenia dużej skali, Wirtualna infrastruktura w chmurze (IaaS), Analiza danych (big data)
-
Laboratorium Syntezy Innowacyjnych Materiałów i Elementów
Business OfferZespół specjalistycznych urządzeń pozwala dokonywać syntezy diamentu mikro- i nanokrystalicznego oraz diamentu domieszkowanego borem i azotem do zastosowań w optoelektronice oraz nanosensoryce. Domieszkowany borem nanodiament (BDD) jest obecnie najwydajniejszym materiałem półprzewodnikowym do zastosowania w wytwarzaniu biosensorów elektrochemicznych. Laboratorium może otrzymywać ciągłe cienkie polikrystaliczne, domieszkowane elektrody...
-
Laboratorium Materiałów Polimerowych
Business OfferLaboratorium jest wyposażone w:; • plastometr do badań wskaźnika szybkości płynięcia uplastycznionego tworzywa, ; • młot do badań udarności materiałów, ; • wtryskarkę hydrauliczną z urządzeniami peryferyjnymi wymaganymi do uruchomienia produkcji znormalizowanych próbek do badań wytrzymałościowych,; • zestaw urządzeń przetwórczo - pomiarowych;
Other results Pokaż wszystkie wyniki (19479)
Search results for: PROTEIN-STRUCTURE MODELING, COARSE GRAINING, UNRES MODEL OF POLYPEPTIDE CHAINS, MOLECULAR DYNAMICS, DATA-ASSISTED SIMULATIONS
-
Improvements and new functionalities of UNRES server for coarse-grained modeling of protein structure, dynamics, and interactions
PublicationIn this paper we report the improvements and extensions of the UNRES server (https://unres-server.chem.ug.edu.pl) for physics-based simulations with the coarse-grained UNRES model of polypeptide chains. The improvements include the replacement of the old code with the recently optimized one and adding the recent scale-consistent variant of the UNRES force field, which performs better in the modeling of proteins with the β and the...
-
UNRES server for physics-based coarse-grained simulations and prediction of protein structure, dynamics and thermodynamics
Publication -
Investigation of Protein Folding by Coarse-Grained Molecular Dynamics with the UNRES Force Field
Publication -
Implementation of Molecular Dynamics and Its Extensions with the Coarse-Grained UNRES Force Field on Massively Parallel Systems: Toward Millisecond-Scale Simulations of Protein Structure, Dynamics, and Thermodynamics
Publication -
A coarse‐grained approach to NMR ‐data‐assisted modeling of protein structures
PublicationThe ESCASA algorithm for analytical estimation of proton positions from coarse-grained geometry developed in our recent work has been implemented in modeling protein structures with the highly coarse-grained UNRES model of polypeptide chains (two sites per residue) and nuclear magnetic resonance (NMR) data. A penalty function with the shape of intersecting gorges was applied to treat ambiguous distance restraints, which automatically...