Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.

Sławomir Milewski; Agnieszka Janiak; Julia Nowak; Marek Wojciechowski

Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.

Abstract

Struktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne ich oddziaływania z syntazą GlcN-6-P z Candida albicans oraz izomerazą Glc-6-P z drożdży piekarniczych. Zgodnie z przewidywaniami wynikającymi z modelowania molekularnego, 2-amino-2-deoksy-D-mannitolo-6-P okazał się najsilniejszym inhibitorem syntazy GlcN-6-P. Określono elementy struktury szczególnie istotne dla aktywności inhibicyjnej badanych związków wobec obu modelowych enzymów.

Authors (4)

Sławomir Milewski prof. dr hab. inż.
- Faculty of Chemistry
- Gdańsk University of Technology
Agnieszka Janiak
- Faculty of Chemistry
- Gdańsk University of Technology
Julia Nowak
- Faculty of Chemistry
- Gdańsk University of Technology
Marek Wojciechowski dr hab. inż.
- Faculty of Chemistry
- Gdańsk University of Technology

Cite as

Full text

full text is not available in portal

Keywords

Details

Category:: Articles
Type:: artykuł w czasopiśmie z listy filadelfijskiej
Language:: English
Publication year:: 2004
Bibliographic description:: Milewski S., Szajowska A., Nowak J., Wojciechowski M.: Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.// . -., (2004),
Verified by:: Gdańsk University of Technology