Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.
Abstract
Zdolność do naprawy uszkodzeń DNA jest jednym z najważniejszych wyznaczników podatności na choroby nowotworowe. Dlatego też użytecznym staje się możliwość pomiaru stopnia naprawy DNA w próbkach materiału badawczego pobranego od ochotników. Celem pracy było, po pierwsze, opracowanie w warunkach in vitro prostej metody (z wykorzystaniem techniki testu kometowego), w której naprawa DNA odbywa się poprzez wycinanie nukleotydów (NER). Metoda ta po części przypomina mechanizm naprawy DNA przez wycięcie zasad (BER). Kolejnym zadaniem było przeprowadzenie tych dwóch testów z wykorzystaniem limfocytów (w formie ekstraktu, będącego źródłem czynników biorących udział w naprawie uszkodzonego DNA) pochodzących od zdrowych ochotników w celu określenia zróżnicowania stopnia naprawy uszkodzonego materiału genetycznego w obrębie próbek pobranych od jednego ochotnika w różnym czasie oraz pomiędzy ochotnikami. W teście z wykorzystaniem mechanizmu NER, w którym wymagana jest obecność jonów magnezu (lecz nie ATP), obserwowano znaczące uszkodzenia DNA (narażonego wcześniej na działanie promieni UV), który inkubowany był wraz z ekstraktem z limfocytów. Zauważono korelacje pomiędzy stopniem uszkodzenia DNA w różnych próbkach pochodzących od jednego ochotnika, zaś pomiędzy próbkami pobranymi od poszczególnych ochotników zaobserwowano znaczne różnice pomiędzy stopniem uszkodzenia DNA (zarówno dla mechanizmu BER, jak i dla NER). Testy z wykorzystaniem mechanizmów naprawy BER oraz NER są łatwe do przeprowadzenia, oraz, co więcej, mogą dostarczać cennych informacji w badaniach epidemiologicznych na poziomie molekularnym, w których niestabilność DNA odgrywa kluczową rolę.
Authors (5)
Cite as
Full text
full text is not available in portal
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Published in:
-
CELL BIOLOGY AND TOXICOLOGY
no. 25,
pages 45 - 52,
ISSN: 0742-2091 - Language:
- English
- Publication year:
- 2009
- Bibliographic description:
- Gaivao I., Piasek A., Brevik A., Shaposhnikov S., Collins A.: Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.// CELL BIOLOGY AND TOXICOLOGY. -Vol. 25, nr. nr 1 (2009), s.45-52
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 123 times
Recommended for you
Diagnostic PCR tests for Microsporum audouinii, M. canis and Trichophyton infections
- A. Brillowska-Dąbrowska,
- A. Świerkowska,
- D. M. Saunte
- + 1 authors
The influence of fresh cabbage and sauerkraut juices on the activity of protective enzymes in human cell lines
- A. Śmiechowska,
- A. Piasek,
- K. Czapiewska
- + 3 authors